人眼的顏色是由兩個因素決定的——虹膜的色素和虹膜散射光線通過的方式。基因決定了眼睛中黑色素的含量，黑色素越多，眼睛就越黑。然而，對某些人來說，他們眼睛的顏色似乎會隨著光線的多少而改變，這是因為眼睛中有雙層虹膜，顏色取決於哪一層反射光線。
大約79%的世界人口是棕色眼睛，這是世界上最常見的眼睛顏色。在棕色之後，世界上8%-10%的人有藍色的眼睛，5%的人有琥珀色或淡褐色的眼睛，2%的人有綠色的眼睛。比較少見的顏色包括灰色和紅色、紫色的眼睛。
棕色的眼睛
棕色的虹膜是由它的色素沉澱決定的，可以是深棕色或淺棕色。前者是由於黑色素濃度高，在東亞、東南亞和非洲很常見。淺棕色的虹膜是由於虹膜的黑色素水平較低，在歐洲、西亞和美洲很常見。眼睛的色素通過遺傳從父母傳給後代。然而，棕色眼睛的父母不一定會生出棕色眼睛的後代，因為基因的變異會導致另一種眼睛的顏色。
藍色的眼睛
世界上大約8%到10%的人有藍色的眼睛。藍色眼睛裡沒有藍色的色素沉著，相反是虹膜的黑色素含量很低。哥本哈根大學在2008年進行的一項研究表明，大約1萬年前發生的一種基因突變導致了藍眼睛的形成，一種阻止眼睛產生黑色素的基因被遺傳。歐洲藍眼睛人口佔比最大，芬蘭是藍眼睛人口比例最高的國家。
淡褐色的眼睛
世界上大約5%的人有淡褐色的眼睛。褐色是黑色素和光線散射共同作用的結果。淡褐色的眼睛似乎也會從綠色變成棕色和藍色。在某些情況下，光線折射的差異可能會導致虹膜呈現出多種顏色，主要顏色取決於進入眼睛的光的波長。
琥珀色的眼睛
世界上大約5%的人擁有琥珀色的眼睛。琥珀色是由於存在一種叫做脂色素的黃色色素，這使虹膜呈現黃褐色/銅色和黃/金黃色，有時也會呈現淡褐色。琥珀色眼睛在人類中不常見，但在鳥類、魚類和犬科動物中很常見。
綠色的眼睛
世界上只有2%的人口擁有綠色的眼睛。低水平的黑色素、黃色的脂色素，以及由光線散射引起的藍色陰影共同作用導致了眼睛呈現綠色。綠色眼睛的人分布在歐洲中部、西部和北部。
灰色的眼睛
灰色的眼睛看起來接近淺藍色的眼睛。虹膜前層的低水平黑色素，光線從深色的上皮細胞上散射形成灰色眼睛。灰色眼睛在北歐和東歐最常見。
紅色/紫色的眼睛
患有嚴重白化病的人通常有紫色或紅色的眼睛。這是由於極低水平的黑色素使血管顏色穿透。出現紅色/紫色眼睛的機率是極其罕見的。
異色，罕見的兩種眼睛顏色
異色症是一種罕見情況，完全異色是指兩隻眼睛的兩個虹膜呈現不同的顏色。在部分異色症中，僅一隻眼睛的虹膜呈現兩種不同的顏色。