工藤新一在變身成為江戶川柯南之後，靠著阿笠博士為他製作的一大堆神奇道具，繼續當著偵探，甚至有時候還能拯救一下世界。但是，不管道具有多麼厲害，柯南本身還是一個小學生，有很多事情他無法做到。在他的偵探生涯中，有一件事是非常絕望的，那就他變小後遇到的第一個案子。
新一在變小後化名江戶川柯南，寄主到了毛利小五郎家的那個晚上，小五郎收到了一宗委託：一個千金大小姐被黑衣男子綁架了。因為提到了黑衣男子，柯南誤以為是與黑衣組織有關，跟著小五郎去了現場。雖然這只是一樁沒有關係的案件，但是柯南作為一名偵探，不能無視綁架案，哪怕和他想找的黑衣組織無關，他也依舊非常努力的尋找兇手的所在地。
在尋找兇手的過程中，柯南就發現了一個問題：自己變小了，體力跟不上了。不僅跑得慢，也跑不遠。幸好柯南和主人家的狗混的比較熟悉，能做一下騎狗的勇士。柯南騎在狗上，找出了犯人的藏身之處，他很帥氣的進入倉庫中想要解救少女。然而問題來了，他跟不是犯人的對手。
柯南被犯人打的的很慘，想用自己管用的足球踢暈犯人，但是他毫無任何力量，他踢的球仍然很準，可犯人一隻手就攔了下來，並不能制服犯人。最終小蘭找到了柯南，用自己的空手道打敗了犯人，才救下了柯南的命。
當時，柯南倒在地上說：「即是能找出犯人，也沒有辦法捉拿他了。」這一句話中滿含絕望，哪怕犯人殺了他，也不會有這麼絕望。對於一個立志當偵探的人而言，不能破案，和死有什麼區別？這一瞬間，大概是江戶川柯南人生中最絕望的時刻。就算小蘭救下了他，他的心同樣死寂。
幸好，阿笠博士為柯南製作了一大堆道具。柯南不僅沒有變弱，實力反而更強了。很多人都對此吐槽：工藤新一隻是一個偵探而已，而江戶川柯南可以拯救世界。不過，如果阿笠博士能早點做出這些發明，新一就能在熱帶樂園反殺琴酒了，不用變成江戶川柯南
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