如是我聞：一時，薄伽梵，遊化諸國，至廣嚴城，住樂音樹下，與大苾芻眾八千人俱，菩薩摩訶薩三萬六千，及國王、大臣、婆羅門、居士、天龍八部、人非人等，無量大眾，恭敬圍繞，而為說法。
爾時，曼殊室利法王子，承佛威神，從座而起，偏袒一肩，右膝著地，向薄伽梵曲躬合掌。白言：世尊．唯願演說如是相類諸佛名號，及本大願，殊勝功德；令諸聞者，業障消除，為欲利樂像法轉時，諸有情故。
爾時，世尊贊曼殊室利童子言：善哉！善哉！曼殊室利，汝以大悲勸請我說諸佛名號、本願功德，為拔業障所纏有情，利益安樂像法轉時諸有情故。汝今諦聽，極善思惟，當為汝說。
曼殊室利言：唯然，願說，我等樂聞。
佛告曼殊室利：東方去此，過十殑伽沙等佛土，有世界名淨琉璃，佛號藥師琉璃光如來、應正等覺、明行圓滿、善逝、世間解、無上士、調御丈夫、天人師、佛、薄伽梵。
曼殊室利！彼佛世尊藥師琉璃光如來本行菩薩道時，發十二大願，令諸有情，所求皆得。
第一大願：願我來世得阿耨多羅三藐三菩提時，自身光明熾然，照耀無量無數無邊世界。以三十二大丈夫相、八十隨形，莊嚴其身，令一切有情，如我無異。
第二大願：願我來世得菩提時，身如琉璃，內外明徹，淨無瑕穢，光明廣大，功德巍巍，身善安住，焰網莊嚴，過於日月；幽冥眾生，悉蒙開曉；隨意所趣，作諸事業。
第三大願：願我來世得菩提時．以無量無邊智慧方便，令諸有情皆得無盡所受用物，莫令眾生有所乏少。
第四大願：願我來世得菩提時，若諸有情行邪道者，悉令安住菩提道中；若行聲聞、獨覺乘者，皆以大乘而安立之。
第五大願：願我來世得菩提時，若有無量無邊有情，於我法中，修行梵行，一切皆令得不缺戒，具三聚戒；設有毀犯，聞我名已，還得清淨，不墮惡趣。
第六大願：願我來世得菩提時，若諸有情，其身下劣，諸根不具，醜陋頑愚，盲聾喑啞，攣躄背僂，白癩顛狂，種種病苦；聞我名已，一切皆得，端正黠慧，諸根完具，無諸疾苦。
第七大願：願我來世得菩提時，若諸有情，眾病逼切，無救無歸，無醫無藥，無親無家．貧窮多苦；我之名號，一經其耳，眾病悉除，身心安樂，家屬資具，悉皆豐足，乃至證得無上菩提。
第八大願：願我來世得菩提時，若有女人，為女百惡之所逼惱，極生厭離，願舍女身；聞我名已，一切皆得轉女成男，具丈夫相，乃至證得無上菩提。
第九大願：願我來世得菩提時，令諸有情，出魔罥網，解脫一切外道纏縛；若墮種種惡見稠林，皆當引攝，置於正見，漸令修習，諸菩薩行，速證無上正等菩提。
第十大願：願我來世得菩提時，若諸有情，王法所錄，繩縛鞭撻，系閉牢獄，或當刑戮，及餘無量災難凌辱，悲愁煎迫，身心受苦；若聞我名，以我福德威神力故，皆得解脫一切憂苦。
第十一大願：願我來世得菩提時，若諸有情，饑渴所惱，為求食故，造諸惡業；得聞我名，專念受持，我當先以上妙飲食，飽足其身，後以法味，畢竟安樂而建立之。
第十二大願：願我來世得菩提時，若諸有情，貧無衣服，蚊虻寒熱，晝夜逼惱；若聞我名，專念受持，如其所好，即得種種上妙衣服，亦得一切寶莊嚴具，華鬘塗香，鼓樂眾伎，隨心所玩，皆令滿足。
曼殊室利，是為彼世尊藥師琉璃光如來應正等覺，行菩薩道時，所發十二微妙上願。
