《名偵探柯南》中柯南總是實力擔當，不僅外表可愛，其智慧更是讓旁人無法企及。在劇情中又比其他人更敏銳地發現案件細節，從而推導出真相。但實際上，毛利小五郎很可能是劇中隱藏高人的存在。
毛利小五郎的名字源於江戶亂步筆下的偵探「明智的小五郎」，而柯南的名字也是由江戶亂步書籍中而來，足以見得毛利小五郎其實在青山剛昌心裡有不低的比重。或許是因為劇中需要一個人來襯託柯南，小五郎被迫成為廢柴的模樣。
小五郎在較早劇情中就有說過，他在做偵探之前是一位優秀的刑警，柔道和槍法也都是一流。並且他還能娶到被稱為帝丹女王的妃英理，如果小五郎不夠優秀是絕對說不通的。並且他們分居的原因居然是妃英理做飯不好吃，實在是或許生硬不合理。
在劇場版《水平線上的陰謀》一集中，看到這件事與妃英理有關係，平時看起來懶散中帶著廢柴的小五郎更是一掃以往廢柴的形象，比柯南更早的發現真兇。從這就可以看出小五郎或許比柯南稍遜一籌，但也絕對非常厲害，只是平時刻意隱藏實力罷了。
小五郎也許早就知道柯南的真實身份了。在《小五郎同學會殺人事件》一集中小五郎知道柯南和小蘭一起洗澡的時候，非常生氣的「叱責」了小蘭。而且在平時生活中也對柯南百般不滿，似乎沒有哪個成年人會對一個借住小學生如此的。由此推斷小五郎其實是知道柯南的就是自己的女婿工藤新一。
毛利小五郎幾乎每一集都會被柯南用麻醉針擊暈，醒來時發現案子已經被破了，上面有提到，小五郎其實還是一名優秀的刑警，不可能對此毫無察覺。而且，在中後期被柯南用麻醉槍擊暈的時候，總會嘟囔的抱怨著「我要開始了」「沉睡的小五郎又出現了！」以及「又來了，提前打聲招呼也好啊！」諸如此類，說明小五郎早就已經知道柯南就是工藤新一。並且，在被擊暈以後會擺出沉思的表情來掩護柯南。這是體現他情商很高的地方之一。
《偵探們的鎮魂歌》中，委託人（伊東末彥）提出特殊ID的危險性後，柯南知道後脫口而出：「蘭！」，雖然聲音很小，但毛利大叔馬上就問伊東末彥「那蘭她們呢？」顯然他聽到了柯南說的話。並且，在之後柯南聯繫灰原哀後，小五郎問起小蘭，柯南並沒有回答，只是搖了搖頭，足以說明同為偵探的默契。
在劇場版《第十四個目標》裡，歹徒用妻子的生病作為要挾，但萬萬不會想到毛利小五郎會射傷自己的妻子，小五郎讓歹徒驚詫的同時，還會讓歹徒認為他綁架的人質並沒有那麼重要。小五郎選擇最危險的方式儘可能讓自己來做，以減小傷害而不是讓歹徒來威脅妻子的生命。
實際上對歹徒來說，最怕的並不是被包圍和陷入危險，而是被人質行動不便，這樣就會成為他逃跑的累贅。縱觀整部劇，除了柯南沒有人想到這樣，也足以見到小五郎那不符合平時表現智慧和魄力。
在《名偵探柯南》的劇中似乎都有一個父親比孩子厲害的主調，就像是工藤優作在《江戶川柯南誘拐事件》中扮演黑衣人組織，並且讓柯南真的相信了，服部平藏更是碾壓服部平次。由此推斷，小五郎更不會是一般人。
綜所述皆可以推斷出毛利小五郎絕對不是劇中搞笑角色，一個被打了無數麻醉針還迷迷糊糊的搞笑偵探，小五郎真的是喜歡喝酒賭馬，看見美女就走不動路的油膩大叔嗎？真相是什麼樣的，我想除了作者沒有人知道，但只要用心去看總能看出作者表現出的些許端倪。