牛頓晚年時科學已經研究到了盡頭，他為什麼不去研究哲學而去研究神學？牛頓那是在力學裡確實已經研究到那時的盡頭了，那他為什麼不轉去研究哲學而是研究神學呢？因為他一輩子研究的就是哲學……他用以奠定科學地位的最重要一本著作的名字就叫《自然哲學的數學原理》……
我們現在把它翻譯成物理，但在當年，他把它稱為自然哲學。而牛頓正式把數學帶入了自然哲學裡面，成為了我們現在所說的自然科學。現在，一套理論無論在邏輯上多麼有道理，如果它不包含數學，那麼它就不是一套自然科學的理論。數學作為自然科學的一個重要判定標準。
因此，今天如果某一套理論，特別是一些宗教理論表示它很符合科學，那麼你只需要問問他們你們的方程在哪裡？公式有哪些？如果沒有，那它就只算是一套哲學理論，而非科學理論。
所以說，牛頓畢生所研究的就是自然哲學。但是畢竟自然哲學跟我們平時所理解的哲學是不一樣的。我們理解的哲學應該是像老子、釋迦摩尼、蘇格拉底、柏拉圖、笛卡爾、尼採……這樣的沒什麼根據的胡思亂想……
然而老子和釋迦摩尼的哲學思想最後都發展成為了宗教……而當年牛頓本身就有宗教信仰，他何必還有去另搞一套呢？他所信奉的基督教信仰裡本身就包含了大量的哲學思想。因此牛頓把相當大的精力用在了研究基督教神學上，據說他曾根據聖經推算過地球的年齡……
另外有一點是經常讓人誤會的，很多人以為牛頓是晚年才研究神學的，但實際上神學研究貫穿在牛頓的整個科研人生。在30歲不到的時候，牛頓已經編寫了一系列基督教神學的小冊子了，在完成他的扛鼎之作《自然哲學的數學原理》後牛頓就專注於基督教聖經的神學研究，這時他也就40歲多一點，剛過了半輩子。
牛頓一生寫過大約150萬個單詞左右的神學研究的手稿，不過很大一部分並沒有發表。另外由於其非主流的神學思想，在當時並沒有像他的科學思想一樣被廣泛接受，因此雖然他的神學著作並不比他的科學著作少，但他在神學研究領域卻寂寂無名，甚至我們現在都很難看到他的神學著作。
牛頓研究神學自然有他的歷史原因（基督教信仰主導的社會環境），也與個人信仰有關。另有一個原因，就是正如題目所說的，他把科學研究完了，閒得慌得找點別的事幹。在牛頓看來上帝在創造宇宙的時候只需要推一下，宇宙就可以按照物理規律自然地運行，無需上帝繼續維持，但當時的宗教神學認為上帝一直在維持宇宙運行。其實現在牛頓的說法顯然更符合聖經，因為創世記記載上帝用六日造天地以後第七日就安息了，所以我們就有了周末……如果造好後還要一直維持哪還能安息呢？所天才就是天才，業餘搞搞也能秒掉神學家。