複次，曼殊室利，彼世尊藥師琉璃光如來行菩薩道時，所發大願，及彼佛土功德莊嚴，我若一劫，若一劫餘，說不能盡。然彼佛土，一向清淨，無有女人，亦無惡趣，及苦音聲；琉璃為地，金繩界道，城闕，宮閣，軒窗，羅網，皆七寶成；亦如西方極樂世界，功德莊嚴，等無差別。於其國中，有二菩薩摩訶薩：一名日光遍照，二名月光遍照，是彼無量無數菩薩眾之上首，次補佛處，悉能持彼世尊藥師琉璃光如來正法寶藏 。是故曼殊室利，諸有信心善男子善女人等，應當願生彼佛世界。
爾時，世尊復告曼殊室利童子言：曼殊室利，有諸眾生，不識善惡，唯懷貪吝，不知布施及施果報，愚痴無智，闕於信根。多聚財寶，勤加守護。見乞者來，其心不喜。設不獲已，而行施時，如割身肉，深生痛惜。復有無量慳貪有情，積集資財，於其自身，尚不受用，何況能與父母、妻子、奴婢、作使，及來乞者。彼諸有情，從此命終，生餓鬼界或傍生趣。由昔人間，曾得暫聞藥師琉璃光如來名故，今在惡趣，暫得憶念彼如來名，即於念時，從彼處沒，還生人中，得宿命念，畏惡趣苦，不樂欲樂，好行惠施，讚嘆施者，一切所有，悉無貪惜，漸次尚能以頭目、手足、血肉、身分施來求者，況餘財物。
複次，曼殊室利，若諸有情，雖於如來受諸學處，而破尸羅。有雖不破尸羅，而破軌則。有於尸羅軌則，雖得不壞，然毀正見。有雖不毀正見，而棄多聞，於佛所說契經深義，不能解了。有雖多聞，而增上慢；由增上慢，覆蔽心故，自是非他，嫌謗正法，為魔伴黨。如是愚人，自行邪見，復令無量俱胝有情，墮大險坑。此諸有情，應於地獄、傍生、鬼趣流轉無窮。若得聞此藥師琉璃光如來名號，便舍惡行，修諸善法，不墮惡趣。設有不能舍諸惡行，修行善法，墮惡趣者，以彼如來本願威力，令其現前，暫聞名號，從彼命終，還生人趣，得正見精進，善調意樂，便能舍家，趣於非家，如來法中，受持學處，無有毀犯，正見多聞，解甚深義，離增上慢，不謗正法，不為魔伴，漸次修行諸菩薩行，速得圓滿。
複次，曼殊室利，若諸有情，慳貪嫉妒，自贊毀他，當墮三惡趣中，無量千歲，受諸劇苦。受劇苦已，從彼命終，來生人間，作牛馬駝驢，恆被鞭撻，饑渴逼惱，又常負重，隨路而行。或得為人，生居下賤，作人奴婢，受他驅役，恆不自在。若昔人中，曾聞世尊藥師琉璃光如來名號，由此善因，今復憶念，至心皈依，以佛神力，眾苦解脫；諸根聰利，智慧多聞，恆求勝法。常遇善友，永斷魔罥，破無明殼，竭煩惱河，解脫一切生老病死，憂愁苦惱。
複次，曼殊室利，若諸有情，好喜乖離，更相鬥訟，惱亂自他，以身語意，造作增長，種種惡業，輾轉常為不饒益事，互相謀害。告召山林樹冢等神，殺諸眾生．取其血肉，祭祀藥叉、羅剎婆等；書怨人名，作其形像，以惡咒術，而咒詛之。魘魅蠱道，咒起屍鬼，令斷彼命，及壞其身。是諸有情，若得聞此藥師琉璃光如來名號，彼諸惡事，悉不能害。一切輾轉，皆起慈心，利益安樂，無損惱意，及嫌恨心。各各歡悅，於自所受，生於喜足，不相侵凌，互為饒益。
複次，曼殊室利，若有四眾，苾芻，苾芻尼，鄔波索迦，鄔波斯迦，及餘淨信善男子、善女人等。有能受持八分齋戒，或經一年，或復三月，受持學處，以此善根，願生西方極樂世界，無量壽佛所， 聞正法，而未定者，若聞世尊藥師琉璃光如來名號，臨命終時，有八大菩薩，其名曰：文殊師利菩薩，觀世音菩薩，得大勢菩薩，無盡意菩薩，寶檀華菩薩，藥王菩薩，藥上菩薩，彌勒菩薩。是八大菩薩乘空而來，示其道路，即於彼界，種種雜色，眾寶華中，自然化生。或有因此，生於天上，雖生天上，而本善根，亦未窮盡，不復更生諸餘惡趣。天上壽盡，還生人間，或為輪王，統攝四洲，威德自在，安立無量百千有情於十善道。或生剎帝利、婆羅門、居士大家。多饒財寶，倉庫盈溢，形相端正，眷屬具足，聰明智慧，勇健威猛，如大力士。若是女人，得聞世尊藥師琉璃光如來名號，至心受持，於後不復更受女身。
