明朝立國之初，軍隊大部分實際掌控在開國勳臣之手，隨後朱元璋開始大量誅殺這些人，這個時間點以1393年藍玉案為止，使得軍權逐漸過渡到到藩王手中，尤以是晉王、燕王最甚，掌握軍隊最多，其他藩王皆受到二王的節制。
等到建文帝即位，一上臺便面臨著藩王勢力過大，對中央政權構成了巨大的威脅。建文帝朱允炆自幼生長在深宮之中，深受儒家思想影響，理想主義者也，沒有經歷過大風大浪，身邊也聚集著類似的方孝孺、黃子澄等人，加之朱允炆「誠純孝」，書生意氣，最終，在朱棣發動的所謂「靖難之役」中，痛失皇位，下落不明。
明朝藩王分布《易經》中第八卦為比卦，講的是一群人相聚合作，其中第六爻爻辭：比之無首，兇。意思是說，要親近依靠卻找不到帶頭的人。說的便是以朱允炆為核心的領導班子，缺乏施政經驗。既沒有一個明白人，削藩不得其法，同時也缺乏有足夠威望的人，在危急時刻力挽狂瀾。要是朱允炆的祖母馬皇后仍然在世，情況不至於如此，或者說也不會做出削藩的舉措。
馬皇后是明太祖的原配，在朱元璋奪得天下的過程中，起到了至關重要的作用。在朱元璋尚未「單飛」之時，為馬皇后義父郭子興帳下一員大將。一次受到郭子興猜忌，朱元璋被關了禁閉，沒有飯吃，馬皇后將滾燙的炊餅藏在懷中，偷偷帶給丈夫食用，中間持續的時間，將其胸前的皮膚都燙紅了。表明了夫妻情深，馬皇后心系丈夫的安危，而不顧自己被炊餅所燙傷，相信朱元璋是一邊流淚，一邊吃著炊餅的。同時，馬皇后採取了「曲線救國」，通過盡心侍奉郭子興妻子，使得翁婿得以冰釋前嫌。
1368年，明軍攻克元大都，滿載而歸，朱元璋大為高興。馬皇后獲悉後旁敲側擊，認為元朝擁有大量金銀財寶，也守不住江山，看來帝王應該有其他寶物。朱元璋當然知道愛妻，是要自己重視治國賢才，同時勸誡要注意驕縱情緒的滋生，要關注民生。為此，馬皇后進一步建議朱元璋，在災年賑災固然重要，更重要的是提前儲備糧食，未雨綢繆。
此後在分封有功之臣時，朱元璋派人找尋馬皇后的親族，打算授予官職，但馬皇后予以謝絕。原因嘛，一是國家的官爵要授予賢能之人，自己家族中沒有適合的人選；其次歷朝歷代的外戚多驕奢淫逸，不守法度，陛下這樣「加恩妾族」，只會成為隱患。朱元璋深以為然，便不再對馬皇后的親族封官進爵，轉而賞賜銀兩。
鑑於前代後宮幹政造成的不良影響，朱元璋制定了《女戒》，意在限制后妃在政事的發言權，但並不包括皇后。之所以如此，一則《明史》記載：「（馬皇后）仁慈有智鑑，好書史。」，說明了馬皇后熟悉歷史上的興亡更替，加之夫妻兩人感情甚篤，馬皇后深得朱元璋信任，使其成為了政務上的好幫手、好參謀。
在政權「草創」時期，朱元璋便養成了寫日記的習慣，記錄行軍打仗的點滴，而這些日記正是由馬皇后掌管。馬皇后將記錄根據輕重緩急，進行分類匯總，以備朱元璋問詢；「一將功成萬骨枯」描述了戰爭的殘酷性，但馬皇后對此卻有不同的看法。面對明軍大開殺戒，馬皇后認為奪取天下不能以殺人為本，且勸誡朱元璋要嚴明軍紀，不要濫殺無辜。
此外，馬皇后對朱元璋進行勸誡，對一些功臣以及平民，起到了保護作用。朱元璋夫婦一生收養了許多義子，其中包括了外甥李文忠，其母是朱元璋姐姐。所謂共患難易，同富貴難，朱元璋打敗張士誠後，不放心外甥，派楊憲前去監視。隨後楊憲上奏，李文忠有不法行為，朱元璋打算將這位外甥召回。
馬皇后獲悉後跟明太祖說，李文忠駐守的嚴州，處在敵我勢力的前沿，這樣撤換統帥，軍心容易不穩，且這位外甥一向賢能，楊憲的話不足信。朱元璋這才打消了召回的念頭。而作為太子朱標的宋濂，曾因孫子宋慎，牽連進「胡惟庸案」而被判死刑。馬皇后勸誡道：普通家孩子的老師，尚且可以自始至終得到禮遇，何況是太子的老師呢？況且宋濂平時深入簡出，必然不知道外面的事情。宋濂最終免於一死，改為徙至四川茂州安置。
此外，朱元璋大赦天下，但對死囚的處理卻打了折扣，改為修築都城。但馬皇后卻認為這樣不人道，儘管用服役贖死罪，是很大的恩典，但這樣的服役，仍免不了死亡，從而使得朱元璋取消了這項政令，保全了這部分人。
綜上所述，馬皇后與朱元璋有著同甘共苦的經歷，還處處以身作則，眾人眼裡具有很高的威望，同時其在政事頗有見地，洞悉朝廷之事，是個「明白人」，對於明太祖嚴苛的施政有一定糾正作用，剛柔並濟，在明朝立國之初，起到了很重要的作用。
故馬皇后還活著，方孝孺、黃子澄等人的「草率」，很可能不會變成現實；即便真的削藩，朱棣兵臨城下，面對城頭之上的馬皇后，這位嫡母（朱棣的生母存疑），朱棣應該也硬氣不了；即便朱棣真的硬氣了，陣中受過馬皇后恩惠的將士，應該也不忍心。
馬皇后只會對城下喊道：棣兒，乖，不鬧了啊！咱回家吃飯！