科學家首次完成對人類X染色體的完整測序

2021-01-09 太平洋電腦網

據外媒報導,儘管科學家已經完成了整個人類基因組的測序但仍有一些空白。現在,遺傳學家在一項具有裡程碑意義的新研究中帶來了一個重要的基因序列,即對整個人類X染色體從頭到尾進行測序並覆蓋了300多萬個此前沒有被繪製出來的鹼基對。

人類基因組計劃是有史以來最雄心勃勃的科學事業之一。從1990年到2003年,一個由國際科學家組成的團隊對人類基因組進行了非常詳細的排序,最終得到了一個幾乎完整的人類物種藍圖。

但這裡的重點是「幾乎」。第一個版本覆蓋了人類基因組的92%多一點,準確率超99.99%。後來的修訂雖然彌補了一些差距,但仍沒有做到完全覆蓋。而其中最大的缺口位於染色體的中心和末端,分別被稱為著絲粒和端粒。這些區域被大量重複的序列分類,所以很難對其展開分類。

現在,一個由遺傳學家組成的國際團隊已經填補了這些空白。據了解,研究人員首次成功地從端粒到端粒對整個X染色體進行了測序。

在人類中,X染色體是父母傳給孩子的決定性別的染色體之一。一般來說,一個受精卵接收到兩條X染色體--一條來自母親一條來自父親。

在最新的研究中,研究小組並沒有對一個正常人類細胞的X染色體進行測序,相反,他們研究了一種特殊類型的細胞,這種細胞含有兩條相同的染色體,是被稱為CHM13的模型基因組的一部分。

而基因組測序面臨的一個問題是,傳統的技術一次只能讀取一小段DNA,然後再讓科學家們將它們拼在一起。不幸的是,當這些片段不斷重複時,這項工作就變得特別困難,研究小組將其比作組裝一個只有一種顏色的拼圖。

為了解開這個謎題,研究小組使用了一次讀取更長序列的新技術。其中一種技術被稱為「納米孔技術」,它將DNA的單個分子通過一個小孔然後通過檢測電流的變化對其進行排序。

「雖然這些大量重複的序列曾被認為是難以處理的,但現在我們在測序技術上取得了飛躍,」該項目的首席研究員Karen Miga說道,「通過納米孔測序,我們獲得了能跨越整個重複區域的數十萬鹼基對的超長讀數,從而繞過了一些挑戰。」