複次，曼殊室利，彼藥師琉璃光如來得菩提時，由本願力，觀諸有情，遇眾病苦，瘦攣、幹消、黃熱等病；或被魘魅、蠱毒所中；或復短命，或時橫死；欲令是等病苦消除，所求願滿。時彼世尊，入三摩地，名曰除滅一切眾生苦惱。既入定已，於肉髻中，出大光明，光中演說大陀羅尼曰：
南無薄伽伐帝，鞞殺社窶嚕，薜琉璃，缽喇婆，喝囉闍也，怛他揭多耶，阿囉訶帝，三藐三勃陀耶。怛侄他，唵，鞞殺逝，鞞殺逝，鞞殺社，三沒揭帝,莎訶。
爾時，光中說此咒已，大地震動，放大光明，一切眾生，病苦皆除，受安隱樂。
曼殊室利，若見男子女人，有病苦者，應當一心，為彼病人，常清淨澡漱，或食，或藥，或無蟲水，咒一百八遍，與彼服食，所有病苦，悉皆消滅。若有所求，至心念誦，皆得如是，無病延年；命終之後，生彼世界，得不退轉，乃至菩提。是故曼殊室利！若有男子女人，於彼藥師琉璃光如來，至心殷重，恭敬供養者，常持此咒。勿令廢忘！
複次，曼殊室利，若有淨信男子女人，得聞藥師琉璃光如來應正等覺所有名號，聞已誦持，晨嚼齒木，澡漱清淨，以諸香華，燒香塗香，作眾伎樂，供養形象。於此經典，若自書，若教人書，一心受持，聽聞其義。於彼法師，應修供養，一切所有資身之具，悉皆施與，勿令乏少。如是便蒙諸佛護念，所求願滿，乃至菩提。
爾時，曼殊室利童子白佛言：世尊！我當誓於像法轉時，以種種方便，令諸淨信善男子善女人等，得聞世尊藥師琉璃光如來名號，乃至睡中亦以佛名覺悟其耳。世尊！若於此經受持讀誦，或復為他演說開示。若自書，若教人書，恭敬尊重，以種種華香、塗香、末香、燒香。華鬘、瓔珞、幡蓋、伎樂，而為供養，以五色彩，作囊盛之。掃灑淨處，敷設高座而用安處。爾時四大天王，與其眷屬，及餘無量百千天眾，皆詣其所，供養守護。世尊，若此經寶流行之處，有能受持，以彼世尊藥師琉璃光如來本願功德，及聞名號，當知是處，無復橫死，亦復不為諸惡鬼神，奪其精氣；設已奪者，還得如故，身心安樂。
佛告曼殊室利：如是！如是！如汝所說。曼殊室利，若有淨信善男子善女人等，欲供養彼世尊藥師琉璃光如來者，應先造立彼佛形像，敷清淨座，而安處之。散種種華．燒種種香．以種種幢幡，莊嚴其處。七日七夜，受八分齋戒，食清淨食，澡浴香潔，著清淨衣，應生無垢濁心，無怒害心，於一切有情，起利益安樂，慈悲喜舍平等之心，鼓樂歌贊，右繞佛像。復應念彼如來本願功德，讀誦此經，思惟其義，演說開示。隨所樂求，一切皆遂，求長壽得長壽，求富饒得富饒，求官位得官位，求男女得男女。若復有人，忽得惡夢，見諸惡相，或怪鳥來集，或於住處，百怪出現。此人若以眾妙資具，恭敬供養彼世尊藥師琉璃光如來者，惡夢惡相，諸不吉祥，皆悉隱沒，不能為患。或有水火，刀毒懸險，惡象師子，虎狼熊羆，毒蛇惡蠍，蜈蚣蚰蜒，蚊虻等怖，若能至心憶念彼佛，恭敬供養，一切怖畏，皆得解脫。若他國侵擾，盜賊反亂，憶念恭敬彼如來者，亦皆解脫。
