近年，隨著中國經濟社會迅猛發展，老齡化社會慢慢逼近，人們對臨床營養需求不斷增加，特殊醫學用途配方食品（簡稱「特醫食品」）潛在市場巨大，受到社會廣泛關注。國外長期的使用資料表明，特殊醫學用途配方食品在患者治療、康復及機體功能維持過程中起著極其重要的營養支持作用。
外科病人在治療過程中，常會有一些疾病妨礙食物的攝入，或影響食物在胃腸道的正常消化吸收，伴有營養不良和免疫功能低下的情況。生物活性肽營養全面、食用安全，用於外科手術，可提高機體免疫力，在一定程度上減少炎症反應，起到提高免疫力的作用，預防腸源性感染和器官功能衰竭。生物活性肽還可以直接滲入皮膚底層，且與周圍組織的親和性好，可協助細胞製造成膠原蛋白，促進皮膚細胞正常生長。同時，膠原蛋白本身還具有消炎、更新肌膚和促進生長因子表達的作用。
妊娠是一個複雜的生理過程，孕婦在妊娠期間需要進行一系列的生理調整，以適應胎兒在體內的生長發育、吸收母體營養及排洩廢物。孕期時的營養情況對後代的生長發育具有重要的影響。孕期母親嚴重營養不良，可引起流產、早產和胎兒體格生長以及腦發育的遲緩。且孕期母親抵抗力較弱，在細菌感染後易使胎兒發育受阻，導致胎兒先天畸形。
所以在產後服用小分子生物活性肽可為機體提供豐富的營養，加速傷口的癒合，使傷口表面光滑無結痂，並且增加了皮膚的抗拉力，減少再次懷孕胎盤前置的風險，使產婦全身都有一個較好的改善。
高血壓作為心腦血管疾病的導火索，已經讓2億中國人時刻處在危險之中，腦卒中的50%-60%，心肌梗死的40%-50%的發生與血壓升高有關，高血壓還會增加腎臟疾病的危害。生物活性肽中的抗高血壓肽是天然的血管緊張素轉化酶抑制劑，降壓效果溫和，專一。作用持久。除此之外，抗高血壓肽還有抗氧化功能，減少過氧化和炎症反應，減低心、腦、腎等的損傷。而且，而且抗高血壓肽多以食品為原料，消除了人們對服用合成藥物安全性的考慮，沒有毒副作用。
目前治療糖尿病的藥物以化學合成的為主，如二甲雙胍、格華止、美迪康等，這些藥的毒副作用較大，常見的有肝臟損傷。昏迷、腹瀉、低血糖等。小分子活性肽用於糖尿病患者可以：
高脂血症是各種原因導致血漿中的膽固醇或甘油三酯水平升高或兩者都升高的一類疾病。高血脂是動脈粥樣硬化的首要危險因素、與冠心病、腦血管病發病率有直接關係。改善高膽固醇脂血症最好的方法就是降低肝膽固醇的合成和小腸的吸收，小分子活性肽用於高血脂症：
對膽固醇正常的人無降低作用，但可防止食用高膽固醇食物後血清膽固醇的升高。緊身脂肪肝的生產。
我國現約有9000萬骨質疏鬆症患者，其中骨質疏鬆發生率佔60歲以上老年人的56%，在絕經後婦女發生率更高，約為60%~70%。骨質疏鬆症的表現主要為疼痛，身材變矮，最常見的併發症是骨折，輕微外力即可導致骨折，如咳嗽可發生肋骨骨折。60歲以上老年人骨質疏鬆並發骨折者高達12%。輕者可使活動受限，重者需長期臥床，給家庭和社會造成很大負擔。
生物活性肽用於可以促進鈣等礦物質的吸收，同時補充合成骨骼框架膠原蛋白的原料，讓鈣質沉積在上面，增強骨密度。生物活性肽從細胞層面還可以抑制破骨細胞的活性，有利於骨重建的正向平衡，從而保護骨的微觀結構。
老年痴呆是高級認知功能障礙為特徵的神經退行性疾病，包括大家熟知的阿尓茨海默病和血管性痴呆。隨著我國老齡化社會的來臨，老年痴呆的知曉率和發病率也逐年上升。老年痴呆的發病機制很複雜，目前認為和遺傳、環境、代謝和基因突變等有關。
近年來，隨著對生物活性肽研究的深入，各種內源性、外源性的生物活性肽在老年痴呆的防禦上逐漸得到重視。海洋膠原蛋白、神經生長因子等均發現對老年痴呆有預防和防治作用，例如海洋活性肽可以提高機體免疫力，防治海馬神經元的丟失，促進神經營養因子的表達，改善學習記憶能力。
腫瘤是一種常見的疾病，嚴重威脅著人類的健康和生命。腫瘤的病因及其複雜，其發生是外因和內因等因素共同作用的結果。許多天然及人工來源的腫瘤抑制肽可通過直接抑制腫瘤生長工作、抑制腫瘤新生血管生成，激活機體免疫系統，抑制腫瘤、抗氧化與抗輻射損傷等方面發揮抗腫瘤作用。利用生物活性肽長期幹預可降低腫瘤的發展速度和致死率。
日常中我們常見到的肝損傷有脂肪肝、肝纖維化、肝硬化和肝癌。但是現在臨床上對肝疾病的治療並沒有取得十分滿意的成果。但是生物活性肽在治療肝損傷患者已有部分經驗且取得良好的效果，例如穀胱甘肽等。現代研究證明肽可以促進乙醇代謝，減低血液中乙醇水平的作用；海洋動物肽可以減輕乙醇對幾天抗氧化系統的損傷，可以在一定程度上矯正機體的氧化應激和脂肪過氧化狀態。
總之，從發展前景來看，生物活性肽不僅具有良好的營養特性，而且具有多種生物學功能，無論是藥品還是保健品，生物活性肽對肝病病患者具有重要的意義。
人類的生長發育周期是個多環節、精密調控的過程。生物活性肽對生長發育的影響通過臨床前研究得到廣泛的證實。已經發現的作用包括：促進體格發育，包括體重、身長增長和食物利用率等；促進免疫系統的發育，增強發育中個體的免疫力；調節腸道菌群，促進益生菌的生長；還可以促進礦物質吸收和骨骼當中給的沉澱，促進骨骼發育，促進神經行為的發育等特點。由於生物活性肽營養豐富，可以促進生長發育，所以現在在嬰兒配方奶粉中也有肽類物質的添加。
真皮結構的改變是皮膚衰老的主要原因。衰老過程中真皮層膠原蛋白含量減少，真皮層厚度變薄，膠原纖維斷裂和交聯增加。研究表明在膳食中長期補充膠原蛋白，可以促進皮膚膠原帶白基因的轉錄和蛋白的表達，使皮膚膠原含量增加，並抑制衰老皮膚中過氧化產物的生成並抑制金屬蛋白酶對皮膚膠原蛋白的分解作用，從而對皮膚的自然衰老表現出一定的抑制作用。由於生物活性肽具有分子量小、易吸收，具有較好的穩定性和可溶性等特點，作為功能性食品與化妝品的功能因子及作為皮膚美容保健與治療手段方面已經得到了廣泛的應用。