海軍本部的勢力在頂上戰爭之前似乎是稱霸了偉大航路前半段，頂上戰爭之後稍顯頹勢，給人一種「海軍是不是要完啊？」的感覺。不過就算海軍在偉大航路後半段沒有那麼強的統治力，它依然是海賊王第一大勢力，來看看它的構成就知道了。
1.海軍將領
海軍本部經歷了一部分高層人員的流失後，現在還保留著相當一部分強力將領，最高級別的是元帥赤犬，在其之下是三大將黃猿、藤虎、綠牛，另外還有卡普、戰國這兩個實力不次於大將的老前輩，還有鶴中將這樣的智囊。
這個數量的頂尖強者，讓海軍本部不害怕任何一個單獨勢力的挑戰，就算是四皇級的白鬍子帶領全部兵力攻打海軍本部，海軍還是靠著傑出的個人能力擋住了。
2.七武海
除了海軍將領，七武海也是受海軍聘用的高手。通過卡普說過的話我們可以知道，七武海就是海軍本部拉攏來對付四皇的，海軍自己可能不懼怕一個四皇，但是要壓制四個四皇，就要有更多的高手。
七武海就在這種情況下被招募，雖然並非每個七武海都對海軍忠誠，不過為了保住海軍賜予他們的某些特權，在海軍需要的時候他們還是會出手相助，這已經足夠讓海軍的底氣變得更足。
3.秘密組織
海軍本部還控制著不少秘密組織，比如CP1-CP8，這些間諜部門為海軍提供各類情報，以及執行一些不太困難的黑暗任務。
CP9和CP0這兩個機關分別是世界政府直屬的暗殺組織和諜報組織，直接對天龍人和世界政府負責，海軍不一定能指揮他們，但他們跟海軍本部是同一立場的盟友，應該會提供幫助。
4.科技部隊
海軍抓到貝加龐克並收為己用，真的是撿到寶了。貝加龐克一個人的科研能力比海軍整個科研部門都要強大，在貝加龐克的幫助下海軍科技突飛猛進。
最大的進步就是擁有了科技部隊——一支由和平主義者組成的特種部隊，不會反抗、不會思考，忠實執行命令的恐怖軍團。
5.屠魔令
海軍中將以下的將領和士兵並非無用之人，屠魔令就是他們的舞臺，根據海軍本部或世界政府的要求，屠魔令可以出現在大海任何一個角落，對任何一個地點發動攻擊。
屠魔令過後，被攻擊的地點就會被從地圖上抹去，可以說是大殺器了。這種攻擊對於強者沒用，對於實力不夠強的海賊團或者其他人是很大的威懾力。
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