在阿卡姆瘋人院中，蝙蝠俠在審訊鱷魚人，在上一次拯救人質的行動中，雖然蝙蝠俠擊敗了鱷魚人救出了萊蒙得化工企業的繼承人，但是1000萬美元的贖金卻被貓女盜走、不知所終，蝙蝠俠還被神秘人切斷了繩索從高處落下險些喪命。所以蝙蝠俠準備從鱷魚人著手調查此案件。
鱷魚人對於這起案件沒有過多的口供，他保持著沉默。趁蝙蝠俠與警衛不注意，鱷魚人從牢房裡打破防彈玻璃抓起了蝙蝠俠，他一把把蝙蝠俠扔向警衛，然後逃了出去。對於鱷魚人的突然逃走，蝙蝠俠並沒有在意，原來這是他的計劃，他在鱷魚人身上安裝了跟蹤器，他準備通過跟蹤鱷魚人來找出幕後的黑手。
韋恩莊園裡來了位客人，這位客人正是前不久治好布魯斯的外科醫生託馬斯醫生，他也是布魯斯童年的玩伴。此時的布魯斯正化身為蝙蝠俠忙於追蹤鱷魚人，所以阿福需要為他找一個好藉口來打發客人，當然阿福在此方面已經輕車熟路，沒用蝙蝠俠多說，他已經以布魯斯大病初癒需要深夜去造訪一位女士為由成功把託馬斯醫生拒之門外。但是託馬斯醫生並沒多在意，他在轉身離開的時候冷冷的對阿福說到，希望他提醒布魯斯，此刻不應該繼續沉迷於危險的遊戲。
對於託馬斯的忠告，阿福冒出了冷汗，他不明白託馬斯這句話之中究竟有什麼含義，他想起了許多年前的一件事，那個時候託馬斯的父母遭遇了一場車禍，布魯斯的父親做為首席外科醫生在緊急搶救他的父母，手術室外布魯斯則極力的安撫著託馬斯，他向他保證一切都會沒事的。不久之後傳來了噩耗，託馬斯的媽媽雖然度過了危險期，但是他的爸爸卻沒能挺過來，於是他揍了布魯斯一記重拳，因為他向他保證過的。
在臨近子夜的時刻蝙蝠俠駕駛著蝙蝠車追蹤著鱷魚人，在經過一座大橋時，一顆特製子彈擊中了他的輪胎，導致蝙蝠車從橋上翻滾著掉落了下去，還好蝙蝠俠沒有受傷，他逃出蝙蝠車之時依然神色緊張的提醒著芭芭拉一定要用電腦緊跟住鱷魚人的信號，不要跟丟了。
此時鱷魚人來到了毒藤女的秘密花園，貓女此刻也在這裡，原來他們都是被毒藤女約來的，由於貓女搶奪了鱷魚人的千萬美金，所以仇人相見、分外眼紅，瘋狂的鱷魚人撲向了貓女，此刻的貓女驚恐萬分，很顯然他們都被算計了。
還好這時蝙蝠俠及時跟上，控制住了鱷魚人救下了貓女，就當蝙蝠俠將要制服鱷魚人之時，突然天空中三架武裝直升機，最後他們抓走了鱷魚人。遠處大樓上神秘人影遠遠的看到蝙蝠俠跟丟了線索後感到很滿意，蝙蝠俠似乎察覺到了什麼，當他看向遠處高樓處，卻不見任何人影，貓女被蝙蝠俠救下後很感激，月光之下兩位老熟人暗生情愫，激情擁吻。
為了追尋毒藤女的下落，貓女與蝙蝠俠追查到了大都會，經過一番周折他們如願找到了毒藤女的藏身之處，毒藤女見貓女背後有蝙蝠俠這個靠山，她也需要她的靠山前來幫忙，這時他們的屋頂被一雙手給掀翻了，蝙蝠俠頓感不妙，他希望出現的敵人不會是他熟知的那個人，蝙蝠俠沒有猜錯，毒藤女找來的幫手正是超人，不知道為什麼此時超人站在了毒藤女的陣營裡。只見此時的超人雙目赤紅目露兇光，蝙蝠俠非常了解超人，他知道接下來他要做什麼，而超人卻不一定猜得到他要做什麼。一道熱射線朝蝙蝠俠與貓女掃來，蝙蝠俠與貓女跳進了水裡，他們想要利用此地水下萊克斯盧瑟鋪設的鉛質海底隧道躲開超人的追擊。
在隧道深處蝙蝠俠告知貓女去日報社找來露易斯幫忙，只有露易斯能讓超人清醒從而擺脫毒藤女的控制，他們的時間不多了，他帶上了克制超人的氪石戒指來儘量牽制住超人，於是他們分頭行動。
雖然鉛質管道限制住了超人的視覺透視，但是依靠超級速度還是很快找到了蝙蝠俠，於是蝙蝠俠帶著氪石戒指朝他揮拳，兩人展開了大戰。蝙蝠俠了解超人，在超人的潛意識裡永遠是個善良的人，所以他不會對別人下死手，否則憑藉著超級速度，他現在完全可以把蝙蝠俠按進牆裡。如今的大超被控制了心智，蝙蝠俠需要小心翼翼地去牽制他為貓女爭取更多的時間去找露易斯，而不是激怒超人。
沒多久超人用呼吸冷氣凍住了蝙蝠俠帶有氪石戒指的手，蝙蝠俠急忙用電擊裝置電擊了超人，又讓整座城市停電一些時間，他只希望這短短的時間可以讓他牽制住超人，超人醒來後更加憤怒了，此時貓女帶著露易斯及時趕到，超人從而恢復了神智，這時才知道自己原來被毒藤女控制了，最後三人一起找到了毒藤女，蝙蝠俠與貓女順利制服了毒藤女準備把他帶回到哥譚市。
臨別之時超人感激了蝙蝠俠及時喚醒了他，看來當初選擇把能克制自己的氪石戒指交給老爺是一個明智之選。這一切被遠處拿望遠鏡觀望的神秘人看在眼內。