複次，曼殊室利，若有淨信善男子善女人等，乃至盡形，不事餘天，唯當一心，歸佛法僧，受持禁戒。若五戒，十戒，菩薩四百戒，苾芻二百五十戒，苾芻尼五百戒。於所受中，或有毀犯，怖墮惡趣。若能專念彼佛名號，恭敬供養者，必定不受三惡趣生。或有女人，臨當產時，受於極苦，若能至心稱名禮讚，恭敬供養彼如來者，眾苦皆除。所生之子，身分具足，形色端正，見者歡喜，利根聰明，安隱少病，無有非人，奪其精氣。
爾時，世尊告阿難言：如我稱揚彼世尊藥師琉璃光如來所有功德，此是諸佛甚深行處，難可解了，汝為信不？
阿難白言：大德世尊！我於如來所說契經，不生疑惑。所以者何？一切如來身語意業，無不清淨。世尊！此日月輪，可令墮落；妙高山王，可使傾動；諸佛所言無有異也。世尊！有諸眾生，信根不具，聞說諸佛甚深行處，作是思惟：云何但念藥師琉璃光如來一佛名號，便獲爾所功德勝利？由此不信，返生誹謗，彼於長夜，失大利樂，墮諸惡趣，流轉無窮。
佛告阿難：是諸有情，若聞世尊藥師琉璃光如來名號，至心受持，不生疑惑，墮惡趣者，無有是處。阿難．此是諸佛甚深所行．難可信解。汝今能受．當知皆是如來威力。阿難！一切聲聞獨覺，及未登地諸菩薩等，皆悉不能如實信解，唯除一生所系菩薩。阿難！人身難得，於三寶中，信敬尊重，亦難可得。聞世尊藥師琉璃光如來名號，復難於是。阿難！彼藥師琉璃光如來，無量菩薩行，無量善巧方便，無量廣大願，我若一劫，若一劫餘，而廣說者，劫可速盡，彼佛行願，善巧方便，無有盡也。
爾時，眾中有一菩薩摩訶薩，名曰救脫，即從座起，偏袒右肩，右膝著地，曲躬合掌，而白佛言：大德世尊！像法轉時，有諸眾生，為種種患之所困厄，長病羸瘦，不能飲食，喉唇乾燥，見諸方暗，死相現前，父母，親屬，朋友，知識，涕泣圍繞。然彼自身，臥於本處，見琰魔使，引其神識，至於琰魔法王之前。然諸有情，有俱生神。隨其所作，若罪若福，皆具書之，盡持授與琰魔法王。爾時彼王，推問其人，計算所作，隨其罪福，而處斷之。時彼病人，親屬知識，若能為彼皈依世尊藥師琉璃光如來，請諸眾僧，轉讀此經，燃七層之燈，懸五色續命神幡，或有是處，彼識得還，如在夢中，明了自見。或經七日，或二十一日，或三十五日，或四十九日。彼識還時，如從夢覺，皆自憶知，善不善業，所得果報，由自證見，業果報故，乃至命難，亦不造作諸惡之業。是故淨信善男子善女人等，皆應受持藥師琉璃光如來名號，隨力所能，恭敬供養。
爾時 ，阿難問救脫菩薩曰：善男子，應云何恭敬供養彼世尊藥師琉璃光如來，續命幡燈，復云何造？救脫菩薩言：大德！若有病人，欲脫病苦，當為其人，七日七夜，受持八分齋戒。應以飲食，及餘資具，隨力所辦，供養苾芻僧。晝夜六時，禮拜供養彼世尊藥師琉璃光如來，讀誦此經四十九遍。燃四十九燈，造彼如來形像七軀，一一像前，各置七燈，一一燈量，大如車輪，乃至四十九日，光明不絕。造五色彩幡，長四十九搩手。應放雜類眾生，至四十九。可得過度危厄之難，不為諸橫惡鬼所持。
複次，阿難！若剎帝利灌頂王等，災難起時，所謂：人眾疾疫難，他國侵逼難，自界叛逆難，星宿變怪難，日月薄蝕難，非時風雨難，過時不雨難。彼剎帝利灌頂王等，爾時應於一切有情，起慈悲心，赦諸系閉。依前所說，供養之法，供養彼世尊藥師琉璃光如來。由此善根，及彼如來本願力故，令其國界，即得安隱，風雨順時，谷稼成熟，一切有情，無病歡樂。於其國中，無有暴惡。藥叉等神，惱有情者，一切惡相，皆即隱沒。而剎帝利灌頂王等，壽命色力，無病自在，皆得增益。
