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醫學英語:RNA幹涉的重要詞彙
2013-01-14 18:31
來源:外語教育網
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Argonaute (AGO):一類龐大的蛋白質家族,是組成RISCs複合物的主要成員。AGO蛋白質主要包含兩個結構域:PAZ和PIWI兩個結構域,但具體功能現在尚不清楚。最近的研究表明,PAZ結構域結合到siRNA 的3'的二核苷酸突出端;一些AGO蛋白質的PIWI結構域賦予slicer以內切酶的活性。PAZ和PIWI兩個結構域,對於siRNA和目標mRNA 相互作用,從而導致目標mRNA的切割或者翻譯抑制過程,是必不可少的。同時,不同的AGO蛋白質有著不同的生物學功能。例如,在人當中,AGO2「籌劃」了RISCs對於目標mRNA的切割過程;而AGO1 和AGO3則不具備這個功能。
Core RISC:是介導目標mRNA切割過程或者翻譯抑制的最小的RNA-蛋白質複合物。在人和果蠅身上發現的分子量少於200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白質和Core RISC密切相關。
Dicer (DCR):是RNAase Ⅲ家族中的一員,主要切割dsRNA或者莖環結構的RNA前體成為小RNAs分子。對應地,我們將這種小RNAs分子命名為siRNAs和miRNA. Dicer有著較多的結構域,最先在果蠅中發現,並且在不同的生物體上表現出很高的保守性。
Holo RISC:是在果蠅中發現的有著RISC活性的最大的RNA-蛋白質複合物(80S)。Holo RISC的生物學活性牽涉到幾乎所有的RISC的成員,RLC成員,和一些其他通路上的蛋白質分子。Holo RISC的存在,表明了RISC組裝不是孤立的,同時還是一個有序的過程。以RISC為中心的RNAi和miRNA通路與一些其他的通路密切聯繫,很可能藉此調控生物體的生長發育過程。
Microprocessor:一種核內的複合物,主要由Drosha和Pasha兩者組成,在miRNA的生物合成中促使原始的miRNA成為miRNA前體。
MicroRNA (miRNA):是含有莖環結構的miRNA前體,經過Dicer加工之後的一類非編碼的小RNA分子(~21-23個核苷酸)。MiRNA,以及 miRISCs(RNA-蛋白質複合物)在動物和植物中廣泛表達。因之具有破壞目標特異性基因的轉錄產物或者誘導翻譯抑制的功能,miRNA被認為在調控發育過程中有重要作用。
RISC loading complex (RLC):是一種促使RISC形成的複合物。RLC有方向性地調節小RNA雙螺旋,為以後的RISC組裝作好鋪墊。最近,siRISC loading complexes (siRLCs)在果蠅中研究最多。有研究者認為在果蠅中的siRLCs包含DCR2-R2D2異型二聚體和siRNA雙螺旋;R2D2部分是非對稱性的感受器,為RISC組裝調整好siRNA的方向。miRISC loading complexes (miRISCs)的研究尚未報導,因為它的過程更為複雜,而且體外研究miRLCs的方法還沒有建立。
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing (RITS):是一種組織染色質變型的複合物。RITS複合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白質,通過結合到異染色質的基因池上來促使異染色質上基因的沉默。
RNA-induced silencing complex (RISC):一種RNA-蛋白質複合物,通過與目標mRNA完全或者部分的互補配對來實施切割或者翻譯抑制功能。SiRNA組裝siRISC, miRNA組裝miRISC.RISCs(無論siRISC還是miRISC)包括兩種類型:切割型和不切割型。現在的研究表明,RISC當中的AGO蛋白質決定了RISC是切割型的還是不切割型的。
Slicer:在切割型RISC中的內切酶的另外一種表述方法。
Small interfering RNA (siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。
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