《使徒行者2》來到結局篇，劇情進入白熱化階段，高潮迭起，務求看到觀眾連抖氣位都搵不到！
宣萱決意離開陳豪
「Scarlett」宣萱與「魏德信」陳豪雖然一起經歷過生死，但宣萱卻因為覺得這種驚險的生活並非她所追求的，因此向陳豪告別，更謂：「男女之間，曖昧系最靚嘅，就等我哋留喺最美麗嘅一刻。」令人感到唏噓。另一方面，「樂少」周柏豪設計引「Madam Cheung」蔣祖曼中伏，雖然成功槍殺蔣祖曼，但亦令自己身受重傷，更遭黑白兩道通緝而被逼到寵物診所做手術。到「卓Sir」苗僑偉到場為其解圍時，周柏豪就和盤託出其真正身份，指自己只是假扮臥底，查出幕後黑警為其臥底亡兄報仇！
幕後大黑警揭盅
當周柏豪藏身在秘密地點養傷時，「長興」一班人卻找上門打算殺他，好在「天堂哥」袁偉豪暗藏小隊中，更將手槍交給周柏豪讓對方殺出重圍。當陳豪左右手「大輝」林景弘打算一槍打死周柏豪時，袁偉豪就開槍阻止並自揭臥底身份，而周柏豪更不留活口殺死林景弘。至於「許Sir」鄧梓峰亦私下約陳豪對話，更指自己會為女友蔣祖曼報仇，向觀眾自爆幕後大黑警身份。
苗僑偉捉出鬼頭仔
鄧梓峰飾演的黑警許啟發，向陳豪飾演的魏德信施壓，誓要剷除周柏豪飾演的樂少鋒。苗僑偉飾演的卓凱則要捉洩露樂少鋒行蹤的內鬼，並向楊潮凱飾演的速龍暗示，懷疑喬寶寶飾演的娛樂城有嫌疑，速龍跟蹤娛樂城，目睹他與可疑人物交收巨額款項，速龍拍下證據，再用繩勒住娛樂城的頸，想殺人滅口，危急關頭卓凱出現，以槍指住速龍，表示早已識穿他是內鬼，速龍自爆在泰國殺害一眾臥底的理由，並趁機向卓凱施襲，娛樂城腳部受傷，卓凱不肯丟下手足，只能眼白白看著速龍逃脫。
宣萱慘被脅作籌碼
此外，宣萱飾演的Scarlett欲離開洗黑錢集團，離開香港，但被魏德信截住，原來黑錢集團之前已在Scarlett腦中放入微型爆炸裝置，隨時可以炸死她，用以牽制魏德信。Scarlett向卓凱哭訴自覺是昔日害人的報應，並慨嘆自己像被囚在籠中，由當日走入這個籠開始，已經失去自由。
鄧梓峰身份曝光
身為黑警的「Madam Cheung」蔣祖曼被殺後，其黑警男友鄧梓峰往探望蔣祖曼母親馮素波，企圖試探二人身份及種種犯罪證據是否已曝光，鄧梓峰離去時馮素波竟識穿當日其小混混身份，鄧梓峰隨即執起生果刀殺人滅口！「樂少」周柏豪復修蔣祖曼的手機，知道對方死前當天與鄧梓峰一直保持聯絡，成功推測對方是蔣祖曼背後的大黑警，故將實情告訴「歡喜哥」許紹雄。許即往要脅鄧梓峰與他合作對付「魏德信」陳豪，此時陳豪向國際犯罪集團骨幹泰臣引薦另一黑警「速龍」楊潮凱。
李焯寧命懸一線
原本是洗黑錢集團主腦之一的「梁斯敏」李焯寧原來患上末期癌症，不惜向「卓凱」苗僑偉自揭其臥底身份，並表示自己收藏了引爆宣萱腦內微型炸爆的引爆器於診所內，當她登門欲取回引爆器時，卻遭一早潛伏在內的楊潮凱用槍指向頭部……
陳豪成功打動宣萱
陳豪取回宣萱的引爆器，並找人修復至按下便能停止引爆，而為怕失去宣萱，陳豪於餐廳拿出戒指向她求婚，宣萱卻以隨時有生命危險拒絕，但經陳豪一番深情剖白後宣萱有所動搖。「卓凱」苗僑偉發現許Sir手臂傷痕與古惑仔趙冠豪被黑社會家法執行家法時傷痕一樣，經「細批」、「娛樂城」等人調查過後，證實趙冠豪假冒真正的許Sir，亦是Madam Cheung的前男友、背後的大黑警。
周柏豪的最後約會
樂少準備殺死魏德信及許Sir前夕，心知隨時會死，以補祝生日理由帶淑梅去玩，實情與她說再見，臨別時更留下示愛密碼。大戰之日，撻Q被許Sir殺死，但最終樂少也把許Sir殺死。
袁偉豪親手射殺周柏豪
之後樂少被「魏德信」陳豪手下捉走，逼他說出臥底是誰。「魏德信」陳豪更命令「天堂哥」袁偉豪開槍殺死「樂少」周柏豪，使袁偉豪逼於無奈將子彈射向周柏豪腹部，之後周柏豪便撲到袁偉豪上欲意搶槍，期間袁偉豪便開槍打向周柏豪心臟，置對方死地，而陳豪亦信任袁偉豪非臥底。之後，「卓Sir」苗僑偉向「阿梅」黃翠如通知周柏豪的死訊，令黃翠如傷心喊爆，不停怪責周柏豪掉低自己離開，到黃翠如找袁偉豪質問時，袁偉豪便承認自己親手開槍打死周柏豪，搞到黃翠如喊住喪摑袁偉豪，亦令袁偉豪非常內疚。
周柏豪壯烈犧牲
不過，好快袁偉豪就向苗僑偉坦白，指當時忍不到心開槍射殺自己同僚，僅開槍射他腹部，但他與周柏豪就曾經約定過若事情發展到如此地步時要千萬不能留手，所以當時周柏豪就撲上前扮搶槍，實是親自按下扳機向自己心臟開槍「補飛」。偷聽到事情真相的黃翠如之後便攬住周柏豪的頭盔爆喊，但慢慢可以釋懷，更安慰自己及袁偉豪，指周柏豪是為保護他們兩人而死，場面令人心酸。
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