全國39所985可以分為四個檔次，第一檔是清北，第二檔是C9聯盟其餘7所大學，第三檔是985工程一期除C9外的其餘院校，第四檔是985工程二期院校，儘管這樣排序還存在一些爭議，但也有一定借鑑意義。
第一檔985: 2所
清華、北大。清華大學和北京大學是全國知名的大學，也在世界範圍內享有盛名，清華以工科為優勢學科，北大以文科、基礎學科、理科為優勢學科，這兩所大學每年都會招收很多各省高考狀元。
第二檔985: 7所
復旦、上海交大、南大、浙大、中科大、哈工大、西安交大。這7所大學與上面清北兩所大學合稱為九校聯盟，都是C9常青藤的成員之一。這九所學校可謂是強強聯合，其中綜合類和理工類院校居多，如果能考進其中任何一所學校都是非常厲害的。
第三檔985: 25所
這類學校比較多，都是除C9聯盟外一期入選985的院校，比如北師大、北理工、廈大、天大、南開、華科大、吉大、東南大學、中國人大、同濟大學等等。這些學校也都非常優秀，如果細分一下，也能再分出一些等級來。
第四檔985: 5所
中國農大、國防科技大學、西北農林科技大學、中央民族大學、東華師範大學。二期入圍985工程的大學名單很少，說明學校還是有一定實力的，但是在分數允許的前提下，建議同學們優先考慮第一期入選985工程的院校。
全國39所985院校都是實力非常強的，每所院校都有自己的優勢學科和專業，如果在報考時分數夠的話，可以在挑好學校的同時選優勢專業，當院校專業不能兼得時，可以先讀一個985院校,專業稍差一些也沒問題，等到考研時再考慮專業也無妨。
如果報考以專業為先的話，很可能會選到最低檔的985，甚至是211及普通本科院校，這在以後就業及考研時是很不利的，所以需要慎重。以上985院校檔次排序僅供大家參考，學校實力與很多因素有關，需要客觀去評價。
全國39所985大學排名（軟科版）
軟科版985大學排名主要按照高考生源質量分排名，與錄取難度更相關，具有很高參考價值，其中排名第一的是清華大學，排名第二的是北京大學，排名第三的是復旦大學，以下是具體榜單。
國防科技大學由於數據保密的原因，有些數據並未公開，但是絕對是一所超一流大學。