《隱秘而偉大》昨天播出第39集，40集，劇情開始出現反轉，顧耀東與沈青禾攜手成功探知綁匪地址，並盜取王科達私人印章辦理通行證，讓地下黨成功帶走尚榮生綁架案的一個綁匪，讓真相大白於天下。
因為尚榮生綁架案真相公之於眾，一處處長王科達成為了替死鬼，掩蓋了幕後幾位主謀，他也算是得到應有的懲罰。
《隱秘而偉大》總計51集，也就是從第39集開始，男主顧耀東開始開掛，一路打怪升級，協助地下黨做不少事情。
前面的一些劇情都是為了顧耀東的成長進行鋪墊。在王科達被稽查處打死後，二處處長鍾百鳴開始掌管一處，並升趙志勇為一處小隊隊長，協助他抓捕地下黨。
趙志勇黑化後的結局並不好，因為得知鍾百鳴故意不把他母親病危的消息告訴他，讓他很生氣，在質問鍾百鳴時被對方讓人從樓頂上扔下去摔死。
夏繼成從國防部獲取一份情報，需要利用上海地下黨送給中央，在發報的過程中，鍾百鳴率隊進行抓捕，在進行槍戰時，鍾百鳴被顧耀東從背後一槍打死。
另一個反派人物齊昇平，在上海解放前夕，僱一艘船準備逃往臺灣，幾位船員看到他攜帶的家產後，見財起意，把他打死扔海裡餵魚。
策劃尚榮生綁架案的幾位貪官也得到處罰，出場寥寥幾次的丁局長一家被下獄，只有丁放安然無恙。
丁放父母被下獄後，她把家裡財產都給了楊福朵，為她自己，也為她父母贖罪，另外，顧耀東把賣給楊一學贓物的小偷抓獲歸案，並處罰了車行經理，算是對劇中的這樁冤案有了交代。
綜合來說，《隱秘而偉大》結局還算圓滿，相關反派人物都得到應有懲罰，而顧耀東和沈青禾這對革命情侶，最後也走到一起。