化石與化石寶可夢
第一世代 貝殼化石 甲殼化石 秘密琥珀
菊石獸 化石盔 化石翼龍
第三世代 根狀化石 爪子化石
觸手百合 太古羽蟲
第四世代 頭蓋化石 盾甲化石
頭蓋龍 盾甲龍
第五世代 背蓋化石 羽毛化石
原蓋海龜 始祖小鳥
第六世代 顎之化石 鰭之化石
寶寶暴龍 冰雪龍
第八世代 組合化石 化石龍 化石海獸
化石鳥 雷鳥龍 雷鳥海獸
化石魚 鰓魚龍 鰓魚海獸
第一，三，四，五，六世代的古代寶可夢，因為單獨整體復活，都有主屬性+巖石副屬性，或就只有巖石屬性。第八世代的組合化石，兩塊化石組合，讓化石的成分沒有形成巖石副屬性。
菊石獸，屬性是巖石+水，分類是漩渦寶可夢，特性是悠遊自如或硬殼盔甲，隱藏特性是碎裂鎧甲。進化型是多刺菊石獸。菊石獸與蝸牛十分相似，又十分像遠古時期的生物菊石蟲。它有著許多藍色的觸手，多而利於攻擊。它的背上有一個十分巨大的殼，用來保護自己。用化石復原出的寶可夢，靠巧妙地彎曲它的10條腿在古代的大海裡飄蕩。
化石盔，屬性是巖石+水，分類是甲殼寶可夢，特性是悠遊自如或戰鬥盔甲，隱藏特性是碎裂鎧甲。進化型是鐮刀盔。化石盔有著棕色的半球形的外殼，殼的上面有兩個黑色圓點，類似眼睛。它有著堅硬外殼，用來保護自己。它與被稱為「活化石」的鱟十分相似，只是沒長劍似的尾巴。由化石復活而成的寶可夢。在藏匿於海底時似乎會用背上的眼睛觀察周圍的情況。
化石翼龍，屬性是巖石+飛行，分類是化石寶可夢，特性是堅硬腦袋或壓迫感，隱藏特性是緊張感。化石翼龍是唯一能進行超級進化的化石寶可夢。同時也是唯一不能普通進化的化石寶可夢。化石翼龍的身體是灰色的，翅膀上有部分是紫色的，原形與白堊紀的翼龍很像，它有四隻鋒利的爪子。它的牙齒呈鋸齒狀，便於撕裂獵物。化石翼龍超級進化前的樣貌是復活不完全的結果。根據圖鑑的介紹，有些學者認為超級進化後的化石翼龍的樣子才是其古代時期真正的樣貌。通過研究從琥珀中提取出來的基因復活而成，是遠古時期的兇惡寶可夢。
觸手百合，屬性是巖石+草，分類是海百合寶可夢，特性是吸盤，隱藏特性是引水。進化型是搖籃百合。觸手百合就像海百合，它的底部是紫色的，觸手是粉色的，頂部是黑色的。會搖晃觸手讓人乍看以為是海草，再將被騙而接近的獵物一口吞下去。是在1億年前就已經絕種的寶可夢。
太古羽蟲，屬性是巖石+蟲，分類是古蝦寶可夢，特性是戰鬥盔甲，隱藏特性是悠遊自如。進化型是太古盔甲。太古羽蟲是一種既扁又長的化石寶可夢。它的外形基於海洋節肢動物，為一種非常古老的寶可夢，可以算是如今寶可夢的古老祖先。以科學的力量從化石中再度復活。會以擺動左右公8片羽毛的方式遊動。居住在海裡的時候腳變成了羽毛。
頭蓋龍，屬性是巖石，分類是頭錘寶可夢，特性是破格，隱藏特性是強行。進化型是戰槌龍。皮膚的顏色為灰色，而頭部、背部與臀部的顏色為藍色，頭部的側邊與後邊長出了角，頭部相當的發達，並可作為武器。頭蓋龍有著鐵一樣堅硬的頭蓋骨。頭蓋龍靠撞擊同伴的頭能進一步鍛鍊結實的腦袋。