阿難！若帝后妃主，儲君王子。大臣輔相，中宮彩女，百官黎庶，為病所苦，及餘厄難；亦應造立五色神幡，燃燈續明，放諸生命，散雜色華，燒眾名香，病得除愈，眾難解脫。
爾時阿難問救脫菩薩言：善男子！云何已盡之命，而可增益？救脫菩薩言：大德！汝豈不聞如來說有九橫死耶？是故勸造續命幡燈，修諸福德，以修福故，盡其壽命，不經苦患。阿難問言：九橫云何？救脫菩薩言：若諸有情，得病雖輕，然無醫藥及看病者，設復遇醫，授以非藥，實不應死，而便橫死。又信世間邪魔外道妖孽之師，妄說禍福，便生恐動，心不自正，卜問覓禍，殺種種眾生，解奏神明，呼諸魍魎，請乞福祐，欲冀延年，終不能得。愚痴迷惑，信邪倒見，遂令橫死。入於地獄，無有出期，是名初橫。二者橫被王法之所誅戮。三者畋獵嬉戲，耽淫嗜酒，放逸無度，橫為非人，奪其精氣。四者橫為火焚，五者橫為水溺，六者橫為種種惡獸所啖，七者橫墮山崖，八者橫為毒藥、厭禱、咒詛、起屍鬼等之所中害。九者饑渴所困，不得飲食，而便橫死。是為如來略說橫死，有此九種，其餘復有無量諸橫，難可具說。
複次，阿難！彼琰魔王主領世間名籍之記，若諸有情，不孝五逆，破辱三寶，壞君臣法，毀於性戒，琰魔法王，隨罪輕重，考而罰之。是故我今勸諸有情，燃燈造幡，放生修福，令度苦厄，不遭眾難。
爾時，眾中有十二藥叉大將，俱在會坐．所謂：
宮毗羅大將、伐折羅大將，
迷企羅大將、安底羅大將，
額你羅大將、珊底羅大將，
因達羅大將、波夷羅大將，
摩虎羅大將、真達羅大將，
招杜羅大將、毗羯羅大將，
此十二藥叉大將，一一各有七千藥叉，以為眷屬。同時舉聲白佛言：世尊！我等今者，蒙佛威力，得聞世尊藥師琉璃光如來名號，不復更有惡趣之怖。我等相率，皆同一心，乃至盡形歸佛法僧，誓當荷負一切有情，為作義利，饒益安樂，隨於何等村城國邑，空閒林中，若有流布此經，或復受持藥師琉璃光如來名號，恭敬供養者，我等眷屬，衛護是人，皆使解脫一切苦難，諸有願求，悉令滿足，或有疾厄求度脫者，亦應讀誦此經，以五色縷，結我名字，得如願已，然後解結。
爾時，世尊贊諸藥叉大將言：善哉！善哉！大藥叉將！汝等念報世尊藥師琉璃光如來恩德者，常應如是利益安樂一切有情。
爾時，阿難白佛言：世尊！當何名此法門？我等云何奉持？
佛告阿難：此法門名說藥師琉璃光如來本願功德，亦名說十二神將饒益有情結願神咒，亦名拔除一切業障，應如是持。
時薄伽梵，說是語已，諸菩薩摩訶薩及大聲聞，國王、大臣、婆羅門、居士、天龍、藥叉、健達縛、阿素洛、揭路荼、緊捺洛、莫呼洛伽、人非人等一切大眾，聞佛所說，皆大歡喜，信受奉行。
《藥師琉璃光如來本願功德經》
南無薄伽伐帝，鞞殺社窶嚕，薜琉璃，缽喇婆，喝囉闍也，怛他揭多耶，阿囉訶帝，三藐三勃陀耶。怛侄他，唵，鞞殺逝，鞞殺逝，鞞殺社，三沒揭帝,莎訶。
南謨喝囉怛那哆囉夜耶。佉囉佉囉。俱住俱住。摩囉摩囉。虎囉吽。賀賀。蘇怛拏吽。潑抹拏。娑婆訶。
十二藥叉大將。助佛宣揚。五色彩縷結其名。隨願悉圓成。冤業冰清。福壽永康寧。
南無藥師會上佛菩薩（三稱）
願消三障諸煩惱，願得智慧真明了。
普願罪障悉消除，世世常行菩薩道。