《神秘海域：失落的遺產》原本是要作為《神秘海域 4》的劇情 DLC 推出，不過由於內容份量實在太大，官方於是決定以獨立外傳作品的形式推出，玩家購買這次的外傳後不需要 4 代的遊戲本體就可以直接遊玩。由於外傳採用了之前沒有詳細交代過出身背景的「克洛伊」作為主角，讓沒接觸過的玩家也能簡單融入劇情發展之中，不必煩惱沒有舊作遊戲經驗會難以銜接劇情。
《神秘海域：失落的遺產》的劇情，描述曾在二代劇情中登場，曾經是德雷克的女友，同時具有寶藏獵人與盜賊等多重身份的女性「克洛伊」，為了追尋古印度傳說中的秘寶「象神之牙」而來到了印度。由於尋寶的關鍵鑰匙掌握在當地一位殘暴的軍閥「阿薩夫」手上，所以克洛伊請到了剽悍的元傭兵團首領「娜汀」作為夥伴兼打手。
雖然克洛伊與娜汀在這次任務攜手合作，但並不代表兩人一開始便完全信賴對方，最初只是出於利益上的結合，克洛伊基於各種複雜的原因想要找到寶藏，而失去了自己傭兵團的娜汀則是需要錢來重整旗鼓。
正當兩人都以為能夠輕鬆順利的從軍閥的基地摸走秘寶鑰匙之際….
《神秘海域：失落的遺產》將整體內容比重作了相當平衡的分配－「探索秘境」、「動作解謎」和「槍戰」大約各佔三分之一，簡而言之就是濃縮了所有《神秘海域》系列玩家喜愛的要素，再刪去瑣碎的日常劇情。不只有更刺激的打鬥場景、更加廣闊的地圖與更高的自由度，遊戲在說敘述劇情與角色描寫的手法上又更進一步，玩家可以從兩位女性主角在冒險過程的互動中體會她們的心境轉折，並且發掘出更多她們背後的故事。
在系統方面，《神秘海域：失落的遺產》與本傳並沒有什麼太大的變化，其中最特別的部份是為了凸顯克洛伊兼具寶藏獵人與盜賊的身分，所特別加入全新的「開鎖」要素。克洛伊可以透過開鎖技巧來解開冒險途中發現的儲物箱，取得其中的武器彈藥等資源。同時玩家也有機會取得前作所沒有的「消音手槍」，遠距無聲殺敵的能力，讓玩家在遊戲中能採取更為多元的戰術運用。
先前系列作的冒險舞臺有時候會橫跨好幾個國家，但這次因為篇幅較短，所以完全集中在印度一地，不過單是印度一地也有許多不同的景觀，如都市、寺廟、叢林、遺蹟等，地理景觀的變化很大。而《神秘海域：失落的遺產》不僅有著系列最大的單一可探索區域，更繼承了《神秘海域 4》中「半開放式」的探險玩法。而在某些章節裡，玩家有機會駕駛吉普車，自由探索廣大的地圖。
半開放地圖的設計讓玩家能自由選擇路徑，難度看似提高，卻能帶來更貼近真實尋寶的樂趣。遊戲中有著 100 項寶物可供收集。在探索地圖時，記得留意各種角落、縫隙，說不定「喝薩拉」的秘寶文物就藏在其中。
尤其要留意在西高止山脈中的 11 個「喝薩拉標記」。它們不但都與喝薩拉王朝背後的故事有關，全數收集到這些標記時，更會獲得讓你的遊玩過程更有利的獨特寶物。