螺杆空壓機運行過程中，壓縮空氣中的水分很容易凝結在油氣分離器中，引起設備故障。因此需要定期排放空壓機系統中的冷凝水尤其在天氣潮溼或溫度高時冷凝水會產生更多，這時就需要增加排放次數，以保證正常工作。
油中含有過多的水分將會造成潤滑油的乳化，影響機器的安全運行，主要會造成壓縮機主機潤滑不良，同時會使油氣分離效果變差，引起空壓機部件鏽蝕。
因此，在注意潤滑油補充或更換的同時，也要注意經常排放冷凝水，應根據溼度和溫度情況制定冷凝水排放時間表。
一般情況建議螺杆空壓機每周排放一次，在高溫或高溼度氣候下應2-3天排放一次。而冷凝水的排放需要在空壓機停機、油氣分離罐內無壓力、完全冷卻、冷凝水充分沉澱後執行，開機前便是很好的時機。首先擰開油氣分離罐底部的球閥前螺堵，再慢慢打開球閥排水，然後便會有油流出，關閉球閥，最後擰上球閥前螺堵。冷凝水的排放即可順利進行，而現在很多設備都在使用電子排水器了，相對人工來說，方便快捷。