1998年出道，被稱為「新宿系」歌姬，因其歌曲中展現著物慾橫流的新宿生活。如她所言，「新宿的人們帶著社會的惡臭，自我厭惡的同時又拼命掙扎著要生存下去，想追尋到那種看不到的真實」。那時她的音樂風格主要以另類流行與搖滾為主，尖銳的吶喊像是某種刻意吶喊出的噪音，反抗著世界的黑暗與人性的醜陋。
但椎名林檎後來的音樂則逐漸展露出古典音樂與爵士樂的根基，尤其自第三張專輯『加爾基 精液 慄ノ花』開始明顯地表現出爵士樂的影響。
自此，椎名林檎的音樂開始走向後期最為顯著的fusion風格，任何雜亂的風格元素在她的fusion思維中都能夠彼此融合，如調色盤一般呈現出她想要的色彩，紛繁多變，她像個肆意潑墨的藝術家，遊走於搖滾、爵士、流行、古典、電子之間。
這種音樂上的自由度與寬容度使她走出了一條特別的藝術道路，這種風格某種意義上來說又極度日本——獨特、邊緣化、看似詭異怪誕，內裡又有強悍的技術支撐。
但椎名林檎的音樂最具魅力的地方還不在此處。她光怪陸離的音樂表象之下，還有著極為深刻、包羅萬象的內涵。
最新發行的《三毒史》是她文本概念上的巔峰之作。
「三毒史」，即封面上椎名林檎的形象，是一個天馬形態的妖怪。所謂「三毒」，即貪、嗔、痴，屬於佛教對人類痛苦根源的總結。
開場曲《鶏と蛇と豚》（雞和蛇和豬）即分別代表貪、嗔、痴。在《鶏と蛇と豚》的MV裡，展現了三毒史召集三毒，整個東京被黑霧籠罩，新宿之眼熄滅，三毒在不同的區域展開活動，蠱惑東京的市民，使其趨於癲狂。
細聽這首歌也很有意思，開場是佛經的念誦，古典氣勢的壓迫感讓人想到她的《Gamble》，她操著經電音扭曲後的聲音歌唱著人心底的貪嗔痴，是一首精彩而充滿懸念的序曲。
其後專輯就此主題正式展開。包羅萬象的曲風、包羅萬象的主題全被「三毒」這人世間的罪惡之源所概括了。她情緒即三毒的化身，散射成一張專輯裡激烈張狂的表達。
從音樂、視覺二方面來看這張專輯，都能找到豐富的趣味。
音樂上，專輯統一在椎名林檎多樣而絢爛的fusion視角之中。13首歌中包含了6首合作曲目。《獣ゆく細道》和宮本浩次合作，華美的弦樂與管樂交織下，有種big band jazz的旖旎華麗。《マ・シェリ》同樣爵士風味濃厚，旋律動聽而偏向抒情。《駆け落ち者》與櫻井敦司合作了一首另類搖滾，能聽到比約克式的神經質節奏實驗。《どん底まで》仿佛回到早期的她那種利落乾脆的搖滾風格。《神様、仏様》與向井秀徳合作，同樣是獨立搖滾風格。《ＴＯＫＹＯ》又回到fusion風格，《長く短い祭》有fusion也有流行風味，《至上の人生》和《急がば回れ》玩的是經典搖滾，《ジユーダム》是俏皮可愛的pop風，《目抜き通り》回到華麗的jazz fusion，最後以《あの世の門》莊重的古典哥特風結尾。
視覺上，《獣ゆく細道》裡呈現了一個陰暗隧道中，一位落魄男子情緒逐漸失控產生幻覺的場景，代表嗔欲。
《長く短い祭》則表達貪慾——一女子因為對丈夫的佔有欲而將其殺害，在公園狂舞后被警察帶走。
《神様、仏様》裡，兩名高僧追捕「三毒史」，最後三毒史從高空處一躍而下，留下身穿的和服，自身化為虛空。
在視覺的呈現上，《三毒史》也有著統一的獨特美感，瀰漫著強烈的現實關懷與隱喻。
這就是她眼中的東京，這就是她眼中的日本。
嘗試解讀的話，可以說專輯的意圖或許是借「三毒」的主題表達世界的種種亂象，與人們的瘋癲、欲望。但封面的梵文字樣、《鶏と蛇と豚》和《神様、仏様》MV中出現的字樣，意為「色即是空」。最終，椎名林檎表達這些「惡」或許意在呈現出其荒謬之後，使人們明白痴迷三毒不過虛幻一場。
專輯以佛教典故為外殼，濃烈的現實關懷為內核，輔以多元而充滿創新、流動意義的音樂元素融合，呈現出了唯有椎名林檎才能做出的精彩音樂。她足夠獨特、足夠深刻、足夠標誌性。其意義已經超越了音樂本身，是真正的日本文化ICON。