在《終極筆記》最後的劇情中，吳邪因為失誤，將錯誤的密碼發給了小哥和胖子，導致他們進入了一個錯誤的地方，吳邪發現之後愧疚不已，也非常想要將他們找回來。雖然在後面的劇情中，胖子和小哥的確是都出來了，但他們是怎麼出來的呢?為什麼他們能夠安然無恙的走出來，他們經歷了什麼呢？
1、吳邪發現密碼錯誤
由於大量屍鱉王趕了過來，吳邪他們拼命在鐵鏈上做了記號後準備脫身離開，可意外總有發生，之前那個神秘人又出現了，黑眼鏡以一人之力拖著那人跳入了鐵盤下，並讓二人封住了祭盤，還說自己一定能出得來，吳邪他們雖心痛，可不得不照做。
第三張照片順利傳到了巴乃，霍老太見最後時刻已經到來，整裝隊伍也要進山，霍秀秀軟硬兼施想跟著奶奶一起去，可還是被迷暈後甩下來，關在了一個木屋裡，霍老太知道，此去九死一生，不能讓自己這個孫女跟著冒險。
巴乃羊角山內，胖子他們已經快要被凍成了冰棍，等了許久，終於等來了霍當家，對方恭敬地把照片交給了吳邪。
小花這邊把照片發給巴乃後，卻發現好像有什麼不對，有塊石頭崩了下來卡在縫裡，對應的石塊沒有被推出來，可小哥這邊，他們已經打開石門進去了。「塌肩膀」默默注視著那群人，這次卻沒有跟進去。
2、吳邪假扮成三叔
來找二叔的不止吳邪自己，還有小花，小花感慨三叔心可真夠狠的，處心積慮引吳邪入局，自己卻來了一招「金蟬脫殼」，估計想要再一次擺脫「它」的控制，可只要吳三省和解連環中的一個人還活著，「三叔」寫個身份就不算死，總還是身在局中。
三叔已經消失許久，霍老太生死未卜，九門一代二代都折在了「它」的手裡，解雨臣終於拿出了一樣東西：一張酷似三叔的人皮面具，只有這樣，才能干擾「它」，「它」不是一個人，不是一支隊伍，「它」是這些年來想要獲得長生人的總和，無論是多年前的考古隊，還是吳邪他們西行的那支考察隊，「它」一直無所不在。
現在看來，三叔好像沒有真的存在過一樣，他總是藏在事情背後，他只是一個身份，一個嚮導，一個帶吳邪入局的人，九門選中了吳邪，從小他的成長經歷被刻意模仿成了別人，吳邪他沒得選，不得不戴上人皮面具，成為了「三叔」，或許，被替代，也是某種意義上的長生吧。
人皮面具只能維持四周，這一切的謎團都還沒有解開，一切的答案都在張家古樓裡，眾多同伴生死未卜，從前的，現在的，他從未覺得如此孤獨，可吳邪不能停下來，為了九門，為了三叔小哥他們，他要再次踏上這條自己選擇的路。
3、終極筆記大結局的遺憾
結局第一大遺憾：黑瞎子生死不明
在結局中，吳邪和小花被霍老太太安排去了四川的四姑娘山墓，遇到了霍老太太安排的另一個幫手黑瞎子。小花和吳邪最後破解了三道機關的鑰匙，黑瞎子為了掩護小花和吳邪逃跑，又是跟屍蟞鬥，最後拉著黑毛怪一起同歸於盡了，小花竟然為黑瞎子流淚了。
到結局黑瞎子是死是活也沒交代清楚，黑瞎子到結局都沒出現，雖然我們知道黑瞎子不會這麼容易死的，在《沙海》中還能看見黑瞎子。但是在結局中黑瞎子生死不明，也是一大遺憾。
結局第二大遺憾：小哥和霍老太太等人下落不明
因為吳邪破解的第三道密碼是錯誤的，霍老太太拿著密碼圖片給小哥，結果打開了張家古樓的第三道石門，密碼錯了還進去了，吳邪知道小哥和霍老太太因為自己會遭遇危險而自責。
到結局也沒交代小哥和霍老太太的下落，反而都是一些回憶和無關緊要的人。看完這樣的結局，心理落差真的很大，追完36集真的是看了個寂寞。