電影鋪墊了很多，在此按時間順序列下一些重要線索：
1.大雄因為和小夥伴打賭而逼出哆啦醬的藏寶圖神器，在他筆下一戳的瞬間 電視裡報導發現了神秘的島嶼。
2.靜香和女孩長的一模一樣。
3.大反派boss的名字即是大雄看過的小說裡的人物名字。
4.大反派是時空海盜 擁有時間機器。
5.電影結尾處特寫了地心能量落回後閃耀爆炸的鏡頭。但地球卻安然無恙，巨大能量被抽離後再回來怎麼也會引起足以滅絕人類的大海嘯，非常不合邏輯。
電影多處挖出的坑，沒有填就結束了，但仍給我們了推理真正劇情線的可能。
真實劇情：大雄一行人從雲端回到地面，發現地球已經引起大海嘯，沒有阻止悲劇的發生，於是他們只有進行SL大法，找到大雄的書桌坐上時光機試圖阻止這一切的發生，此時世界線開始分歧。大家都知道這種方法回到的只是另一個世界線而已，毀滅的世界線還是毀滅了只是大雄一行人無法觀測到了。他們回到大雄用筆那一戳之前，也就是整個故事開始的時候，然後讓當時的大雄沒有戳地圖，並放棄尋找金銀島的念頭。然後滿意的坐上時光機回到正常時間，當他們回去的一瞬間，世界線收束，他們所有人都忘記了整個故事的存在，因為在這個世界線裡壓根就沒發生過。於是，無聊的大雄在無聊的生活中做了一個夢，夢見自己英勇的解救了靜香，解救了世界，這個夢裡他的死對頭就是他曾看過的小說裡的虛構人物，而這個boss的女兒長的非常漂亮，多漂亮呢，當然是大雄的夢中情人，最愛的靜香的模樣……
這裡是不是有一絲詭異，似乎回到了電影開頭，大雄真的做了一個模糊的夢。
對這個時間線的大雄，這只是一個夢。這個夢存在嗎，到底發生了嗎。還記得雙縫幹涉延遲實驗嗎？整部電影發生了沒有，在於觀測者從哪條線觀測，而那顆電子就是大雄手中的筆，大雄戳了，故事存在。故事的存在也就決定了這個「可擇歷史」。這就是為什麼電影裡，大雄的一戳，和金銀島被電視報導發現，被有意的安排在同一瞬間。
說到這裡，觀眾可能認為所有疑團都解除了。
然而我們忽略了一個重中之重，反派boss擁有時間機器，他去過未來，看到了地球的死亡，才促使他有了方舟計劃。然而電影已經清楚的給出了年份，一個不可能的數字，太近了，哆啦醬還存在的好好著呢，時間管理局難道會坐等地球滅亡？
所以真相...遠比想像還要複雜，是想給出什麼寓意呢？