海之女神，名叫卡呂普索，她是偉大航路上所有水手和海盜的敵人，但有一天，一位勇敢快樂的水手卻愛上了她，他名叫戴維·瓊斯，他願意為女神放棄一切。
卡呂普索最會玩弄男人的心，她接受了戴維·瓊斯的愛，但戴維·瓊斯必須為她工作，幫她引渡那些死在海上的亡靈，代價是每十年才能上岸一天
痴情的戴維·瓊斯答應了卡呂普索的條件，他們約定好十年後在這座小島上見面，但是，十年過去了，當戴維·瓊斯終於登上岸後，卡呂普索卻沒有來，時間一分一秒的過去了，眼見太陽就要落山，戴維·瓊斯早已心灰意冷，他再也不相信愛情了。
他掏出利刃，叉向自己的胸膛，挖出自己的心臟，將那些寫給愛人的情書同自己的心一起鎖進了聚魂棺（亡靈箱），並埋葬在這座小島上。
由於他背棄自己的誓言，不再履行使命引渡海上的亡靈，而受到了詛咒，臉變成章魚的模樣，他終日在海中飄蕩！駕駛著飛翔的河南人號！同海綿寶寶一起玩鬧！沒錯！他就是！飛天魔鬼！
上文我們講到威爾·特納與伊莉莎白劫法場救傑克，並且有情人終成眷屬，但很明顯秀恩愛死的快，他們馬上因為勾結海盜而被判處死刑，
而抓他們的正是當年炸毀【壞丫頭】號並給傑克烙印的東印度公司董事長，貝克特勳爵，本來他還想抓舔狗諾靈頓的，但這小夥夠機靈，早就辭職跑路了。
貝克特勳爵告訴威爾，想赦免你們也可以，但你必須從傑克身邊拿一樣東西，就是那個羅盤，上期我們說過，傑克的羅盤可以指向持有者內心所想，貝克特說，只要你拿到羅盤，我不僅放了你們倆，還可以給傑克籤一張私掠許可，讓他成為私掠船長。
有小夥伴可能不知道什麼叫私掠船，王下七武海知道吧，所謂私掠船就是國家頒發執照的合法海盜，是當年歐洲列強專門用來對付敵國的一種手段，大海賊時代許多海盜都是由私掠船轉行的，可以說黃金時期的海盜就是大英帝國一手扶持起來的，真是搬起石頭砸自己的腳。
上篇開頭我們說到，貝克特勳爵燒毀了「黑珍珠號」的前身「壞丫頭號」，傑克為了救回自己的船，與章魚哥戴維·瓊斯籤訂契約，契約的內容是，章魚哥幫他復原「黑珍珠」，而傑克則需要在十三年後為「飛翔的河南人」服役一百年。
可倒黴的傑克只當了兩年的船長就被叛變了，如今，十三年之約已到，傑克說:俺不想喝一百年的胡辣湯，於是拿出羅盤尋求幫助，根據羅盤的指示，他從土耳其監獄裡偷到了一張印有鑰匙的圖樣，但他並不知道這把鑰匙意味著什麼？
而上文結尾我們說的大壞蛋是誰呢？一種說法是貝克特勳爵，也有可能是戴維·瓊斯
晚上傑克在船艙找朗姆酒時突然發現一位熟悉的面孔，仔細一看，這威爾他爹嗎？不對啊！你咋還活著呢？
原來，老特納在被「海底撈」以後，就與章魚哥籤訂了契約，他這次是來警告傑克的，你時辰不多了！只要你還在海上，戴維·瓊斯就能找到你，說完就在傑克的手上留下一枚黑斑作為標記。
嚇尿了的傑克立馬命令船員們趕緊靠岸，慌亂中他的帽子掉到了海裡，這裡簡單介紹一下「飛翔的荷蘭人」，在電影中，飛翔的荷蘭人是一艘引渡死者亡靈的船，船長戴維·瓊斯手下有一群殺不死的蝦兵蟹將，並驅使著挪威海怪。
