韓國外交部3月6日對日本「禁止入境」措施表示，此舉令人極為遺憾，政府正在考慮採取一切可用的相應措施。
日本首相安倍晉三3月5日傍晚在新冠肺炎傳染病對策總部會議上表示，將要求從中國和韓國入境日本的人員在日本政府指定設施隔離兩周。
據韓聯社3月6日上午報導，韓國外交部當天上午向媒體群發簡訊稱，儘管韓方多次呼籲日方慎重考慮進一步措施，日方仍在事前沒有充分協商的情況下採取這種不合理的過分措施，韓方感到極為遺憾，並強烈敦促日方立即重新審視這一措施。
據報導，韓國外交部將日本的措施界定為「禁止入境措施」，並於5日夜間約見日本大使館總括公使相馬弘尚聽取有關說明，當天還將召見日本駐韓大使富田浩司再度表示遺憾並提出抗議。
韓國外交部稱，韓國正在集中全政府力量防止新冠肺炎疫情蔓延，韓國優秀的檢測診斷能力和積極透明的防疫努力舉世公認，鑑於日方在防疫成果顯現之際採取這一措施，韓方不能不懷疑其是否另有所圖。
在被問及是否會採取將日本劃入病毒汙染區及提高赴日旅行預警等相應措施時，韓國外交部強調，政府最優先考慮國民的健康和安全，正在考慮採取一切可用措施。
據路透社報導，對於韓國政府的抗議，日本政府辯稱，針對中國和韓國遊客實施的更嚴格的旅行新限制，有助於減緩新冠肺炎疫情蔓延，現在實行還為時不晚。
「針對其他國家的情況和其他措施的效果進行全面評估後，我們做出了這一決定。」日本內閣官房長官菅義偉3月6日在記者會上表示，「我認為這個時機很合適。」
據日本共同社3月5日晚間報導，這一措施將從3月9日起實施到3月底。報導援引日本政府相關人士稱，這一措施的對象還包括在當地逗留過的日本人。此外，也將暫停已向中韓公民發放的籤證效力。
不過，共同社3月6日上午報導，日本厚生勞動相加藤勝信在內閣會議後的記者會上表示，這一措施不是依據《檢疫法》的措施，對中韓兩國入境者隔離兩周的要求不具強制力。