專機私菸走私案暴露了蔡英文的執政危機，蔡英文辦公室企圖以「超買」和「歷史共業」淡化走私舞弊的事實，反而助燃民怨，迫使她道歉滅火。臺灣「聯合報」近日發表評論指出，更受矚目的是，此案某些特殊環節或特定人士有遭輕放之嫌，而最早發動調查此案的新店調查站幹員最近被排除在外，未獲安排相關勤務。這是企圖遮掩案情，或者高層因不滿而採取「反撲」？在在讓人好奇。
蔡英文辦公室面對這次弊案，缺乏羞愧之意；雖提出長串處分名單，目的似乎只為切割與止血。包括一名十九歲大學生因錯發圖文，迅即遭秘書長陳菊以「造假」氣衝衝提告，顯得不成比例。更可議的是，臺當局「交通部」要求華航拿出以往臺當局領導人專機免稅品銷售資料，企圖掩蓋而今華膳保稅倉庫淪為私菸發貨中心的真相。事實上，陳水扁、馬英九專機自2006至2016年購煙加總僅一萬五千條，遠不及蔡英文今年的紀錄。由此，足證「歷史共業」之說，實為誆騙兔脫之計。
專機私菸走私案成案過程極不尋常，「下辦上」的曲折，顯示執法人員都對「司法獨立」缺乏信心。調查員得仰仗時力「立委」黃國昌協助盯場，才免於重案被吃掉；但即使如此，民進黨幕後運作的種種小動作，仍可看到政治介入「司法」的斧鑿斑斑。當年蔡英文藉助太陽花學運助攻大位，黃國昌出力甚多；而今，黃國昌反過頭來揭發蔡英文的「國安布」，其間變化令人咋舌。
撇開黃國昌的政治算計不談，蔡英文多年來利用公民運動包裝改革形象，上臺前保證「將民進黨還給社會，重建人民信任」。但這次走私香菸案，卻暴露蔡英文和陳菊對近身特勤侍衛人員的縱容及管理無方，導致其貪婪無行、吃相難看、恃權而驕。此外，遭綠營派系全面染指盤據的華航及其關係企業，面對特權人士如何卑躬屈膝，不惜侵蝕關稅制度及機場管理制度也要迎合到底。這就是蔡英文改革的真相？
更難看的是，時代力量黨一些成員不問民進黨的失德失政，卻反過來質疑黃國昌揭弊的動機，「立委」林昶佐更因此宣告退出時代力量黨。此外，另有多人則發起「總統唯一支持蔡英文」的表態連署，急於向大綠表忠。這些人當年有揭開馬當局「國防布」的勇氣，如今面對蔡當局走私菸案卻不敢直視，他們的民主信念多麼蒼白！
更諷刺的是，就連當年貪腐遭判刑的陳水扁，都對蔡英文提出告誡：「若對自己人輕輕放下，就準備明年重重摔下。」從一直等著被「特赦」的陳水扁口中聽到這番話，蔡英文心中作何感想？
蔡英文在陳水扁貪瀆時挺身「救起民進黨」，如今卻遭他出重手打臉，不覺得臉頰發燙嗎？陳水扁之言，道破綠營執政的惡劣本質：出事公務員頂罪，自己人無須負責。且看，「檢調」部門還在釐清案情，蔡英文辦公室就斷言，涉案人員沒有蔡英文辦公室、「國安會」政務及機要人員；蔡當局「國安局」調查報告未出，便祭出侍衛室主管懲處名單。這種作法，皆在為自己人築防火牆。
蔡英文誇言改造的民進黨，不僅未從陳水扁案記取教訓，甚至變本加厲。如柯文哲的形容，走私菸案是冰山一角，民進黨肆無忌憚，蔡英文都沒說話。蔡英文的改革承諾已化為菸灰，只留下派系分贓的盤根錯節侵噬著臺灣。
民進黨宣稱明年大選是價值之爭，但走私菸案讓人民看穿：蔡當局今天能把華航變成民進黨的派系禁臠，明天就有可能以保衛政權為名濫行打壓，把臺灣的發展拋在腦後。
在蔡英文的改革形象中，黃國昌與陳水扁曾是一明一暗的對照襯託；但在走私菸案裡，兩人竟成她形象沉淪的顯影劑。這個「寄生民主」的民進黨，已把蔡英文的改革大旗變成了髒汙的政治遮羞布。
「大華網絡報」也在3日發表的一篇評論裡指出，不過短短三年光景，臺灣在蔡英文統治下，改革盲動冒進、政策獨斷失序，臺灣內外交困，人們茫然於未來究竟何去何從。