而現實當中，「飛翔的荷蘭人」已經成為幽靈船的代名詞，他是一艘從阿姆斯特丹出發後再也沒有返航的船，許多航海者都聲稱自己親眼目睹過這艘幽靈船，其中包括著名的「水手」英皇:喬治五世。
而電影中戴維瓊斯的原型正是傳說中它真正的船長的亨德裡克·范德戴肯，海賊王中的魚人範德戴肯正是借鑑了這個傳說。海綿寶寶中的飛天魔鬼也是來源於此。
傑克的帽子在海中飄蕩，被一艘土耳其船隻打撈，正當水手們爭搶時卻引來了戴維·瓊斯的「挪威海怪」，船隻瞬間沉沒。
而另一方面，監獄裡的伊莉莎白被父親斯旺總督偷偷救了出來，父親打算送她回英國，但半路上卻被貝克特勳爵的手下發現了，可當他打開馬車後，馬車裡的伊莉莎白早已逃跑。
逃跑的伊莉莎白並沒有直接離開皇家港，而是潛入貝克特勳爵的住處，用槍頂著他腦袋逼他籤署了一份私掠許可，隨後藏在一艘商船裡出海去找威爾。
此時的威爾經過多方打探，得知有人在海峽南岸的小島上曾見過「黑珍珠號」，威爾在這裡找到了擱淺的黑珍珠，但船上空無一人，就在他進島尋人時，卻被一群早已埋伏好的食人族土著抓了。
隨後他發現，這群土著的首領居然是傑克，他們把傑克當成了神明供了起來，我上期節目說過，傑克的母親就是一名美洲土著，所以這裡可以看得出，傑克能夠和這些人進行簡單的交流也不足為奇。
威爾同其他船員一起被吊在懸崖上，從吉布斯口中他得知，這群食人族的風俗是所謂的吃啥補啥，想要成為神，那就吃掉神，傑克馬上就要被吃掉了。
為了逃命，船員們利用懸崖上的藤蔓逃跑，傑克急中生智，命令土著們去追逃犯，然後自己趁亂溜了，於是食人族與傑克眾人上演了一出追逐大戲，
而這時「黑珍珠號」上的老船員，禿頭和獨眼從皇家港監獄逃了出來，還帶著那隻叼著鑰匙的狗，他們發現「黑珍珠」後興奮不已，
此時被食人族追的走投無路的傑克眾人也及時趕到，並一起乘船離去。沒有了神明的食人族土著們萬分傷心，不過他們回頭一看，嗯？這是個什麼玩意（第一部那隻看監獄的狗）？
回到船上後，威爾告訴傑克要用他的羅盤來救伊莉莎白，而傑克最近也發現自己的羅盤好像失靈了，準確的說是他自己用的時候就失靈了，失靈的原因我們待會再談。
為了尋求答案，傑克帶著眾人找到了當初給他羅盤的海中女巫，提亞·朵瑪，女巫向他們講述了戴維·瓊斯的愛情故事，並告訴傑克，圖上那把鑰匙就是用來打開聚魂棺的，而聚魂棺裡裝的就是戴維·瓊斯的心，還給了傑克一罐土，告訴他找到心臟後用得上。
隨後，女巫利用GPS幫他們定為「飛翔的荷蘭人」的位置，傑克則以羅盤為誘餌忽悠威爾去找戴維·瓊斯，並告訴他:「沒事，你見了那章魚臉就報你傑哥的名！傑哥罩著你！你就說你是替我還債的。」
於是頭腦簡單的威爾真就愣頭青的去找章魚哥了，他來到一艘被海怪攻擊的商船上，章魚哥正在船上收小弟，威爾突然冒了出來，告訴章魚哥自己是替傑克還債的。
