中南大學湘雅醫學院和中山大學中山醫學院比較，確實都是很牛的醫學院，特別是像湘雅醫學院，更是具有「北協和、南湘雅」的美譽。從歷史的角度分析，湘雅醫學院盛名籠罩在中山醫學院至上，但是從最近幾年學科發展來看，中山醫學院總體實力超過了湘雅醫學院，湘雅醫學院相對於中山醫學院而言，是一個大而不強的虛胖。
從兩所高校的創建歷史來看，兩所醫學院均與孫中山先生扯上關係，但是中山大學醫學院似乎要比湘雅醫學院歷史更為長遠，但是湘雅醫學院在當時年代的影響力更大。
從學科優勢上來看，中山大學醫學院擁有7個本科及長學制專業，其中藥理學為國家重點學科，病原生物學為國家重點培育學科，基礎醫學為國家「雙一流」建設學科。一級學科博士點4個，二級學科博士點14個。
而湘雅醫學院本科專業就有13個，光一級學科博士點10個，二級學科博士點59個，擁有病理性與病理生理學、遺傳學、藥理學、精神病與精神衛生學、神經病學、胸心外科學、內科學（內分泌與代謝病學）、耳鼻咽喉科學、普通外科學（培育）國家重點學科9個。
在第四輪學科評估中，中山大學醫學院的基礎醫學、臨床醫學、藥學被評估為A-，口腔醫學、公共衛生與預防管理被評估為B+，護理學被評為B，生物醫學工程被評為B-，中西醫結合被評估為C。
再來看看湘雅醫學院，護理學被評估為A+，臨床醫學被評估為A-，基礎醫學被評估為B+，藥學被評估為B，公共衛生與預防醫學被評為B-，口腔醫學被評為C。
從教育部第四輪學科評估結果來看，兩所高校的學科發展各有千秋，例如像護理學很明顯湘雅醫學院是全國第一，但是中山大學的像藥學、基礎醫學、公共衛生與預防管理、口腔醫學、中西醫結合、生物醫學工程就明顯超過了湘雅醫學院。
從以上數據來分析，不難看出，湘雅醫學院的綜合水平在數字上要大，例如辦學規模上自然超過了中山醫學院，而且從博士點上以及國家重點學科方面也能驗證湘雅醫學院確實在發展初期遠遠超過了中山醫學院。因為，湘雅醫學院享有「南湘雅」的美譽。
但是從最近的一次評估來看，中山醫學院在開始專業佔不到半點優勢的情況下，評估結果卻超過了湘雅醫學院，到底是湘雅醫學院在退步，還是中山醫學院在進步呢？從外界的聲音來看，至從湘雅醫學院合併後，發展速度相對緩慢。在當起各大高校興建或者合併醫學院的競爭環境下，湘雅醫學院何時能夠對著起「南湘雅」美譽？值得深思，期待湘雅醫學院再次崛起！