巴西龜一般在每年的11月到次年2月開始冬眠。冬眠時烏龜不吃不喝，有利於減少體內的消耗，但是應注意在冬眠之前一定要讓烏龜補充充足的營養，有充足的能量儲備才能安全冬眠。
一般從每年9月份開始，應該每天飼餵2次，每頓都保證讓巴西龜吃飽，給予充足的營養，只有當巴西龜體內有充足的能量儲備時，才能安全度過冬眠。到10月時，應將烏龜禁食，排空腸道，防止冬眠時腸內容物長時間停留在腸道中，引起腸道疾病。每年11月左右巴西龜會進入冬眠狀態，溫度保持在0℃-10℃之間最適宜，建議至多每月檢查一次烏龜的狀態，頻繁打擾會提高烏龜的死亡率。