西南醫院康復理療科成立於1953年，在50餘年的發展中取得了長足的進步和發展：
·2005年被授予中國人民解放軍創傷康復疾病治療中心。
·2005年成為重慶市工傷康復定點(授權)醫療機構。
·2003年被授予第三軍醫大學康復醫學專科中心。
·2002年被授予重慶市殘疾人肢體傷殘康復技術指導中心。
·1993年成為國內第一個康復理療學專業博士授權學科。
·1986年成為康復理療學專業碩士授權學科。
2000年投資引進世界上最先進的德國奧託博克（Otto Bock）設備並進行技術合作，在全國綜合性醫院中率先開展假肢矯形器的研製、裝配及臨床應用。成立假肢矯形器中心（隸屬於康復中心），實現了殘肢康復、假肢裝配和假肢裝配後康復訓練的一條龍服務。目前科室床位50張，技術人員50餘人，學科規模及綜合技術力量居西南地區及軍內領先，在全國乃至國際物理與康復學界享有較高聲譽。
中心每年較好地完成軍醫大學各層次的康復醫學的教學任務以及對全軍、全國各地的進修人員進行培養，2003年被醫院評為先進教學集體。已培養博士10名，碩士生26名。其中大多數已成為軍內各大單位本學科的學術帶頭人。主編、參編專著20餘部，發表論文300餘篇，獲國家自然科學基金資助3項，獲省部級、軍隊科技成果獎2項。2005年曾榮獲第三軍醫大學集體三等功。
中心技術實力雄厚，擁有專業技術人員50餘名。其中教授、副教授5人，康復醫師13人，康復治療師22人，假肢製作師4人，臨床護士12人。全部康復治療師都接受過系統、高水平的規範培訓，部分人員接受境外研修學習。