高性能集群!浪潮助中國基因測序產業化_浪潮伺服器_伺服器解決方案...

　　日前，國家食藥總局批准了兩款基因測序儀及檢測試劑盒，這是自政府出臺「二月禁令」後，首次批准基因測序技術可以進行臨床應用，政府政策的鬆綁引發了大批資本對該市場的覬覦。據統計，2013年中國對於測序儀及試劑的投入總額超過20億元，中國龐大的市場蛋糕早已引發基因測序廠商的高度重視。

　　近日，中國最大的伺服器廠商浪潮為國產基因測序儀廠商中科紫鑫設計構建了高性能計算集群，用於提供面向全國的基因測序分析雲服務。據悉該集群將可承擔20到40臺新一代國產自主基因測序儀在全國範圍試運行期間的所有測序分析服務。

　　人類基因是一種非常重要的戰略性資源，不能單從資本利益來衡量其價值。從20世紀90年代「人類基因組工程」計劃啟動之日起，美國、日本和歐洲等國家已經意識到人類基因的戰略地位並搶先紛紛註冊基因專利，所以誰擁有最多的人類基因誰就能在未來基因診斷、基因醫療技術方面擁有絕對話語權。而對於13億人口大國的中國來說，擁有自主研發基因測序儀技術和產品將成為未來中國基因產業發展的必由之路。

　　中科紫鑫是紫鑫藥業和中科院北京基因組研究所在技術研發合作框架下成立的獨立公司，致力於研製開發我國自主基因測序技術，其研發的國產新一代基因測序儀是國內目前唯一一個技術性能可以匹敵國際市場主流產品的國產基因測序系統，其測序長度(讀長)達到500-1000bp,為目前二代測序儀中最高水平。

　　基因測序技術應用需要對海量、複雜、多變的數據進行分析計算，因此需要高性能計算機來進行基因數據的統計和分析。每個人有23對染色體，這些染色體中包含的DNA由ATCG不同鹼基序列構成，數量共計達30億。對人進行全基因組測序產生的海量數據，必須通過高性能計算機來進行處理分析才能得到對個體醫療診斷分析有益的結果。

　　據專業人士介紹，基因測序分析對高性能計算機的計算性能、內存容量、數據帶寬等要求很高，同時還必須支持完善的基因測序分析工作流。浪潮為中科紫鑫設計構建的高性能計算集群是專門針對基因測序應用定製設計的專用機。專用機採用了刀片伺服器、胖節點作為計算平臺，並行存儲系統用於提升數據帶寬，採用萬兆網絡提升通訊效率，並充分考慮了應用特點定製開發了基因測序工作流軟體。

　　浪潮近年來一直在生命科學領域高性能計算進行持續的技術和應用投入，目前在國內外擁有眾多的生命科學典型案例。浪潮聯手中央電視臺拍攝了《走進科學》超算系列片，對高性能計算在基因方面的應用進行了全面介紹。除高性能計算硬體系統設計供應能力外，浪潮還擁有一支專業的應用專家團隊，在對生命科學應用支持以及對GPU、MIC等新型架構移植優化取得了顯著效果。浪潮與中科院聯合研發的基於MIC平臺的生命科學應用軟體ATOM，在全球超算大會SC上作為世界5個MIC成果之一進行了展示。