為了進一步防止境外輸入疫情，臺灣宣布3月24日到4月7日全面禁止旅客在臺轉機。
臺「中央流行疫情指揮中心」22日舉行記者會稱，新冠肺炎疫情已造成全球大流行且境外移入個案持續攀升，為避免疫情通過航空運輸傳播，自3月24日零時起至4月7日，臺全面禁止旅客來臺轉機，以降低疾病傳播風險。返臺民眾務必據實填報入境健康聲明暨居家檢疫通知書，如有發燒、咳嗽等症狀請主動告知檢疫人員並配合相關檢疫措施。長榮航空稱，現階段是非常時期，會儘量維持基本運能以搭載滯留境外的旅客、留學生、臺商返臺為主要任務。
21日，臺灣新增18個確診病例，留學生佔多數。22日新增16個確診病例，其中13例為境外移入，發病前有美國、埃及、德國、法國、義大利等國活動史。值得關注的是，其中3個確診病例都是之前公布的「中研院」確診者的接觸者，讓「中研院」確診人數達4人。為應對這一狀況，「中研院」宣布23日起啟動異地辦公。
值得警惕的是，民進黨當局持續在進行「政治防疫」。繼蔡英文副手陳建仁毫無根據地造謠攻擊大陸的防疫信息「毫不透明」後，臺「中央流行疫情指揮中心」 指揮官陳時中22日又針對大陸「零確診」表示，「這樣的信息，姑且聽之」。此前島內確診病例破百後曾爆發搶購潮，臺灣「法務部」聲稱這是假消息造成的，煞有介事地表示要追查假消息來源，說什麼「有境外勢力在幕後操作」。還有「立委」揚言，如果假消息來自大陸地區，要給予最嚴厲打擊。《中國時報》22日嘲諷說，「用屁股想也知道，搶購是因為民眾的恐慌心理所致」，動不動就扯政治，把民眾當傻瓜嗎？
臺灣師範大學教授林保淳22日撰文稱，民進黨當局在「防疫政治化」的途徑上，對內是以過度「神化」包裝陳時中等人；對外除了針對大陸防疫大加撻伐或冷嘲熱諷之外，還企圖進軍國際，一方面批評世界衛生組織，另一方面又千方百計地以加入該組織為目標。還有就是民進黨當局拼命示好歐美，遲遲不敢宣布三級警示，更有甚者當臺灣人還辛苦地大排長龍領一周3片口罩時，當局擬出了每周贈送10萬片口罩給美國的計劃。文章呼籲政治人物摒棄一切成見、放下一切鬥爭，勇敢而齊心地面對21世紀最頑強、最可怕的敵人，「政治防疫，可以休矣！」「兩套標準 兩岸離心」，臺灣《中國時報》22日發表的一篇評論總結稱，民進黨當局一來在防疫物資上對大陸一毛不拔，對美國卻慷慨解囊；其次在人員管控上對大陸嚴防死守，對美國網開一面，典型的雙重標準；第三，在病毒起源議題上對大陸落井下石，世衛組織早已明確疾病命名必須不涉及地理位置、動物、個人或人群，但當局仍稱之為「武漢肺炎」，絲毫不顧對岸感受。文章直言，「厚此薄彼到如此赤裸裸的程度，難怪會給大陸留下借疫媚美仇中的口實，令兩岸關係雪上加霜」。