1.CCA
在電影的開場就出現了CCA的印章，不經常看美漫的粉絲可能不知道，CCA是美國漫畫媒體審核機關，它主要對漫畫的內容是否健康進行審核。
1971年，斯坦·李應衛生部之邀，創作一個寓教於樂的蜘蛛俠故事，主要是向青少年揭露毒品的危害。但是這個故事沒能通過CCA的審查，因為漫畫條例嚴禁提及毒品，不管是否出於反毒教育目的。
但是老爺子決心要出版誰也攔不住，於是這三期蜘蛛俠漫畫在未經CCA批准的情況下強行發布，結果獲得了社會一致好評。而CCA也因此讓步，《蜘蛛俠》成為了第一本獲CCA破例的漫畫。不過到了2001年漫畫就不再需要通過CCA的審核了。
2.鍊金術公司電影中提到的鍊金術公司（Alchemax）最初出現在2003年的《究極蜘蛛俠》#17中，該公司由諾曼·奧斯本創立，目的是秘密地傳承家族遺產。
該公司一隻持續到2099年，並稱為那個世界的統治者，2099年的英雄反派多出自於這個公司。
3.數字42電影中咬了邁爾斯的蜘蛛編碼是42，並且這個數字在接下來邁爾斯實驗力量、時代廣場地鐵站標誌上反覆出現。這是致敬了道格拉斯·亞當斯的著作《銀河系漫遊指南》。裡面有關平行宇宙的情節將42稱作「最終的答案」。
4.波多黎各貼紙邁爾斯在曾為蜘蛛俠之前十分靦腆，他喜歡收集各種貼紙，當邁爾斯去學校時，我們可以看到邁爾斯的行李箱上有許多波多黎各國旗的貼紙，，這是因為邁爾斯的母親是波多黎各人，母親對他的影響十分深遠。
5.致敬《蜘蛛俠》舊三部曲電影中的彼得·帕克講述了自己的傳奇生涯，裡面的所有情節都是致敬了託比·馬奎爾主演的《蜘蛛俠》三部曲。其中包括了《蜘蛛俠2》攔列車、倒掛接吻、以及《蜘蛛俠3》裡黑化後的帕克的中二之舞。
6.《蜘蛛俠的真實生活》當邁爾斯發現他被蜘蛛咬傷會產生超能力後，他開始閱讀《蜘蛛俠》漫畫。而他看的漫畫實際上是現實中的由斯坦李和史蒂夫·迪克合作創辦的《Amazing Fantasy》#15，蜘蛛俠彼得·帕克在故事裡首次出現。而在電影裡漫畫的名字被改成了《蜘蛛俠的真實生活》，不過漫畫內容還是蜘蛛俠的起源。
7.電話裡的大師當邁爾斯翻看他電話裡的聯繫人時，出現了Sara Pichelli，這致敬了《終極蜘蛛俠》的聯合創作者Pichelli, Brian Michael Bendis, and Justin Ponsor。
另外邁爾斯父親的手機裡也出現了史蒂夫·迪克的名字，這是蜘蛛俠聯合創作者之一，也是蜘蛛俠的另一位父親。
8.BOZ的插圖邁爾斯因為要求，必須拍攝一張照片，而照片的構圖正是狄更斯小說《遠大前程》中藝術家BOZ為其繪製的插圖。電影致敬了這一經典。
9.紅色襯衫邁爾斯宇宙的彼得·帕克配音者是《星際迷航》的克裡斯·派恩，而這蜘蛛俠死時穿的是紅色制服，這是《星際迷航》的一個逆向彩蛋，因為紅色襯衣是科幻電視劇《星際迷航》裡一隻出場就被殺害的偵查小隊的名字。暗示了蜘蛛俠死是因為穿了紅色的制服，導演也說如果蜘蛛俠穿黑色那套就不會有事。
10.蜘蛛車蜘蛛車在電影中出現了幾次，當邁爾斯第一次進入蜘蛛俠的秘密基地時，蜘蛛車一閃而過，這輛車相當具有年代感，不但在上世紀大放異彩，在近年的《蜘蛛俠》漫畫中也有出場。
11.蜘蛛俠背受傷
平行宇宙的彼得·帕克向邁爾斯講述自己的歷史時，他談到了他最終事業生活進入了低估，他和MJ分手，並且背還受傷了。這又致敬了《蜘蛛俠2》，蜘蛛俠一段時間裡失去了能力導致他從高樓墜下，摔疼了背。
而事實上，當時主演託比·馬奎爾在現實中確實摔傷了背，並且導致蜘蛛俠差點易主，讓傑克·吉倫哈爾險些成為蜘蛛俠，而有趣的是吉倫哈爾在明年的《蜘蛛俠2》裡將作為反派神秘客出現。
12.KOCA-SODA在電影中，雖然蜘蛛俠彼得·帕克的世界裡可口可樂十分著名，但是在邁爾斯的世界裡，可口可樂的對應版本叫做「Koca-Soda」。這一名稱是漫畫《蜘蛛格溫》#16裡由邁爾斯和格溫談話中得出的。
13.《殭屍肖恩》和《莫比亞斯》在電影的時代廣場有一張海報，上面寫了《從黃昏到肖恩》，這是致敬了經典殭屍片《殭屍肖恩》，而海報將殭屍換成了吸血鬼，又暗示了索尼蜘蛛宇宙的下一部電影《莫比亞斯》。
