Binning雲分析平臺強勢來襲

2021-02-08 美吉生物
Binning是如何提高文章發表的檔次呢,讓我們來看下這篇Nature案例[2] :

在這篇Nature文獻中,研究人員為了深入了解古細菌到真核生物的轉變,採集了七個不同地理位置的沉積物樣本進行宏基因組測序,發現了新型古生菌——Asgard archaea。通過進一步對宏基因組數據進行binning分析,獲得了9個高質量的重組基因組bin。通過系統發育進化、COG功能注釋等分析,該研究推斷真核生物很有可能是從與這些Asgard archaea近緣的一個譜系進化而來。


圖2  Asgard archaea鑑定與系統基因組學

所以,如果老師們手頭已經有宏基因組原始數據和組裝數據,可以直接拿來進行binning雲分析,獲取菌株水平的功能信息。有沒有很心動?快快聯繫我們,喚醒你的宏基因組數據吧!

匠心專注,探索突破

在你科研的道路上,我們從未缺席

現在就登錄美吉生物雲,註冊雲帳號,拉取demo數據體驗吧!

登錄方式:美吉生物官網(www.majorbio.com),點擊美吉生物雲,更多驚喜等你來發現!

參考文獻

[1]  Chen S C, Musat N, Lechtenfeld O J, et al. Anaerobic oxidation of ethane by archaea from a marine hydrocarbon seep[J]. Nature, 2019, 568(7750): 108.

[2] Zaremba-Niedzwiedzka K , Caceres E F , Saw J H , et al. Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity[J]. Nature, 2017, 541(7637):353-358.

