兩個相同性格的人卻是截然不同的命運。如果自己的身份是假象，那麼自己所做的一切罪行是否可以抹去？《無間道》這部影片最大的亮點是對自己人生的定位以及對人性的思考。影片並沒有主角和配角，採用的是雙男主的模式。兩個演員的精彩演技也是這部電影受歡迎的一大原因。
劉建明本是香港黑幫的成員，但是在他年輕的時候聽從他老大韓琛的吩咐，洗清背景加入香港警察，成為黑社會的臥底。而同樣警方也採取相同的辦法，讓陳永仁進入黑社會成為警察的臥底。劉建明為了成為韓琛的心腹，只用了七年時間就成為一名領導，他在背後經常為他的上司韓琛提供大量關於黑幫的資料，幫助韓琛擴大幫派的勢力。
而另一邊陳永仁雖然對外宣稱由於身體的原因才退學，但實際上是加入黑社會成為警察的臥底。為了完成自己的形象，陳永仁經常故意傷害他人被抓進監獄。只有這樣才不會讓人懷疑，也正因為如此陳永仁成為了韓琛的心腹。
然而因為一樁毒品交易的失敗，雙方發現自己都有對方的臥底，情況頓時緊張起來，如果稍有不慎便就是死亡的結局。雙方都在懷疑自己的內部人員，面對這一情況，劉和陳兩人想盡一切辦法想要揭開對方的面紗，因為晚一步的人面臨的只有暴露和死亡。
警官黃志誠發覺這一切都是韓琛在揭露陳永仁的身份設下的陷阱，他想讓陳永仁就此住手，放棄這個艱難的任務，讓他接受專業的心理醫生的輔導，而陳永仁聽話去見了心理醫生，在這一過程中，陳永仁和這位美麗大方的心理醫生有了愛情。
但是情況發生了惡化，韓琛命令陳永仁做任務，為了完成這個任務也是為了揪出臥底，陳永仁鋌而走險。但是最後黃警官還是死了，為了保護所有人，為了不辜負身上的警徽，他英勇就義。
劉建明和陳永仁兩人是敵對的宿命，從他們選擇不一樣的身份那刻便知道了結局。結尾劉建明心理其實產生了動搖，自我質疑自己的做法是否符合心中的道義，但是為時已晚，他之前犯下的所有罪行不是因為悔改就能抵消的，而且事實上因為他的老大的逼迫，他只能向前，不能回頭，即使前方一片黑暗。
他說我想做個好人，但是好人是想當就能當的嗎，如果因為一句悔過就能原諒犯下的罪行，那麼警察和無辜的人的性命怎麼回來，當一個好人很難，但是問心無愧。