戴維·瓊斯並不是那麼好糊弄的，他發現了不遠處的傑克，並瞬移到了他身邊，他告訴傑克，想要解除契約也可以，你得拿一百條人命來換，威爾·特納算一個，其他99個人給你三天時間。
傑克只好把威爾留在「荷蘭人」上，自己則硬著頭皮來到龜島託爾圖加，以招募水手為名去湊人，但意想不到的是，他在這裡遇見了舔狗諾靈頓，諾靈頓現在也是通緝犯，他走投無路，只好來投奔傑克，不過眾人沒發現，貝克特勳爵的手下早已潛伏到這裡，原來貝克特之所以要得到羅盤就是想要找到戴維·瓊斯的心臟，以此控制「飛翔的荷蘭人」，並消滅所有海盜。
另一方面，藏在商船上的伊莉莎白猜到海盜們肯定會去龜島，於是她利用婚紗裝神弄鬼將商船引向託爾圖加，並在酒館裡遇見了傑克眾人，傑克告訴她，你老公現在被章魚哥請去「飛翔河南人」上喝胡辣湯了，我的羅盤也失靈了，想要救他你就幫我看看方向，於是伊莉莎白利用羅盤定位了聚魂棺的位置。
而此時威爾在「飛翔的荷蘭人」上見到了自己的父親，父親則勸威爾，趁沒有宣誓效忠之前趕緊離開這艘船，不然最後會同船融為一體，威爾則想要救父親一起離開，但父親自己宣誓效忠了，救他的唯一辦法就是殺死戴維·瓊斯。
威爾提出，以自己的靈魂和鑰匙為賭注，同戴維·瓊斯賭博，戴維瓊斯說:按照俺們河南人的規矩吹牛啊，於是兩人開始擲骰子，而老特納深知，裝有心臟的聚魂棺並不在船上，即使兒子贏了，也下不了船，殺不了戴維瓊斯。
於是他也以靈魂為賭注參與進來，並故意輸了，以換去兒子的自由，威爾則有自己的算盤，經過這場賭博，他知道了戴維·瓊斯將鑰匙藏在觸鬚下面，夜晚趁著戴維瓊斯睡著後將鑰匙偷走，並逃離了鬼船，臨走前他接過父親給他的匕首，發誓一定要手刃戴維·瓊斯。
第二天，在海上漂泊的威爾，被之前伊莉莎白藏身的商船所救，此時，發現鑰匙被偷的戴維·瓊斯憤怒的追到這裡並召喚出了自己的寵物，挪威海怪。
挪威海怪，俗稱北海巨妖，也叫克拉肯，據說是生活在北歐海域的巨大多足怪物，歷史上，大航海時期有大量的目擊記錄，人們一直認為它是一種巨大的章魚，但根據現代生物學家推測，其很可能是生活在深海的大王烏賊或大王酸漿魷，這兩種烏賊體型最大可達十多米甚至將近二十米，甚至，人們曾在巨型抹香鯨身上發現過它們吸盤留下的傷痕。
戴維·瓊斯命令挪威海怪攻擊商船，巨大的觸手瞬間將船摧毀，而威爾則趁亂利用主角光環，潛入水中逃走了，他不知道的是，此時在黑珍珠號上，有人試圖給他戴綠帽子。
為什麼傑克的羅盤會失靈，伊莉莎白戳穿了傑克內心的秘密，因為你內心善良且正義，但你自己不願意承認而已，於是她主動誘惑傑克，就在傑克要上鉤時他看到自己收手上的黑斑，瞬間沒了心情，伊莉莎白覺得自己猜對了，她以為傑克真特麼是正人君子，內心對他產生了好感。
伊莉莎白利用傑克的羅盤帶眾人來到一座小島，在這裡他們挖出了聚魂棺，但伊莉莎白卻發現手中的羅盤一直指向傑克，她懷疑自己喜歡上了傑克，正在苦惱時，威爾出現在她身後，原來，她內心一直是想找威爾，所以羅盤才會帶她來這裡。
