基於sklearn的線性判別分析(LDA)代碼實現
一、前言及回顧
本文記錄使用sklearn庫實現有監督的數據降維技術——線性判別分析(LDA)。在上一篇LDA線性判別分析原理及python應用(葡萄酒案例分析),我們通過詳細的步驟理解LDA內部邏輯實現原理,能夠更好地掌握線性判別分析的內部機制。當然,在以後項目數據處理,我們有更高效的實現方法,這篇將記錄學習基於sklearn進行LDA數據降維,提高編碼速度,而且會感覺更加簡單。
LDA詳細介紹與各步驟實現請看上回:LDA線性判別分析原理及python應用(葡萄酒案例分析)。
學習之後可以對數據降維處理兩種實現方法進行對比:
無監督的PCA技術:主成分分析PCA數據降維原理及python應用(葡萄酒案例分析)有監督的LDA技術:LDA線性判別分析原理及python應用(葡萄酒案例分析)二、定義分類結果可視化函數
這個函數與上一篇文章 運用sklearn進行主成分分析(PCA)代碼實現 裡是一樣的,plot_decision_region函數在分類結果區別決策區域中可以復用。
def plot_decision_regions(x, y, classifier, resolution=0.02): markers = ['s', 'x', 'o', '^', 'v'] colors = ['r', 'g', 'b', 'gray', 'cyan'] cmap = ListedColormap(colors[:len(np.unique(y))]) x1_min, x1_max = x[:, 0].min() - 1, x[:, 0].max() + 1 x2_min, x2_max = x[:, 1].min() - 1, x[:, 1].max() + 1 xx1, xx2 = np.meshgrid(np.arange(x1_min, x1_max, resolution), np.arange(x2_min, x2_max, resolution)) z = classifier.predict(np.array([xx1.ravel(), xx2.ravel()]).T) z = z.reshape(xx1.shape) plt.contourf(xx1, xx2, z, alpha=0.4, cmap=cmap) for idx, cc in enumerate(np.unique(y)): plt.scatter(x=x[y == cc, 0], y=x[y == cc, 1], alpha=0.6, c=cmap(idx), edgecolor='black', marker=markers[idx], label=cc)
三、10行代碼實現葡萄酒數據集分類
sklearn依然實現了LDA類方法,我們只需要直接調用而無需自己實現內部邏輯,這樣顯得更加方便。所以,10行代碼實現也不為過,重點需要先理解內部邏輯原理。
關鍵代碼如下:
lda = LDA(n_components=2)lr = LogisticRegression()x_train_lda = lda.fit_transform(x_train_std, y_train) # LDA是有監督方法,需要用到標籤x_test_lda = lda.fit_transform(x_test_std, y_test) # 預測時候特徵向量正負問題,乘-1反轉鏡像lr.fit(x_train_lda, y_train)plot_decision_regions(x_train_pca, y_train, classifier=lr)plt.xlabel('LD1')plt.ylabel('LD2')plt.legend(loc='lower left')plt.show()
使用訓練集擬合模型之後,分類效果如何呢?
可以看到模型對訓練數據集精確地分類,比PCA效果好,因為LDA使用了數據集的標籤,是有監督的學習。
更準確來說,我們要看模型在測試集上的效果,對比如下:
可見,經過邏輯回歸分類器,提取了兩個最具線性判別性的特徵,將包含13個特徵的葡萄酒數據集投影到二維子空間,實現了精確地分類。
四、完整代碼
from sklearn.linear_model import LogisticRegressionfrom sklearn.discriminant_analysis import LinearDiscriminantAnalysis as LDAfrom sklearn.preprocessing import StandardScalerfrom sklearn.model_selection import train_test_splitfrom matplotlib.colors import ListedColormapimport matplotlib.pyplot as pltimport pandas as pdimport numpy as np def plot_decision_regions(x, y, classifier, resolution=0.02): markers = ['s', 'x', 'o', '^', 'v'] colors = ['r', 'g', 'b', 'gray', 'cyan'] cmap = ListedColormap(colors[:len(np.unique(y))]) x1_min, x1_max = x[:, 0].min() - 1, x[:, 0].max() + 1 x2_min, x2_max = x[:, 1].min() - 1, x[:, 1].max() + 1 xx1, xx2 = np.meshgrid(np.arange(x1_min, x1_max, resolution), np.arange(x2_min, x2_max, resolution)) z = classifier.predict(np.array([xx1.ravel(), xx2.ravel()]).T) z = z.reshape(xx1.shape) plt.contourf(xx1, xx2, z, alpha=0.4, cmap=cmap) for idx, cc in enumerate(np.unique(y)): plt.scatter(x=x[y == cc, 0], y=x[y == cc, 1], alpha=0.6, c=cmap(idx), edgecolor='black', marker=markers[idx], label=cc) def main(): # load data df_wine = pd.read_csv('D:\\PyCharm_Project\\maching_learning\\wine_data\\wine.data', header=None) # 本地加載# df_wine = pd.read_csv('https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/wine/wine.data',# header=None) # 伺服器加載# split the data,train:test=7:3 x, y = df_wine.iloc[:, 1:].values, df_wine.iloc[:, 0].values x_train, x_test, y_train, y_test = train_test_split(x, y, test_size=0.3, stratify=y, random_state=0) # standardize the feature 標準化單位方差 sc = StandardScaler() x_train_std = sc.fit_transform(x_train) x_test_std = sc.fit_transform(x_test) lda = LDA(n_components=2) lr = LogisticRegression() x_train_lda = lda.fit_transform(x_train_std, y_train) # LDA是有監督方法,需要用到標籤 x_test_lda = lda.fit_transform(x_test_std, y_test) # 預測時候特徵向量正負問題,乘-1反轉鏡像 lr.fit(x_train_lda, y_train) plt.figure(figsize=(6, 7), dpi=100) # 畫圖高寬,像素 plt.subplot(2, 1, 1) plot_decision_regions(x_train_lda, y_train, classifier=lr) plt.title('Training Result') plt.xlabel('LD1') plt.ylabel('LD2') plt.legend(loc='lower left') plt.subplot(2, 1, 2) plot_decision_regions(x_test_lda, y_test, classifier=lr) plt.title('Testing Result') plt.xlabel('LD1') plt.ylabel('LD2') plt.legend(loc='lower left') plt.tight_layout() # 子圖間距 plt.show() if__name__ == '__main__': main()
五、降維壓縮數據技術總結
至此,數據降維壓縮的技術學習告一段落,經過這次學習,我感覺到一次比較系統的學習會收穫更多,此次學習了主成分分析(PCA)和線性判別分析(LDA),這兩種經典的數據降維技術各有特點。
前者是無監督技術,忽略分類標籤,尋找最大化方差方向提取主成分;後者是有監督技術,訓練時候考慮分類標籤,在線性特徵空間最大化類的可分性。應用場景也各有優勢,PCA在圖像識別應用好,LDA在特徵提取方面更有優勢。
這裡列出這次學習過程的博文記錄,方便查找:
主成分分析PCA數據降維原理及python應用(葡萄酒案例分析)運用sklearn進行主成分分析(PCA)代碼實現LDA線性判別分析原理及python應用(葡萄酒案例分析)運用sklearn進行線性判別分析(LDA)代碼實現我的博客園:運用sklearn進行線性判別分析(LDA)代碼實現
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