到第四次忍界大戰爆發時，鼬與長門一同被穢土轉生招出，成為兜的棋子，忍者聯軍的敵人。巧的是，他們遇到的第一個對手就是鳴人，於是當年埋下的暗線別天神還沒來得及作用於佐助，就先幫助自己擺脫了穢土轉生的控制，鼬開啟萬花筒寫輪眼時，，鳴人體內封印別天神立刻發動，「守護木葉」的意志覆蓋了穢土轉生的指令，鼬以自由之身的狀態復活。
兜趕緊全力控制長門，使用佩恩六道的術，想要抓住九尾和八尾，危急時刻，鼬開啟須佐能乎，救下二人，長門立刻使用地爆天星，鼬判斷這個奇點就是地爆天星的弱點，於是使用八坂勾玉，聯合鳴人的螺旋手裏劍和八尾的尾獸玉，打破了地爆天星。煙霧中，一把長劍刺出，正是須佐能乎的十拳劍，即使穢土轉生是不死之身，也無法抵抗十拳劍的封印，長門被封印到葫蘆裡陪大蛇丸了。
白蛇仙人模式下的兜鼬意識到穢土轉生這個術對於戰局的影響，之前被兜操縱時，鼬已經清楚的掌握了兜的方位，於是立刻前去阻止穢土轉生，在路上，他偶遇弟弟佐助，看佐助這一副活見鬼的表情還挺喜感。兩兄弟邊走邊聊，兜渾然不知兩個殺星正衝自己過來。
看著面前的鼬，兜雖然慌的一批，但還是故作鎮靜的說「能夠停止這個術的只有我，一旦殺了我，這個術就再也無法停止」而鼬表示，只要用月讀控制你解除穢土轉生就可以了，兜:「......」
鼬與佐助兩兄弟終於並肩作戰宇智波鼬與佐助這兩兄弟終於聯手站在了一起，共同對戰獲得白蛇仙人之力的兜，時光仿佛回到了他們小時候打野豬...不過兜封閉了自己的視覺，使他免疫幻術，而且鼬和佐助不能直接殺死兜，因為必須留著他解除穢土轉生，而由於仙人體的恢復能力，僅僅打傷他也沒有意義。兜信心滿滿，不過鼬擁有無需通過視覺施加的究極幻術，決定命運的禁術—伊邪那美，代價是永遠失去光明，這個術並不像月讀或別天神那樣看一眼就能瞬間釋放，而是需要與對方戰鬥一段時間，把戰鬥中的動作、體感、環境等關鍵信息的記錄下來，建立一個閉合的循環，用萬花筒的瞳力將起點與終點連結，中術者無論在過程中怎樣行動，都會經歷起點與終點的收束，效果類似電影「恐怖遊輪」中的無限循環。
伊邪那美的光芒，兜戰敗伊邪那美的光芒控制了兜，鼬掰開他的眼皮，對其施展了月讀，解開了穢土轉生之術。此時戰局正是白熱化，忍者聯軍難以應付不死的穢土轉生大軍，五影也無法抵擋穢土轉生的斑，岌岌可危，而鼬此時解開穢土轉生，一口氣解決了除斑之外復活的全部敵人，上萬亡者大軍瞬間只剩斑一人，徹底逆轉了戰局，而鼬由於也是穢土轉生之軀，所以也會一同消散，在升天之前，鼬用月讀告訴了佐助一切的真相，從宇智波計劃叛亂，到止水獻出眼睛，再到木葉高層的屠殺指令，以及團藏以佐助為籌碼的交易，還有他的父母死前的覺悟，鼬終於決定讓佐助自己選擇道路。
鼬終於告訴了佐助一切真相宇智波鼬的人生充斥著矛盾，他的思想看似超然於世，為了大體和平不惜犧牲家人和自己，但從止水、佐助身上又能看到他對小愛的執著，就拿佐助來說，鼬一邊愛著他保護著他，一邊又用謊言引導著他，想讓他永遠不明真相，徹底站在自己的對立面，卻反而使他誤入歧途。穢土轉生再度復活後，終於改變了教育方法，讓佐助自己選擇道路，至於滅族這件事，觀眾朋友們可以自行判斷，大概正如止水告訴鼬的那句話，忍者，是在黑暗中支撐和平的無名者，這可能也是他沒有記恨團藏的原因吧。
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