中華民國非常大總統是孫中山曾經擔任過的短期職位，只在1921年5月5日與1922年6月16日短暫使用過，從此該職位便消失匿跡於歷史長河。這個職位看似風光萬分，冠以「非常」和「總統」二字，但其中的緣由細細說來卻讓人落淚。
1912年10月，中華民國第一屆國會舉行，此屆國會中國民黨佔據優勢。1913年因宋教仁遇刺，引發二次革命，袁世凱下令解散國民黨。袁死後，國會恢復，但當時的政治大權全部集中在各省的督軍和國務總理段祺瑞手中。此後張勳復闢失敗和段祺瑞重返北京建立政府等一系列事件，使得國會名實存亡。
在這樣的時勢背景下，孫中山無奈之下在廣州打起護法運動的旗號，呼籲原國會議員南下廣州組成新政府。孫中山認為北京政府違背了中華民國臨時約法，為非法政府。因此他的呼籲受到許多國會會員的響應，紛紛來到廣州。1917年，孫中山在廣州召開國會，該國會被稱為「非常國會」。
但是這個政府也不受承認，在國際上站不住腳，而且孫中山在這個政府內的權利基本上被架空。同時孫中山和粵軍首領陳炯明有很大的矛盾，孫中山想要發展革命勢力，處處被阻止，無可奈何。
時間持續推移，孫中山繼續苦口婆心說服陳炯明，然而言之懇切，而陳炯明則聽而不聞，置之不理。1921年，孫中山認為時機迫切，若國際進一步和北京政府勾結，革命事業便無從談起。因此，孫中山要求國會選舉總統，不然一走了之。結果孫中山以218票當選非常大總統，陳炯明三票，一票棄權。
孫中山就任中華民國非常大總統後，企圖發起第二次護法運動，計劃由桂入湘北伐。這個法是指《中華民國臨時約法》，孫中山發起該運動是為了鞏固他耗費畢生精力取得的革命成果。但是，因陳炯明與孫中山意見不合，直接命令手下攻擊總統府，孫中山被迫離開廣州，「非常大總統」的職位從此消失，無人談起。
孫中山逃離廣州，數年來努力的成果功虧一旦。這是孫中山遭受的一生中最慘重的一次失敗，標誌著中國資產階級領導的舊民主主義革命的失敗。