乾隆其實並不討厭第二任皇后，也不討厭她生的兒子。乾隆後來立皇十五子永琰為太子，跟令妃沒什麼關係。繼皇后被冷落，也跟令妃沒有關係。至於繼皇后跟乾隆有什麼矛盾，這個歷史上並沒有確切的說法，至今是一個謎。
乾隆皇帝總共有兩位皇后，第一位是富察氏，她在弘曆還是親王的時候，便被選為弘曆的嫡福晉，根據史料記載，富察皇后溫良淑恭，深得弘曆的喜愛。乾隆皇帝的第二位皇后便是烏拉那拉氏，她和富察氏同時間進入潛邸， 被選為弘曆的側福晉。
公元1735元，雍正皇帝去世。弘曆登基稱帝，是為乾隆皇帝。乾隆登基之後，跟隨他多年的女人們也被封了位分。嫡福晉富察氏為皇后，側福晉烏拉那拉氏為嫻貴妃，格格高佳氏為貴妃。烏拉那拉氏本是側福晉，可位分卻比格格高佳氏低了一等。從這便可以看出，弘曆並不喜愛烏拉那拉氏。
乾隆身邊這麼多女人，他一生最愛過的女人，大概也就只有富察氏了，這也是那拉氏不被得寵的第一因素。作為結髮之妻，乾隆對富察皇后非常用情，可惜富察氏因喪子之痛加上身體本身就不好，在乾隆13年就去世了。皇后死了，乾隆遲遲沒有立後，也許在他心中，沒人能替代富察氏的位置。
清朝，皇后的人選很嚴格，必須出自滿洲上三旗。而除了富察皇后外，輝發那拉氏是唯一的一個出身尊貴的女人。而且，當時她與乾隆的婚姻是雍正爺賜婚，這一切不過是政治利益牽連的結果。一段政治聯姻，在乾隆皇帝那裡也只是後宮多了個女人而已，感情並不深。一段因為政治利益送來的女人，註定是遭到帝王嫌棄和討厭的。
而當時在皇太后的心目中，那拉氏是個很不錯的繼任人選：那拉氏出身上三旗，地位很高，也有充分的後宮管理經驗，對自己也盡心服侍到位，那拉氏不做皇后，還有誰能做？
關於冊封那拉氏的原因有兩個，第一因為乾隆生母鈕鈷祿氏對那拉氏的疼愛，第二也因為那拉氏為人恪守後德，有國母的風範。
最終那拉氏被廢的猜測有兩個，第一是因為令妃魏佳氏得寵。而乾隆在五皇子永琪死後有意立令妃所生的皇子顒琰為儲君，所以對那拉氏下了手；第二，乾隆風流成性，而那拉氏又比較剛直，在勸諫的時候不注意，所以惹怒了乾隆。
《清實錄》是這樣記載的：「皇后自冊立以來並無失德，去年春，朕恭奉皇太后巡幸江浙，正承歡恰慶之時，皇后性忽改常，於皇太后前不能恪盡孝道，比至杭州，則舉動尤乖正理，跡類瘋迷，因令先回京，在宮調攝」。
乾隆原本就不待見她，發生這件事後更是對她厭惡至極，將她打入冷宮。打入冷宮的第二年烏拉那拉氏就死了，乾隆不僅不為所動，對外還說是皇后福薄。
烏拉那拉氏貴為皇后，不僅喪禮的級別比皇貴妃的還低，連自己的陵寢都沒有，而是被塞進了純惠皇貴妃的地宮一側，堂堂的皇后反倒成了皇貴妃的下屬，顏面蕩然無存。