利用這項技術,研究小組能填補著絲粒上的一個巨大缺口,該缺口由310萬鹼基對重複的DNA組成。而這些以前未被探索過的地區可能會被證明對科學研究特別有價值。

Miga表示:「我們開始發現,參考序列中存在空白的一些區域實際上是人類變異最豐富的區域之一,因此我們一直缺失了許多可能對理解人類生物學和疾病非常重要的信息。」

但X染色體只是一個開始。眼下還剩下23條染色體有待科學家去發現,該項目計劃在2020年底將它們全部繪製出來。

【來源:cnBeta.COM】

相關焦點

  • 科學家首次完成對人類X染色體的完整測序
    據外媒報導,儘管科學家已經完成了整個人類基因組的測序但仍有一些空白。現在,遺傳學家在一項具有裡程碑意義的新研究中帶來了一個重要的基因序列,即對整個人類X染色體從頭到尾進行測序並覆蓋了300多萬個此前沒有被繪製出來的鹼基對。
  • 科學家第一次實現了人類X染色體的完整測序
    人類參考基因組(GRCh38)是人類有史以來取得的最準確、最完整的脊椎動物基因組。不過在這個基因組中,存在許多不準確或者未被讀取的地方,它們稱作缺口。即使經過二十多年的改進,仍有數百個未解決的缺口。現在,科學家們使用了新的方法,首次完成了人類染色體從一端到另一端的完整序列(「端粒到端粒」),沒有缺口,並且準確性達到空前水平。科學家通過納米孔測序技術,結合其他改進和驗證的互補技術,實現了對葡萄胎CHM13全基因組進行的高覆蓋、超長讀取。
  • 科學家第一次實現了人類X染色體的完整測序
    人類參考基因組(GRCh38)是人類有史以來取得的最準確、最完整的脊椎動物基因組。不過在這個基因組中,存在許多不準確或者未被讀取的地方,它們稱作缺口。即使經過二十多年的改進,仍有數百個未解決的缺口。問題在於人類基因組中有許多重複的片段,當讀取到許多重複小片段的時候,很難精確還原真正的基因組,畢竟誰也說不清楚到底是基因組是如何重複的。現在,科學家們使用了新的方法,首次完成了人類染色體從一端到另一端的完整序列(「端粒到端粒」),沒有缺口,並且準確性達到空前水平。
  • 首次獲得人類X染色體的完整序列
    但你想過完成一幅上百萬片,甚至再高几個數量級的拼圖作品嗎? 這幅巨大的「拼圖」實際上就是國際上許多機構和科學家多年來一直在努力完成的作品,也就是人類基因組研究。 最近,這項浩大的工程又迎來了一個裡程碑式的成就。
  • 裡程碑式成就,科學家首次獲得人類X染色體完整序列
    經過科學家近二十年的努力,人類染色體基因組序列迄今為止是最準確和完整的脊椎動物基因組序列,但仍有數百個未知的空白或缺失的DNA序列。這些缺口通常包含重複的DNA片段,非常難以測序,但是這些重複片段卻是控制人類遺傳信息變異最豐富的區域之一,可能隱藏著理解人類生物學和疾病很重要的信息。
  • 科學家完成人類X染色體的完整組裝
    科學家完成人類X染色體的完整組裝 作者:小柯機器人 發布時間:2020/7/16 17:42:09 美國國立衛生研究院Adam M. Phillippy等研究人員合作完成了人類X染色體的完整組裝。
  • 基因組學新紀元:科學家首次完成人類X染色體的完整組裝序列
    不過,現在科學家們已經首次從一端到另一端(「端粒到端粒」)地確定了一條人類染色體的完整序列,填補了所有空白,而且精確度達到了前所未有的水平。對基因組學研究者來說,7月14日在《自然》雜誌上發表的人類X染色體端粒到端粒完整序列是一個裡程碑。
  • WLA年度發布 | 首次獲取完整的X染色體序列,人類越來越了解自己了
    2020年,研究人員首次「從頭到尾」(從端粒到端粒)確認了人類X染色體的完整序列,其中不存在任何缺口,精確度達到了前所未有的水平。這一成果意味著創造出精確到鹼基的完整人類染色體已經成為現實,基因組學研究或許將邁入新的時代,人類離揭秘遺傳信息又進了一步。2020年,由中、美、英、法、日、德等多國科學家參與的人類基因組計劃,公布了人類基因組工作草圖。人類基因組非常長,包含約60億個鹼基。
  • Nature發布首個人類X染色體完成圖,長讀長測序盡顯優勢
    )的無缺口人類X染色體完成圖。這項研究成果表明如今生成精確且「Gap Free」的人類染色體序列已經成為可能,也為重建完整人類參考基因組序列踏出了關鍵的一步。以基因組完成圖為參考基因組是動植物基因組和醫學遺傳學研究者們孜孜以求的終極目標之一。
  • 美國研究團隊首次合成人類X染色體完整序列
