結核分枝桿菌RD-1區編碼蛋白的結構和功能

2021-02-10 結核公社

RD-1(region of difference-1)被認為在結核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)的致病機理中起著關鍵的作用.RD-1 基因全長9.5 kb,開放讀碼框從Rv3871~Rv3879c,分別編碼9 種不同的蛋白質.RD-1 區在卡介苗(bacillus Calmette-Guerin,BCG)中是缺失的研究結果顯示,RD-1 區是結核分枝桿菌的主要毒力因素之一,同時RD-1 區參與了一種新的分泌系統ESX-1,這種分泌系統能夠促進某些特定蛋白的分泌.ESX-1 分泌的兩種主要蛋白質CFP-10 (culture filtrate protein of 10 ku)和ESAT-6 (early secreted antigenic target of 6 ku)能夠形成牢固的1∶1 的複合體,這兩種蛋白質能夠協同分泌而且能夠引起T細胞反應,並可能作為理想的靶抗原在結核的預防和診斷中發揮作用.

結核分枝桿菌(MTB),RD-1區,CFP-10, ESAT-6

結核(tuberculosis,TB)是由結核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)引起的人獸共患慢性傳染病,是威脅人類的三大感染性疾病之一.目前全世界大約有20 億人感MTB,每年大約有200~300 萬的結核患者死亡[1].結核分枝桿菌多重耐藥性(multi-drug resistance,MDR)的出現以及愛滋病(HIV)感染者對結核分枝桿菌易感性的增強使結核的傳播更加迅速[2].結核分枝桿菌區別於卡介苗(bacillus Calmette-Guerin,BCG)的一個重要特徵是結核分枝桿菌的基因組中存在RD-1 區(region of difference-1)而卡介苗沒有.結核分枝桿菌菌株H37RV 的RD-1 區刪除後注射C57BL/6 鼠,發現其毒力類似於BCG弱毒疫苗,從而說明RD-1區與細菌的毒力有關[3, 4].在本文中,我們重點描述RD-1 區編碼的兩種蛋白質ESAT-6 和CFP-10,這兩種蛋白質是重要的T細胞抗原,能誘導機體產生記憶性免疫應答,在結核病的診斷、預防中已成為研究的熱點.

結核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis, MTB)H37Rv 基因RD-1 區全長9.5 kb,共有9 個開放讀碼框(Rv3871~Rv3879c),分別編碼9 種蛋白質[5](圖1).Rv3871 是轉錄形成單位,它和Rv3870 蛋白共同作用形成膜結合ATPase,同時還發現Rv3871 能夠識別CFP-10 的C 端並同Rv3870 相互作用進而促進CFP-10 和ESAT-6 蛋白的分泌[6, 7].Rv3872和Rv3873分別是PE 和PPE 家族成員,目前還沒有證據表明Rv3872 表達的PE 蛋白存在於結核分枝桿菌細胞膜上,但有研究表明,Rv3873編碼的PPE 蛋白存在而且和細菌細胞膜相交聯[8, 9].Rv3874和Rv3875分別編碼兩個低分子質量的分泌蛋白CFP-10(culture filtrate protein of 10 ku,esxB) 和ESAT-6 (early secreted antigenic target of6 ku, esxA),它們的分子質量分別是10 ku 和6 ku[10].這兩個蛋白質受同一個啟動子調控轉錄,分泌至體外形成1∶1 的蛋白質二聚體,CFP-10的C 端並不參與二聚體的形成,但是C 端的7 個胺基酸對蛋白質的分泌卻有重要的意義[11](圖2).Rv3876編碼N 端富含脯氨酸的蛋白質.Rv3877編碼跨膜膜蛋白,該蛋白質有許多跨膜位點,是形成蛋白質分泌通道的主要蛋白質[7].Rv3878編碼的蛋白質被稱作TB27.4,有研究表明,TB27.4 的C 端分子是引起結核患者免疫反應的主要因素,相反,在BCG疫苗接種者身上沒有引起相關的免疫反應,這表明該蛋白質可能具有診斷意義[12].有研究表明Rv3879 編碼的分泌蛋白能夠和Rv3871 編碼蛋白相互作用進而促進蛋白Rv3881c/Mh3881c(EspB)的分泌[13].

結核分枝桿菌抗原特異性IFN-γ釋放試驗(IGRAs)的出現代表了結核病診斷領域的一個重大進展. 這些試驗主要是為T 細胞對分泌抗原ESAT-6 和CFP-10 反應所產生的IFN-γ進行的檢測.現在商業化存在的IGRAs 主要是T-SPOT.TB和QuantiFERON-Gold(表2)[33~35].由於大多數結核分枝桿菌感染者單個抗原是很難被檢測出來的[36],因此檢測結核分枝桿菌的多重抗體也許會更有效.T-SPOT.TB 和QuantiFERON-Gold 診斷技術,因其高度的靈敏度以及能夠大大降低了傳統的結核菌素皮膚試驗(TST)所帶來的假陽性概率而成為診斷潛伏性結核感染(LTBI)的新技術.然而,對臨床結果的縱向研究迫切需要定義結核分枝桿菌抗原特異性IFN-酌釋放試驗(IGRAs)對活動性結核的預測價值.這些數據的確立將會為實施以IGRAs診斷結果為指導的治療方法提供可靠依據.