14.代表色每個蜘蛛俠都有自己的代表色，經典蜘蛛俠是藍、格溫是白、暗影是灰、豬是黃、高達是紫，而邁爾斯則是紅。
電影中有許多暗示：海報宣傳邁爾斯是「Red Man Group」，制服由RedEx提供，甚至Jefferson的牌照都包含「RED」字樣。
15.THWIP！當彼得·帕克教導邁爾斯使用蛛網噴射器時，他告訴邁爾斯：要在每次Thwip後發射。
常看漫畫的粉絲會知道，這是漫畫裡的經典擬聲詞，和金剛狼爪子的「Snickt」或夜行者傳送時的「BAMF」一樣，這是專為漫畫粉絲製作的彩蛋。
16.蜘蛛戰衣當邁爾斯來到已故蜘蛛俠的地下秘密基地時，裡面有大量的蜘蛛俠戰衣，每一個都是彩蛋，其中可以看到《神奇蜘蛛俠》#656的第二代蜘蛛俠盔甲1980年的蜘蛛俠戰衣、PS4遊戲《漫威蜘蛛俠》的蜘蛛衣等。
17.Chance The Rapper電影，我們可以在邁爾斯的牆上看到一張帶著印有4帽子的說唱歌手海報，這是Chance The Rapper，原名錢斯勒·喬納森·班尼特，美國說唱歌手。唯一不同的是原版海報帽子上是3，電影改成了4。
18.菲斯克工業電影中的菲斯克工業是由金並掌管，而其中也展示了動物世界的蜘豬俠的起源：他原本是一隻蜘蛛，但是被一隻放射性的豬咬傷後，變成了蜘豬俠。恩，是的很狗血，但這就是蜘豬俠的起源。
19.史蒂芬·科爾伯特電影裡有著著名記者史蒂芬·科爾伯特的廣告。這個角色出現在2008年的《神奇蜘蛛俠》#573中，他作為一名獨立人士競選公職。他與蜘蛛俠的關係也十分密切。
20.大魔王：本迪斯布萊恩·米歇爾·本迪斯被粉絲稱為漫威的大魔王，粉絲對他又愛又恨，他創造了許多知名新角色，如邁爾斯、鋼鐵之心等，但是他也寫了許多虐心的故事，如內戰、美隊變老、雷神換人、鋼鐵俠變植物人等。電影中邁爾斯在紐約街頭瞥見了印有他名字的廣告牌，也算是這對這位創始者的致敬。
21.*翻譯西班牙語當蠍王闖入帕克家時，他先用西班牙語說了一段話，然後畫面出現了一個翻譯的對話框，一個星號「 * 」進行了翻譯。這也是一個面向漫畫粉絲的彩蛋，這是致敬了漫威漫畫慣用的翻譯風格。
22.四次元口袋當蜘豬俠要回到他的宇宙時，他給邁爾斯一個錘子，還說這個錘子雖然大，但是還是可以放進口袋。這是對傳統動畫表現形式的一種致敬。動畫中雖然物體巨大，但仍然可以放進角色的口袋裡。這個我第一個想到的就是某隻藍胖子。
23.梅姨的秘密歷史當梅姨向邁爾斯透露了蜘蛛俠的秘密時，她顯示出她對蜘蛛俠的各種科技都十分了解，這暗示了蜘蛛俠去世前很長一段時間，梅姨都是蜘蛛俠的助手，協助蜘蛛俠執行任務。
24.極惡六人組電影中六個蜘蛛俠對應了六個反派，他們分別是金並、墓石、綠魔、蠍王、徘徊者、章魚博士。而6這個數字也有其意義，在《蜘蛛俠》系列裡只要反派集結在一起，都只有6個，不會多也不會少，而且他們默認稱呼都是極惡六人組。
25.消失的建築電影的高潮部分，金並開啟了維度傳送門，導致設備上面的建築完全消失，這致敬了《究極蜘蛛俠》#19裡地平線實驗室同樣的命運。
電影最後，電影展示了不同版本的蜘蛛俠，其中有一隻蜘蛛俠只是坐在辦公桌前，這是1967年動畫系列的蜘蛛俠，當時被粉絲們多次提及。後來在2015年的《蛛網勇士》#1裡也被引用。
電影最後出場的是蜘蛛俠2099，本命米圭爾·奧哈拉，來自未來2099年，是鍊金術公司的一名科學家，因實驗意外無意中獲得了蜘蛛俠的超能力。除了米奎爾外，他的AI助手Lyla也出現在電影最後幾秒。他內涵時空穿越設備，能幫助米奎爾進行時空穿梭。
28.最初的起點蜘蛛俠2099選擇的目的地是宇宙67，這是最初的動畫蜘蛛俠所在的宇宙，也是所有動畫蜘蛛俠的起源。
29.斯坦·李
我們終於又見到了斯坦·李老爺子，在《蜘蛛俠:平行宇宙》老爺子化身為漫畫店老闆，他賣給邁爾斯一套蜘蛛裝時鼓舞了他，並且說出了著名的臺詞：面具下人人都是英雄。
敬我們所愛的老爺子，以及所有的漫威創作者們！
《蜘蛛俠：平行宇宙》史上最佳，當之無愧！
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