如果計劃不變，昆明地鐵4號線、6號線二期將在今年6月底通車。日前，4號線、6號線二期工程變更環境影響報告相繼發布，根據環評報告，兩條地鐵線的線路總長、敷設方式、站點名稱等均有局部調整。
4號線：線路總長增加42米 車站增加兩座
根據變更環評，4號線起點位於西北部的陳家營站，止於呈貢新區昆明火車南站，線路走向未發生變化，線路長度由原環評報告及批覆中的43.38公裡調整為43.422公裡，長度增加0.042公裡。
原環評報告及批覆中，高架及地面過渡路段7.46公裡，地下線35.92公裡，初步設計方案中敷設方式按照呈貢區規劃布局，將7.64公裡高架支線全部調整為地下線，同時，4座高架車站均變為地下站。
車站設置方面，結合呈貢區最新規劃成果，在呈貢區鮮花大道和古滇路增設了2座車站。呈貢東站、麻苴站、金鼎山站、賽馬場西站車站位置有不同程度的位移，並優化了雲大西路站（可研為小喜村站）、賽馬場南站、賽馬場西站、上古城站（原烏龍站）站位。
小菜園站段的線站位方案也進行了優化，由原方案沿學府路路中布設、在小菜園立交橋西側設小菜園重疊三層站方案優化為線路下穿蓮花池公園，進入米軌廊道布設方案，並在小菜園立交橋西側、米軌鐵路下方設小菜園地下二層島式站方案。
4號線站點名稱也有所調整，小屯立交站更名為小屯站，蓮花池站更名為蘇家塘站，昆明北站更名為火車北站，菊花東站更名為菊華站，小喜村站更名為雲大西路站，小王家營站更名為鬥南站，呈貢站更名為聯大街站。
此外，從5號線工程條件和4、5號線換乘功能考慮，由原方案2、4、5號線通道換乘方案優化為4、5號線上下重疊同臺換乘並與2號線通道換乘方案，改善了5號線延長壽路布設無法穿越天宇廣場的工程實施條件，提高了4號、5號線的換乘功能。
6號線二期：線路總長減少279米 車站增加兩座
地鐵6號線二期工程主線走向沒有發生重大變更，基本按原線路走向，僅對部分線路進行了微調。6號線二期原環評階段正線長度為7.616公裡，變更後施工圖階段線路全長7.337公裡，其中地下線長6.2公裡，地面、高架線長1.137公裡，與環評階段比較，地下段減少了0.314公裡，地面高架段增加了0.035公裡，整體較原環評減少了279米。
6號線二期車站變更的主要內容是新增2個車站——岔街站（拓東體育館站更名）、東郊路站（菊華綜合樞紐站更名），變更後共設4座車站，均為地下車站。此外，塘子巷站（原拓東路站更名）、菊華站（原菊花東站更名）局部位置發生變更或平移。
根據變更環評公示，截至2020年3月30日，昆明地鐵4號線、6號線二期均已基本完成土建工程施工，下一步施工主要是設備安裝和調試。按照原本的計劃，4號、6號線二期都將在今年6月30日通車試運行，但因新冠肺炎疫情影響，兩條地鐵線的工期拖延了不少時日，不過截至目前，軌道交通公司及相關官方並未表示通車時間將延期。