為了應對結核這一世界性傳染性疾病,科學家們對結核分枝桿菌培養液中的分泌蛋白進行了廣泛的研究,由於結核分枝桿菌的RD-1 區在BCG 菌株中是缺失的,因此RD-1 區蛋白受到了廣泛的重視,其中RD-1 區的ESAT-6 和CFP-10 蛋白由於具有較好的免疫原性而成為人們研究的熱點.結核分枝桿菌基因組測序工作的完成,為進行結核分枝桿菌蛋白質組學研究奠定了基礎[40].可以預見,通過蛋白質組學研究,許多用於結核分枝桿菌檢測以及研製亞單位疫苗的新抗原分子將會被發現.

相關焦點

  • 苯達喹啉結合的分枝桿菌ATP合酶結構
    苯達喹啉結合的分枝桿菌ATP合酶結構 作者:小柯機器人 發布時間:2020/12/12 19:24:51 加拿大兒童病醫院John L.
  • 「胸科學術」結核分枝桿菌游離核酸檢測有效提高結核性胸膜炎的...
    該研究提出:結核分枝桿菌游離DNA檢測(cf-TB)與Xpert MTB/RIF和分枝桿菌培養相比,特異性保持不變的情況下診斷敏感性顯著提高,建議將cf-TB作為結核性胸膜炎診斷的一線檢查手段。結核性胸膜炎(Tuberculous pleurisy, TP)是最常見的肺外結核之一,也是胸腔積液最常見的原因之一。
  • ...前沿】上海科技大學饒子和團隊解析了海藻糖轉運蛋白複合物結構
    在細菌中,5'-三磷酸腺苷(ATP)結合盒(ABC)轉運蛋白對於攝取營養物質(包括非還原性二糖海藻糖,該代謝物對幾種人類病原體(包括結核分枝桿菌)的存活和致病性至關重要)至關重要。 SugABC是一種ABC轉運蛋白,可將海藻糖從周質脂蛋白LpqY轉運到分枝桿菌的細胞質中。
  • 人免疫轉錄因子T-bet的遺傳缺陷揭示抵抗分枝桿菌的新免疫學機制
    責編 | 兮人是結核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis)的唯一自然宿主【1】。在人類歷史中,結核分枝桿菌導致了超過十億人的死亡【2】,是導致死亡人數最多的感染性疾病,西方將結核稱為「白色瘟疫」 (white plague)【3】。當人初次接觸結核菌時,個體反應存在巨大差異。
  • 饒子和團隊《Science》解析「藥靶-藥物」三維結構
    因此,針對抗結核藥物靶點的研究以及新藥的研發迫在眉睫。結核分枝桿菌是引起結核病的病原菌,其細胞壁極為特殊,主要成分包括分枝菌酸(MA)、阿拉伯半乳聚糖(AG)、肽聚糖(PG)和脂阿拉伯聚糖(LAM)等,對結核菌起到天然保護作用。抑制細胞壁成分的合成被認為是合理的抗結核新藥研發思路。
  • 【指南】活動性關節結核一期關節置換專家共識
    文獻回顧表明,採用一期病灶清除人工關節置換術治療活動性髖、膝關節結核可以較好地重建髖、膝關節結構,恢復關節功能,改變了傳統治療方法患者致殘的局面,但也面臨諸多挑戰:①活動性關節結核一期人工關節置換與現有診療常規衝突;②活動性髖、膝關節結核一期置換文獻多為小樣本回顧性隊列研究,手術療效缺乏全面系統評估;③手術指徵及圍手術期管理還不規範;④全球範圍內缺乏關節結核治療指南和具體治療方法的共識。
  • 時隔20年,非結核分枝桿菌病終於出指南了!
    非結核分枝桿菌(non-tuberculous Mycobacteria),以下簡稱NTM,不是指除結核分枝桿菌以外的分枝桿菌,而是指除結核分枝桿菌複合群和麻風分枝桿菌以外一大類分枝桿菌的總稱。
  • 胸部常見的影像徵象及肺結核、肺罕見腫瘤的影像學表現
    1、原發性肺結核影像學表現原發性結核分枝桿菌感染患者常無影像學異常。如果發生明顯的感染,常常表現為氣腔實變陰影(圖1),累及整個肺葉。有時可侵及肺門淋巴結(圖2) 和縱隔淋巴結,尤其好發於右側氣管旁區域,可增大。淋巴結增大在成人原發性肺結核中罕見,除非是免疫功能低下的患者(圖3)。淋巴結結核分枝桿菌感染增強CT 常表現為中心低密度影,提示壞死(圖4)。
  • 泛素樣蛋白的來源及功能