而威爾是趴在木板上，順著洋流漂到了這裡，傑克問他你怎麼逃出來的，威爾說我學你的啊，把兩隻腳綁在海龜上！
威爾拿出鑰匙準備打開聚魂棺，他要殺死戴·維瓊斯，傑克與諾靈頓阻止了他，傑克想用心臟作為籌碼和章魚哥換取自由，諾靈頓則想把它交給貝克特勳爵，讓自己官復原職，三人一言不合打了起來。
禿子和獨眼以為箱子裡裝的是什麼值錢的寶貝，看他們搶的那麼起勁，決定幫他們解決問題，而此時戴維·瓊斯的蝦兵蟹將也找到了這裡，他們久違的登上十年一次的陸地，與主角團進行了一場精彩絕倫的追逐大戰，傑克趁機搶到了鑰匙和箱子，打開箱子後，裡面果然是一堆情書和戴維·瓊斯的心臟。
他急忙將心臟裝進了土罐裡，可螳螂捕蟬黃雀在後，諾靈頓則趁人不注意，將罐子裡的心臟，聯同那張私掠許可一起偷走了，傑克拿走了空罐子，蝦兵蟹將們則搶走了空箱子。
傑克帶著土罐回到船上，戴維瓊斯命令挪威海怪攻擊黑珍珠，傑克說，你丫把柄都落我手裡了！還這麼張狂！信不信摔了你的心！
本來是想嚇唬他的，結果不小心手一滑，咣當！罐子裡除了土，什麼都沒有，傑克心想完了！，眼看挪威海怪就要來了，於是他丟下眾人偷偷乘坐小船逃走了。
船上眾人利用大炮攻擊海怪的觸手，可這完全是螳臂當車！遠去的傑克回頭看見備受摧殘的黑珍珠，又看看手中的羅盤，他不願再欺騙自己，雖然他向來以玩世不恭與沒有責任感為榮，但這次，他選擇了不再逃避！
傑克回到船上，幫助眾人利用火藥桶加朗姆酒炸傷了海怪三隻觸手，海怪暫時退出戰鬥，可他們知道這並不能重創海怪，反而會激怒它，在它恢復戰鬥力以前，要趕緊乘小船逃走，
但伊莉莎白明白，海怪的目標是傑克，只要有他在，大家都不安全，於是他故技重施，一旁的威爾以為自己頭上長草了，看的一臉懵逼，
伊莉莎白則趁機將傑克鎖在桅杆上，並騙所有人說傑克自願留在船上，他要與黑珍珠共存亡，眾人聽後十分感動，然後加快速度逃跑。
船上的傑克心裡···，他利用燈油做潤滑劑擺脫手中鐐銬，但為時已晚，海怪已向他張開血盆大口，並噴出之前吃掉的帽子，傑克看大勢已去，於是帶上帽子，拔出戰刀，慷慨就義。
戴維·瓊斯看見傑剋死了十分開心，他打開聚魂棺，準備看看自己的戰利品，結果……皇家港內，諾靈頓將戴維·瓊斯的心臟交給了貝克特勳爵，而伊莉莎白眾人則來找女巫提亞·朵瑪，尋求幫助，女巫問他們，你們想救回傑克嗎？眾人欣然點頭，並稱以前錯怪了傑克，沒想到他是這麼大公無私的人。
女巫說，我有辦法幫你們救回傑克，但你們還需要一位船長，話音剛落，巴博薩吃著蘋果，從樓上走了下來。
為什麼已經死去的巴博薩會出現在這裡，誰給他續的命！
貝克特勳爵拿到心臟後會怎麼做？章魚哥戴維·瓊斯會聽他指揮嗎？
女巫提亞·朵瑪又有什麼辦法救回傑克！
下回我們細說，《加勒比海盜3世界盡頭》敬請期待！