盾甲龍，屬性是巖石+鋼，分類是護盾寶可夢，特性是結實，隱藏特性是隔音。進化型是護城龍。盾甲龍有著小小的，黃褐色的身體。它的頭類似於褐色的盾牌。有著摩擦大樹的樹幹，打磨堅硬臉孔的習性。不擅長對付來自後方的攻擊。
原蓋海龜，屬性是水+巖石，分類是古代龜寶可夢，特性是堅硬巖石或結實，隱藏特性是悠遊自如。進化型是肋骨海龜。原蓋海龜是類似古代海龜的水屬性兼巖石屬性屬性的寶可夢。它的身體主要由深藍色組成，它的臉部則是呈黑藍色的，它的前肢上各有一個黑藍色的骨塊，它也和現實的海龜一樣，擁有保護身體的殼，它的殼上有六個凹洞。在大約１億年前的海裡遊動。有時候會爬上陸地襲擊獵物。
始祖小鳥，屬性是巖石+飛行，分類是遠古鳥寶可夢，特性是軟弱。進化型是始祖大鳥。始祖小鳥是被認為是所有鳥類的祖先的巖石屬性兼飛行屬性屬性的寶可夢。它的身體主要由紅、黃、藍三色搭配，組成鮮豔的顏色，它擁有偏大的紅色的喙，喙上還有「>—<」的圖案，並且喙的上下方都突出了它銳利的牙齒，而它的頭部直到頸部都是藍色的，雖然它的眼睛比較單調，只由黑裏白外組成，但卻凸顯了它單純可愛的一面。它的頸部中有一些紅色的羽毛，而它的腹部是黃色的，它的翅膀上也是呈黃色的，但尾端也有一些藍色的羽毛，它的翅膀上有二個爪子，雖然擁有翅膀，但它卻不能用於飛行，腿部也是紅色的，它的腿只有三個爪子，它也擁有一條長長的尾巴，尾巴前端是紅色的，後端則是藍色的。從古代的化石中復活。棲息在樹上，可以不用飛行就在樹枝之間跳來跳去。
寶寶暴龍，屬性是巖石+龍，分類是幼君寶可夢，特性是強壯之顎，隱藏特性是結實。進化型是怪顎龍。從一億年前的化石裡復活的寶可夢。從化石復活而來的寶可夢。如果有不喜歡的事情，就會大動肝火大鬧一場。
冰雪龍，屬性是巖石+冰，分類是凍原寶可夢，特性是冰凍皮膚，隱藏特性是降雪。進化型是冰雪巨龍。冰雪龍是從一億年前的化石復活的寶可夢。冰雪龍有著恐龍形態的身體，通體淺藍色，有一雙藍色眼睛，眼睛上方有著大大的翼狀薄膜，肚皮是白色的，身體兩側各有一個菱形的寶石狀部分。性格慢吞吞的寶可夢。居住在沒有怪顎龍等粗暴敵人的寒冷土地上。
雷鳥龍，屬性是電+龍，分類是化石寶可夢，特性是蓄電或活力，隱藏特性是撥沙。在遠古時代曾憑藉自己強大的下半身而所向無敵，但因吃光了賴以為生的植物而滅絕了。會用尾部結實的肌肉發電。與下半身相比，上半身真的太小了。
雷鳥海獸，屬性是電+冰，分類是化石寶可夢，特性是蓄電或靜電，隱藏特性是撥雪。它凍成冰的上半身在顫抖後可以產生電能。非常不擅長走路。曾經生活在古代的海邊，能用身體的冰來保存食物，但由於動作太遲緩而滅絕了。
鰓魚龍，屬性是水+龍，分類是化石寶可夢，特性是儲水或強壯之顎，隱藏特性是撥沙。超乎尋常的腳力和顎力讓它在古代所向無敵。但由於捕盡獵物，導致它們自己也滅絕了。雖然能用自豪的腳力以６０公裡的時速奔跑，但是只能在水中呼吸。
鰓魚海獸，屬性是水+冰，分類是化石寶可夢，特性是儲水或冰凍之軀，隱藏特性是撥雪。雖然能通過凍結四周來捕捉獵物，但由於嘴長在頭頂上，所以吃起東西來不太方便。面部的皮膚無論受到什麼攻擊都不會受傷，但由於呼吸起來不方便而滅絕了。