    當時發現了一種幹擾素誘導的、分子量為15KDa的蛋白產物——ISG15。該蛋白在序列上與泛素蛋白有高度的相似性——可以通過共價結合的方式修飾其它蛋白。後來發現ISG15蛋白是表1中所列舉的一系列UBL蛋白中第一個被發現的UBL蛋白。儘管如此,直到目前為止我們對它的功能還是知之甚少,至今才發現了ISG15蛋白的E1酶(即ISG15活化酶)和E2酶(即ISG15連接酶)(背景知識框1)。
  • 幾種常用的蛋白標籤的功能和優點
    重組蛋白表達技術現已經廣泛應用於生物學各個具體領域。特別是體內功能研究和蛋白質的大規模生產都需要應用重組蛋白表達載體。上周小知了給大家簡單介紹了大腸桿菌原核表達的整體思路,這裡給大家簡要介紹幾個常用的蛋白標籤及其功能和優點。
  • 「皮膚過敏」一年多 竟是皮膚結核
    半年前,劉女士因為咳痰、發燒到市胸科醫院就診,通過胸部CT和電子纖維支氣管鏡檢查,醫生確診為肺結核和支氣管結核,入院後,劉女士接受了規範的抗結核治療。雖然確診了肺結核和支氣管結核,但胸五科主任田紅看到劉女士乾燥脫屑的皮膚、布滿小裂口及滲血的雙臂還是不放心。
  • 皮膚結核,易被忽略的殺手
    皮膚結核是結核分枝桿菌所致的炎症過程,它可由結核桿菌直接接種所致(疣狀皮膚結核)或繼發於其他器官的結核灶,如肺結核引起的尋常狼瘡,骨和淋巴結部位結核引起的瘰癧性皮膚結核
  • 關於核定新增和修訂部分醫療服務價格項目的通知
    23 250501048 XPert MTB/RIF結核分枝桿菌及利福平耐藥檢測 採用半巢式PCR技術,檢測待測標本是否含有結核分枝桿菌DNA,並且能夠檢測結核分枝桿菌是否對利福平耐藥。
  • 前列腺結核帶來「男」言之隱,30歲男子諱疾忌醫導致腎臟受損
    直到今年3月,劉明發現症狀越來越重,在當地醫院做了一系列檢查,懷疑是結核,於是來到了湖南省胸科醫院內一科求診。入院後,內一科的醫護團隊為他完善了CT、血液、痰液以及相關檢查,檢查結果顯示,劉明不僅肺部有結核的徵象,腎臟也受到了極大的損害,一側腎臟基本上已喪失了功能,確診為繼發性肺結核、泌尿繫結核。
  • PBJ | 朱健康院士組利用大腸桿菌的ABE結構顯著提高腺嘌呤鹼基編輯器在水稻中的編輯效率
    目前鹼基編輯包含胞嘧啶鹼基編輯(實現C-T替換)和腺嘌呤鹼基編輯(實現A-G替換)。2017年,哈佛大學David Liu團隊開發了腺嘌呤鹼基編輯器(ABE)。經過多輪的蛋白定向進化,他們成功的將源於大腸桿菌的tRNA腺苷脫氨酶(ecTadA)轉化成了作用於DNA的高效腺嘌呤脫氨酶(ecTadA*7.10)。有意思的是用於大腸桿菌的ABE結構和用於動物細胞的ABE結構略有不同。在
  • 新冠病毒 S蛋白的結構,功能和抗原性
    在之前Science文章中確定了新冠病毒S蛋白的三聚體結構,而在這篇文章的冷凍數據3D分類顯示出新冠病毒的Spike蛋白存在多種構象狀態,並在3.0Å解析度下重建了閉合的新冠病毒S三聚體和在3.3Å解析度重建了打開的單個SB區的三聚體。
  • 結核病人眼圈、面色變黑,有什麼辦法能改善嗎?聽聽醫生怎麼說!
    那麼,這種面色黑的問題,跟疾病和吃藥之間有沒有關係呢?今天,就和大家談一談這個問題。結核病是由結核分枝桿菌引起的一種感染性疾病,其中的肺結核和結核性胸膜炎屬於國家法定傳染病,醫生發現這樣的患者,是需要進行網絡報告的,以使公共衛生部門及時掌握結核病的流行情況。
  • 尼羅羅非魚IL-6受體(IL-6R)和糖蛋白130(Gp130)的分子功能研究
    尼羅羅非魚IL-6受體(IL-6R)和糖蛋白130(Gp130)的分子功能研究出處:水生動物健康評估公眾號 作者:陳國權 水產養殖網 2020-04Gp130)的分子功能研究,引用信息如下:序列分析表明,ONIL-6R包含2019bp,編碼672aa的多肽。ONIL-6R的分子量為75.91&nbspkDa,理論等電點為5.80。OnIL-6R具有可能的信號肽、胞外區、跨膜區和胞內區。在OnIL-6R的胞外區中發現了IL-6R的保守結構特徵,包括一個免疫球蛋白樣(Ig-like)結構域和兩個纖維連接蛋白Ⅲ(FNIII)結構域,其中第一個FNIII結構域包含WSXWS序列基序。