在這個世界上，存在著能夠永生不死的人類，即使遭到致命的重創，也會在短時間內迅速恢復，人們稱之為「亞人」。永井圭（宮野真守 配音）是一名平凡的高中生，某日，一場車禍讓他亞人的身份曝光，隨即遭到了有關政府部門的高價通緝，在曾經的好友海鬥（細谷佳正 配音）的幫助下，永井圭踏上了永無止境的逃亡之路。
途中，永井圭結識了同為亞人的佐藤（大冢芳忠 配音），佐藤想將永井圭納入自己暗中組建的亞人團體之中，敏感的永井圭卻發現了佐藤隱藏極深的真實面目和目的。亞人一直遭到政府的迫害和殘酷研究，因此佐藤企圖通過一系列恐怖襲擊活動來奪回屬於亞人的權利，永井圭則投靠了亞人管理委員會的戶崎（櫻井孝宏 配音），在他的帶領下對抗強大的佐藤。
在亞人和人類之間，一場充滿了硝煙和鮮血的戰爭即將拉開序幕。《亞人》的基調氛圍是根深蒂固的陰鬱，一開始看的時候，很有點不適，給人一種隱約的窒息感，像是鏡頭上的灰塵沒擦乾淨，沒有明快的音樂，沒有鮮豔的色彩，大量的場景都光線昏暗，所有人物都有一股與生俱來般的平淡——或說淡漠，特別明顯的例子。
主角的媽媽說話，幾乎沒有情感起伏，亞人部隊的那位拐杖軍師，從出場起到最後，說話也幾乎是一個音調，唯一還算比較悅目的色彩，應該就是主角跳下大海後藏身的那個小村子裡的一片綠色了。不僅是色彩和音樂，最開始時主角在學校的畫面，仿佛連鏡頭都是扭曲的，以一種非常彆扭的角度去拍攝，比如某個畫面，看的是主角，然而畫面最左邊，是他同學的小半張側臉。
仿佛在告訴我們，這整個世界，一開始就是不對的。而且，這部作品，像電視劇和動畫的結合。這一點，從人物的長相就能看出來了，下文再詳細剖析。在敘事方法上，沒有使用什麼奇妙的技巧，是非常老實的時間順序，連回憶片段都少得可憐。