相關焦點

  • 宏基因組binning分析免費做
    策略:小提琴圖、組合圖的專業可視化 + SEM、binning的高級分析文章主要圍繞兩種藍藻聚集體開展深入的微生物多樣性分析。對於常規的分析點,大家可以查看原文。這裡我們主要分享文章的特色之處。圖3 物種與環境因子SEM分析 2.2 宏基因組單菌分析「binning」
  • 宏基因組binning原理
    通過binning得到的bins(更確切的說是strain-level clusters或strain-leveltaxonomic units)很可能是實驗室無法純培養的未知的微生物的基因組序列,對其進行組學分析具有重要意義[1]。
  • 從CONCOCT入手理解宏基因組binning(上)
    1.2. binning原理2.1.根據基於聚類的序列類型的不同,暫且分為reads binning, contig binning和 genes binning比較這三種binning的優劣:由於核酸組成和物種豐度變化模式在越長的序列中越顯著和穩定,基於contig binning效果可能更好基於reads binning的優勢是可以聚類出宏基因組中豐度非常低的物種
  • 攜手《異獸來襲》 藍海創意雲助力中國電影工業化
    2017年6月1日,由藍海創意雲主辦、德豐影業聯合舉辦的「網際網路與電影工業高峰論壇暨《異獸來襲》觀影會」在北京花漾年華酒店成功舉辦。原廣電部副部長何棟材,藍海彤翔集團董事長、藍海創意雲創始人魯永泉博士,德豐影業董事長李紀豐等行業內專家領袖出席本次會議。會議中,大家共同觀看了《異獸來襲》的精彩片段。
  • MagicHand雲平臺|微生物高分文章必備分析LEfSe
    LEfSe(Linear discriminant analysis Effect Size,線性判別分析)即LDA Effect Size分析,是一種發現和解釋高緯度數據生物標識(分類單元、通路、基因)的分析工具,可以實現兩個或者多個分組之間的比較,同時也可進行分組內部亞組之間的比較分析
  • 【2020南昌飛行大會】萬眾矚目,強勢來襲!全國媒體爭相報導
    還因璀璨斑斕的航空夢更加絢爛萬眾矚目強勢來襲10月30日—11月1日2020南昌飛行大會 自2020南昌飛行大會發布以來,中央、省市各級媒體爭相報導,數百個網絡平臺紛紛轉發,社會反響熱烈。
  • 環翠法院:暴風雪來襲,「雲庭審」讓公正司法「不打烊」
    環翠法院:暴風雪來襲,「雲庭審」讓公正司法「不打烊」 2021-01-09 00:01 來源:澎湃新聞·澎湃號·政務
  • 觀遠數據3.0平臺發布:Universe數據開發、Galaxy數據分析、Atlas雲...
    ——觀遠數據聯合創始人兼CTO 張進人口紅利消逝和新經濟浪潮來襲的信息化時代,面對需求複雜多變的消費者和競爭激烈的市場環境,零售消費企業唯有以實時的數據分析和結果反饋驅動業務經營,方能對千變萬化的市場作出快速響應,真正讓「以消費者為中心 」不再是一句美好的企業願景。
  • 《巔峰戰艦》基輔、陸奧、天城專屬貼花強勢來襲
    《巔峰戰艦》基輔、陸奧、天城專屬貼花強勢來襲 作者:GM 來源:九遊 發布時間:2017-04-10 16:17:00手機訂閱
  • 電動液壓千斤頂強勢來襲
    phonex出來了iphone8s降價了,同樣的道理電動液壓千斤頂強勢來襲,手動液壓千斤頂已經找不到生存之地,因為電動液壓千斤頂的優勢太大了.電動液壓千斤頂是是由液壓缸和電動泵站組合而成的,可實現頂、推、拉、擠壓等多種形式的作業。
  • 新洗腦神曲《圓周率之歌》強勢來襲!
    原標題:圓周率之歌 新一代洗腦神曲強勢來襲    (語陌)
  • 不過是蜘蛛什麼的:又是轉生系列巨作,蜘蛛子2019強勢來襲
    不過是蜘蛛什麼的:又是轉生系列巨作,蜘蛛子2019強勢來襲最近日本動畫十分熱衷於轉生系列,比如轉生成遊戲裡面的boss級角色的骨傲天,最近10月新番的轉生成為史萊姆這檔子事,當然在2019的新番pv預告中,有這麼一部廣受熱議的轉生作品
  • 史詩級卡牌黑馬《Infinity Wars》官方中文版強勢來襲
    原標題:史詩級卡牌黑馬《Infinity Wars》官方中文版強勢來襲   是否厭倦了被神級卡牌碾壓的被動局面?過多重複卡牌分解可惜宛如雞肋?是否羨慕金色卡牌的炫酷特效?
  • MagicHand雲平臺|物種與功能網絡與模型預測分析
    今天給大家介紹雲平臺宏基因組個性化分析之一:物種與功能網絡與模型預測分析。物種與功能網絡與模型預測分析物種與功能網絡與模型預測分析是針對特定的研究對象和目的,對特定的樣品及其數據集進行關聯與模型預測分析,進一步挖掘數據中的有效信息。
  • 「海鰻雲」 智慧旅遊平臺建設方案
    智慧旅遊平臺建設主要包括智慧旅遊公共服務平臺、智慧旅遊運行監測平臺、智慧旅遊目的地營銷平臺和智慧旅遊目的地體驗平臺四個方面。重點介紹一下智慧旅遊運行監測平臺和智慧旅遊目的地營銷平臺的建設要點。首先,智慧旅遊運行監測平臺建設需要包括旅遊行業監測、涉旅數據管理、遊客流量監測預警、旅遊輿情監測預警、旅遊大數據決策、數據大屏信息顯示、視頻監控管理等智慧管理體系,為旅遊目的地運營管理者提供決策方案框架。其次,智慧旅遊目的地營銷平臺建設需要包括遊客消費分析、景區品牌策劃等,做到真正的服務遊客,服務景區。
  • 《回明》、《醉枕江山》等經典之後,月關新書強勢來襲,好評無數
    如今,月關新書《南宋異聞錄》強勢來襲,短時間內就收穫了好評無數。歷史架空小說在眾多網絡小說種類當中應該是最難寫的,想要寫好其他小說很簡單,只要能把自己的故事講好就可以了。而想要寫出一部經典的歷史架空小說,考驗作者的不僅僅只有講故事的能力,還特別考驗作者的歷史功底,否則寫出來的歷史架空小說很容易就貽笑大方了。
  • 中國版《叢林法則》即將來襲 《馬上出發》強勢亮相
    中國版《叢林法則》即將來襲 《馬上出發》強勢亮相 來源:紅網綜合 作者: 編輯:胡弋 2015-01-08 14:36:12
  • 全新大眾T-Prime GTE強勢來襲,新車媲美奧迪Q7,2.0T+376馬力
    全新大眾T-Prime GTE強勢來襲,新車媲美奧迪Q7,2.0T+376馬力在神奇的東方文明古國,大眾在銷量上把所有競爭對手狠狠踩在腳下,在日益火爆的7座車市場中,說起大眾汽車,它算是在國內銷售比較好的合資品牌了,其旗下車型如朗逸、速騰、邁騰
  • 雲安全中的美人魚:華為雲發布米蘭達安全AI平臺
    10月11日,上海,華為全聯接大會上,華為雲安全總經理楊松發布了米蘭達(Miranda)安全AI平臺,該平臺集合了華為長年的AI積累的模型和算法,經過人工專家訓練之後,能發現人工發現不了的安全威脅,實現換代式的安全技術突破。
  • 【教師篇】最新環創素材來襲……
    【教師篇】最新環創素材來襲……