海盜組織：海盜首領（老大）NEO，宇宙海盜的頭目，設定上是賽爾號海盜最大的反派，而且曾經和羅傑都有過大戰。但是在賽爾號的整個歷程上，他只出現了一次。首先我們先科普一下等級，既然已經是認定了的大BOSS。那麼最低也是元帥等級，以下還有將官設置:大將、上將、中將、少將（中國軍銜）。而現在從最近的中將艾伯、中將巴羅的實力來看，這個老大的登場會留在最後。單憑一個巴羅就能打的賈斯汀一行人天旋地轉，就更不用說今後出現的上將實力了。
NEO首次登場是在2010年主線，確切是賽爾號和海盜唯一一次開戰型的主線。海盜舉旗進攻賽爾號，而賽爾號也陷入了危機。在攻破了蠍子號、犀牛號之後，主艦幽靈號就待的是海盜首腦。在「決戰幽靈號」中，賈斯汀復活之後賽爾號全面進行反攻。NEO出場，它的出場顛覆了海盜這個搞笑團體，不再是打了就一定贏，任何時候賽爾號都不吃虧。瞬間出手就秒殺了好幾個士兵，賈斯汀出手。勢均力敵，平分秋色，誰也佔不到好處（賈斯汀當時的設定有200萬戰鬥力）。
接著艾裡遜想要偷襲的時候雷伊蓋亞登場，阻止了艾裡遜。NEO讓佐格向賽爾號開炮，這時候雷伊蓋亞拖住了NEO，現在想想，一個機器人能以一己之力力敵當時兩大巔峰精靈，可見有麼厲害。而從雷伊的「我們來拖住它」就能看得出來，它們二人也是吃不準能拿下這個海盜老大。
就在這個時間段，賈斯汀放出了他的「六劍齊發」攔截幽靈號炮臺。NEO分出神讓迪恩頂住，它讓迪恩來頂住，就是知道迪恩有那個實力，當然，迪恩當時的確是有著能跟站長五五開的水平。唯一讓它失策了的，就是迪恩的反叛。如果迪恩當時擋住了賈斯汀，炮臺發射成功，賽爾號重創。它們沒有了退路，只要成功擊破賽爾號，海盜也就算是成功了。迪恩沒有擋攻擊讓戰局失衡，NEO撤退。此次大戰是NEO輸在了迪恩這個多重間諜的手上。
最後海盜主線落幕的時候，「你以為你們這樣就能捉住我嗎？呵呵！相信我們很快就會見面的！今天的一切！我一定會討回來！」——NEO。等到它這個王牌登場的時候，不知道又會拿著怎樣顛覆宇宙的實力再次出到我們的面前。
創世之神：創世六神兵、創世兵魂、奧斯卡的主宰。創世六神兵是我們接觸最多的一個，它們的實力要弱於神域四天王，但是後期的時候有所提升。後來創世兵魂融合後重生再給創世精靈這一族又添了新的戰力，爆發後的創世兵魂實力更是強勁。比起監管者奧斯卡強的不是一星半點，主線走到更強大、更遠古的時期。喚醒索倫森、譜尼、奧斯卡、幽靈血手阿斯狄等一系列無間境地的存在。後來化解了泰坦星系的危機之後沉寂，直到永恆之樹受到影響的時候它再次出現。
在魔靈王·斯摩亞蒂重新復甦之後，抽取了永恆之樹的能量，將史萊姆國王也混沌化了。它感受到了魔靈王的意圖之後，開始做起了防禦措施。在魔靈王到達永恆星的那一刻，創世兵魂就已經知道它此行的目的是「創世之鐘」了。在完全突破的情況下，依舊還是抵抗不了得到逝者巨樽的魔靈王，最後引爆永恆星重創魔靈王。創世所有直系精靈落幕，唯獨一開始就掛在嘴邊的「傳世之神」到現在也沒有出現。而從譜尼、魔靈王這些骨灰級的存在就能多多少少知道，創世之神並非只有這麼簡單。
