《隻狼》講述的，是一個斷絕不死的故事。
葦名一帶，似乎崇尚不死。
從遠離於日本的西方神秘國度得到了不死之力龍胤（趙匡胤的胤）。
以龍胤之力，可使一人從鬼佛處得到不死之力，此之謂不死契約。
這世間的勢力，也為這龍胤之力蠢蠢欲動。
主角狼從小被梟收養長大，並訓練成為一名出色的忍者，被要求成為擁有龍胤之力的御子九朗的守護人。
三年前，平田莊受到賊人團體攻擊，梟疑似死亡，狼為了保護御子而擊敗了疑似背叛的老師蝴蝶夫人，然後卻在危機之中慘遭暗殺。
擁有龍胤之力的九朗為了報答狼的答救，與狼籤訂了不死的契約。
回到現在：
葦名城危機日益嚴重，九朗被監禁於其中，狼被打傷扔入地洞，失去很多記憶。
在女性的呼聲中狼醒來，再次嘗試救出九朗。
密道外遇葦名現城主玄一郎阻攔，快要勝利之時被手裏劍偷襲，失去一隻手臂。九朗被玄一郎帶走。
狼被剃佛像者所救，於破舊寺廟中醒來，剃佛像者將其義肢移植於狼。
於是狼重回葦名城，擊敗了想要利用不死之力保護國家的玄一郎，救下了九朗。
玄一郎喝下常言不死之水源之水所製成的變若水，消失於巴之雷中。
九朗知其所以然，凜生大義，認為不死乃扭曲人性之事，應當斬斷。
斷絕龍胤之事，需前往源之宮獲取龍之淚。
前往源之宮，則需如巴之一族收集源之香。
遂令狼尋找：
獲取龍胤之血的赤紅不死斬「拜淚」；
源之水積存的馨香水蓮；
源之水凝結的結宿之石；
指引仙鄉的常櫻香木。
以製成香料，前往源之宮。
狼乃上金剛山仙峰寺尋刀，見僧人饑渴於不死，仿造龍胤，魔蟲附身。
入墜落之谷源水深處尋花，見附蟲巨猿癲狂異變失控，恐怖至極。
下葦名之底水生村尋石，見飲變若酒村民畸形再生，精神失控。
再回葦名城，乃葦名陷落之刻，義父梟原來窺伺龍胤之力甚久，令交出御子。
遂：
1.聽爹地的話，選擇交出九朗，永真小姐姐接受不了出來阻止，狼輕鬆擊敗永真，然後突然開始覺得在座的各位都是垃圾，老年一心發覺決定出來阻止，未果，狼轉身再背刺爹地，快樂屠光全城，修羅結局達成。（be）
2.戰勝爹地，恰巧拿到了常櫻的枝條，遂湊齊所有材料，做成源之香，前往源之宮。
狼於源之宮擊敗七支刀櫻龍完成拜淚，返回回葦名城，發現一心倒地，永真小姐聲明九朗在狼最初失去手臂之地。
喝下變若水的玄一郎提暗黑不死斬「開門」歸來，再戰之，狼取勝。隨後，是重生的劍聖一心。
「隻狼啊，你斬斷所有阻止你們的人了麼」。
「斬斷了。」
這是一心曾詢問過的話語，追憶過去，似乎「隻狼」也是一心起的名字。
「上吧！隻狼！」
「熱血沸騰起來了！」
「衝吧！隻狼！」
「猶豫，就會敗北。」
終勝一心，介錯。
「一定要做一隻好狼啊。」
九朗服下龍淚說出真相，要讓狼使用不死斬殺死自己以斷絕龍胤。
於是狼：
1.終於殺死九朗，狼失意回破舊寺廟剃佛像，龍胤之力轉生，進入下一個輪迴，進入斷絕不死結局（ne）。
2.其實狼早在前往源之宮之前就聽說了九朗的想法，心急如焚的狼向永真尋求幫助，於是要隱瞞龍胤存在一事，利用鈴鐺前往三年以前擊殺梟取得常櫻之花，斷絕一切不死生靈，用常櫻之花消除九朗的龍胤，隨後自殺，從此九朗以常人身份隱藏，回歸常人結局達成（te）。
3.其實狼早在金剛山的時候就得到了永旅經的一部分，得知不死之蟲乃西方聖龍所贈，在與御女的相處中逐漸得知永生的真相，決心將龍胤送回故鄉，遂尋龍書，殺白蛇，得雙柿，贈與御女服用，御女小姐姐成為回歸的搖籃並產出冰之龍淚。
於是皇子服下雙龍淚得以附身於御女身上，終於狼和御女共同踏上回歸中國之旅，龍之歸鄉結局達成（he）。