    中國航空報訊:美國研究團隊首次合成了完整的人類X染色體序列,這將有助於我們全面了解基因組功能,並指導基因組信息在醫療服務中的使用。美國國立衛生研究院(NIH)下屬的國家人類基因組研究所(NHGRI)的研究人員製造了人類染色體的第一個端對端DNA序列。
  • 20年磨一劍:納米技術完全測序人類X染色體
    從2000年人類基因組草圖宣告完成後的二十年間,人類參考基因組不斷更新迭代。即便如此,其中依然存在數以百計的空缺,尚無一條染色體被真正完成 [1]。 如今,科學家首次完成了一條 「從頭到尾」 真正完整的人類染色體測序。7月14日,《自然》雜誌上刊載了美國加利福尼亞大學聖克魯茲分校的 Karen Miga 教授團隊的研究成果[2]。
  • 20年磨一劍:納米技術完全測序人類X染色體
    從2000年人類基因組草圖宣告完成後的二十年間,人類參考基因組不斷更新迭代。即便如此,其中依然存在數以百計的空缺,尚無一條染色體被真正完成 [1]。 如今,科學家首次完成了一條 「從頭到尾」 真正完整的人類染色體測序。7月14日,《自然》雜誌上刊載了美國加利福尼亞大學聖克魯茲分校的 Karen Miga 教授團隊的研究成果 [2]。
  • X染色體首度完全測序,距離擁有完整人類基因組串行也許已不遠
    雖然人類的參考基因組(human reference genome)是目前最準確、最完整的脊椎動物基因組,但即使經過20年改進,完整的DNA串行始終存在缺口。現在,一組國際遺傳學團隊首次確定了人類X染色體從頭到尾(端粒到端粒)的完整串行,沒有空缺且準確性達到空前水準。
  • 美國科學家近日完成了對人類Y染色體的基因測序
    新華社倫敦6月18日電(記者王豔紅)美國科學家近日完成了對人類Y染色體的基因測序,發現這個一向被認為很脆弱的性染色體的自我保護能力比人們想像的更強。這一成果增進了人們對男性不育症的了解,有助於研究更好的診斷和治療方法。
  • 人類基因組X染色體被無死角解碼
    這是基因測序技術的一小步,卻有可能是人類基因工程學發展的一大步。近日,美國國立衛生研究院(NIH)人類基因組研究所(NHGRI)的研究人員宣布,終於獲得了人類X染色體的完整、無間隙、端對端的序列信息。這一突破性發現公布在《自然》雜誌上,這表明有可能生成一個人類染色體的精確鹼基序列,產生人類基因組的完整序列。
  • Nature重大突破:生成完整的人類X染色體序列!
    國國家衛生研究院(NIH)下屬的國家人類基因組研究所(NHGRI)的研究人員製造出了第一個人類染色體的端到端DNA序列。近日發表在《自然》(Nature)雜誌上的研究結果表明,精確地生成人類染色體的鹼基序列現在是可能的,這將使研究人員能夠生成完整的人類基因組序列。
  • 我國科學家人工合成完整活性染色體
    至此,這一項目的進程已經過半,科學家在合成複雜人工生命的道路上取得了重大進展。   最新研究成果當天以7篇論文的專刊及封面文章形式在美國《科學》雜誌上發表。   「人工合成酵母基因組計劃」是人類首次嘗試改造並從頭合成真核生物,旨在重新設計併合成釀酒酵母的全部16條染色體,其中最小一條已於2014年宣布完成。
  • 人類X染色體被無死角解碼,最大功臣是它
    ◎ 科技日報記者 張曄這是基因測序技術的一小步,卻有可能是人類基因工程學發展的一大步。近日,美國國立衛生研究院(NIH)人類基因組研究所(NHGRI)的研究人員宣布,終於獲得了人類X染色體的完整、無間隙、端對端的序列信息。這一突破性發現公布在《自然》雜誌上,這表明有可能生成一個人類染色體的精確鹼基序列,產生人類基因組的完整序列。
  • 解碼人類基因組:人類基因組計劃後17年,X染色體被解碼了
    近年來,DNA讀取技術不斷改善,這些空缺被逐步填滿,研究人員得以進一步繪製完整的人類基因組圖譜。但還是有百餘個區域未得完成,其中就包括X染色體上的幾個部分。而近期發表於Nature的一項研究顯示,科學家首次確定從端粒到端粒的X染色體的完整序列,此成就能幫助科學家進一步了解多種遺傳條件。
  • 解碼人類基因組:人類基因組計劃後17年,X染色體被解碼了
    近年來,DNA讀取技術不斷改善,這些空缺被逐步填滿,研究人員得以進一步繪製完整的人類基因組圖譜。但還是有百餘個區域未得完成,其中就包括X染色體上的幾個部分。而近期發表於Nature的一項研究顯示,科學家首次確定從端粒到端粒的X染色體的完整序列,此成就能幫助科學家進一步了解多種遺傳條件。