如果這樣盤算創世之神的力量程度，最起碼它也是有著年費至尊實力的。
邪靈組織：威斯克所在的組織。威斯克直到最後一刻還在阻止譜尼和這些凡域的精靈進入第六星系，它也是組織中的一顆棋子而已。而它深知邪靈組織有多麼厲害，才會如此執著。從它和大暗黑天、奧古斯特的野心就能看出來它不是一般人。在整個大暗黑天，論精靈手下，最多的是它，玩的最大的也是它，如果不是譜尼、奧斯卡、邁爾斯同時站在一起，可能它還會想著背水一戰。
上古時期就佔據了一席之地稱霸一方，後來不知道什麼原因來到凡域，殺了布萊克一家。最後布萊克一家只剩下它和它的叔叔（斯摩亞蒂），兩人各自流落。布萊克則是通過索蘭特加入了邪靈組織，後來蟄伏在威斯克手下做了二當家。第一次落敗之後威斯克失蹤，第二次歸來帶著三煞，三煞也不是一般精靈。第三次則是喚醒忠實的手下邪靈五帝，從它們五人對威斯克的態度來看，就是索倫森和暗黑戰聯的關係。只不過五帝擁有自己獨立的意識，是他們自己選擇的道路。
在梵天、泰坦這些上古精靈登場之後，威斯克才做收斂。之前奧古斯特曾說它只想要一個赫爾卡星而遭到威斯克的諷刺，它是經歷過大風大浪的人，凡域的東西它是真的看不上。而威斯克則是「邪靈組織能屹立至今，就是因為我們的野心並沒有超出我們能力的極限。而我接到的指示，只是毀滅五大星系而已。」
如此的邪靈組織，這也是威斯克為什麼在大暗黑天一直是處於一個智囊的原因了。畏畏縮縮被天邪直接戳中痛點，它才會勉強使出一些力量。因為在威斯克心中，可能大暗黑天只是暫時的一個寄身之所，而邪靈組織才是它想要待的地方，只不過它任務失敗根本不敢再單人回到組織。
神秘人：給予墨杜薩石化之眼的神秘人。第一次墨杜薩擁有石化之眼的能力是擁有石化之匙的原因，而在墨杜薩失去石化之匙後它就失去了石化的能力。墨魯薩跟墨杜莎曾是戀人關係，當初因為一把鑰匙，在墨杜莎看到墨魯薩之後，墨魯薩被永久石化。於是墨杜莎因為這個原因而憤怒，將周圍的所有精靈全部石化，而自己也化為了一座石像。後來石化之匙的主線解除，它也回歸了正常的生活，甚至跟隨賽爾號一切決戰吒克斯。
但是這一次，這個曾經讓它有了石化之眼的神秘人又再次現身，是不是又揭起了千年赫爾卡之謎？而這個神秘人，是怎樣擁有了這八把鑰匙？而這八把鑰匙孕育出的魔王吒克斯，又到底在那個平行宇宙有著怎樣的情節？坑，還是埋下了！
神秘光團：其能力絕對不會比譜尼弱多少，賦予了波西麗亞進化的力量。現在的波西麗亞實力強悍可以說是目前聖光聯軍次時代最強戰力，譜尼下來就是它。這個從雷伊聯手阿克希亞才勉強擊退掃蕩之鋒就能看出來。波西麗亞單挑隕星議會單人成員完全處於上風，瞬間擊敗雜兵，單手擊退葬生之蓮、收復羅格星系等等，說明她的強大。
而給予波西麗亞力量的這個光團，更為神秘。它並不是以形體出現的，如果腦洞和設定大一點的話，完全可以說這個只是一個能量分身而已。像這樣的分身完全可以有成千萬計。現在唯一可以確定的就是，它是屬於正義一方的。