說到「黑歷史」，大家可能會想起自己曾經的「中二殺馬特」時期，但不止是人，動漫裡也有黑歷史。
《戀愛隨意連結》
這部番劇完全是製作方的「中二」，當時官方策劃了一起整人活動，邀請了市來光弘等聲優來作為嘉賓，騙他們說還需要一名角色，所以讓他們試音，甚至還讓聲優們說了許多羞澀的臺詞。結果這場整人事件被曝出後，引起了業界與觀眾的不滿，最終動畫涼涼。
《神剃》
動畫第一季的時候有著非常高的人氣，而後面的劇情卻越來越崩壞，甚至有些接近裡番了，這引起了粉絲的不滿，甚至有極端的粉絲揚言要殺掉作者，作者被嚇的停刊。
《涼宮春日的憂鬱》
09版本裡，有一個一共8集的章節，每一集的細節分鏡和場景不一樣，但劇情完全是一模一樣的，一時讓許多觀眾懷疑製作組偷懶，甚至棄坑。
《精靈寶可夢》
大名鼎鼎的「電腦戰士多邊獸」事件，製作組為了展現電腦世界效果，把爆炸場景通過紅藍閃現方式作出，結果讓許多孩子的眼睛受到了嚴重損傷，遭到了家長們的反對舉報，也立刻遭到了處理。
《school days》
都知道誠哥命運悲慘，但這部虐心番裡還有一段隱藏的劇情。當時的日本發生了一件「柴刀事件」：一個十多歲少女將父親用斧頭殘忍殺害，在動畫最後一話裡出現了類似的畫面，為了不造成影響，製作組講那些畫面全部替換成了風景。