Material Studio材料計算的工作站配置方案

2020-12-05 中關村在線

    Materials Studio是一套材料科學的仿真軟體， MS是在化學和材料領域，為結構和計算器研究者所設計的專業仿真軟體，提供用戶流暢的操作接口，並包含完整的運算方法，讓使用者容易上手並提供功能強大的仿真能力。

研究者通過MS提供的先進豐富多種算法進行綜合分析計算，在性質預測、聚合物建模還是X射線衍射模擬，通過一些簡單易學的操作來得到切實可靠的數據。協助科學家解決重要問題，研發世界上最先進的材料。


XASUN當今世界唯一能提供塔式、機架、可攜式、特種結構等規格，提供單路、雙路、四路、八路最先進架構的高端圖形工作站，XASUN緊隨世界領先的intel和AMD的計算處理硬體主流技術, 和Nvidia和ATI高性能圖卡以及一流的硬碟陣列技術，打造出具有超級性能的XASUN圖形工作站和伺服器，同時充分了解不同行業應用軟體的計算特點，靈活方便的配置架構，使應用軟體在任何一臺支持基於Windows、Linux等主流作業系統的伺服器或工作站上最高效率的進行運算，從而最大限度的發揮工作站硬體性能和網絡資源。

分子模擬（材料計算）求解過程計算特點分析

 

    主要集中在對CPU和內存方面，MS軟體支持主流CPU的多核並行計算，在一個架構裡，頻率越高，核數，計算速度越快，內存方面主要體現在計算的規模上，隨著對自然世界的深入了解和分析，分析精度越來越高，計算量也越來越大，對內存的要求也在不斷遞增，由於求解運算過程中大量時間都在計算中，對顯卡的要求自然不高，圖卡主要是後期對數據的可視化有些需求，另外MS軟體運算特點是將數據一次性放到內存進行密集計算，自然對硬碟外設的讀寫不是很頻繁，傳統上SATA接口也足夠了，如果內存不夠，虛擬內存很大的話，推薦SAS硬碟，當然將來SSD便宜下來，內存和虛擬內存的比例1：2，可以考慮採用SSD硬碟

 

硬體配置關係注意事情:

1．  經過廠家推薦，目前12核不建議使用，8核Xeon架構效率更高

2．  CPU—內存關係，  1核---對應配置---2G~4G, 8核處理器對應內存16GB~32GB.

3．  顯卡要求不高，針對不同的計算規模，配置相應檔次圖卡，滿足後期數據可視化需求。

4．  硬碟IO在計算過程中，影響不大，資金充足的話，視多種計算軟體， SAS 6Gbps是目前相當不錯的選擇

   

XASUN圖形工作站配置方案

 

MS軟體配備豐富的應用功能模塊，硬體如何配合好所有軟體模塊，非一般經驗的硬體工程師所能了解的，今天我們對計算規模按原子數量初步劃分，大致分三個檔次：

 

1．  小規模計算工作站配置方案

定位：原子數不超過100個求解規模

推薦：4核Xeon 3470（2.93G）/16GB/Quadro600/1TB SATA

 

機器型號  XASUN T5 12912-T1AA

主要配置

4核Xeon 2.93/12GB/QadroFX3800/300G SAS

硬體配置明細

　

配件

品牌和型號

數量

CPU

4核Xeon X3470

1

2.93G/8MB/超線程/睿頻

晶片組

intel S5520 Chips

1

內存

2G DDR3 1333 Reg ECC

6

顯卡

Nvidia Quadro 600 1GB

1

系統盤

1TB SATA企業級

1

光碟機

DVD刻錄機

1

網卡

千兆以太埠

2

工作站平臺

XASUN SSIEC105P7S （700W EPS）

1

顯示器

優派23"專業顯示器

1

噪音控制系統

靜音級(全速計算45分貝以內)

　

硬體性能指標

CPU

運算速度每秒469億次

GPU

幾何三角形處理:2.1億/秒，支持1*2

　

單屏幕，最高解析度 2560*1600

　

幾何三角形3億/秒，像素填充率380億/秒

　

支持32X全景反鋸齒(FSAA)

　

支持30位色彩精度

　

　

1GB GDDR3顯存

　

硬碟

IO讀寫帶寬100MB/S，IOPS 200次/秒

網絡埠

通過匯聚功能，實現2Gbps

硬體升級能力

　

　

CPU

支持Xeon3400全系列

顯卡

支持Nvidai Quadro和ATI Firepro 系列

內存槽

6個，單根內存最大4GB，最大容量24GB

硬碟位

4個，單塊最大SATA：2TB

PCI擴展

1*PCIE x8,2*PCIE x4,3*PCI-X

作業系統

　

　

支持Windows Server 2003、2008

支持Windows XP、Vista、7

支持Redhat、Suse Linux全系列

應用軟體

　

　

基於windows、linux環境下軟體全系列

報價

￥26,800元

 

 

2．  中大規模計算高端圖形工作站配置方案

應用定位：原子數100~1000個之間求解規模

推薦：8核Xeon X5677（3.46G）/24GB/quadro2000/1TB SAS

如果從軟體和硬體的價格對比，買一臺配置最高的圖形工作站，是最好的發揮軟體性能的不二選擇。

 

機器型號  XASUN T5 23524-A1AB

參考配置：

硬體配置明細

　

配件

品牌和型號

數量

CPU

4核Xeon X5677

2

3.46G/12MB/6.4GTs/超線程/Turbo

晶片組

intel S5520 Chips

1

內存

4G DDR3 1333 Reg ECC

6

顯卡

Nvidia Quadro 2000 1GB

1

系統盤

1TB SAS 6Gbps

1

光碟機

DVD刻錄機

1

網卡

千兆以太埠

2

工作站平臺

XASUN SDA6C105PAS （1000W EPS）

1

顯示器

可選

 

噪音控制系統

靜音級(全速計算45分貝以內)

　

硬體性能指標

CPU

運算速度每秒1107億次

GPU

幾何三角形處理:4.1億/秒,

　

最高解析度 2560*1600

　

192個流處理器, 1GB緩存,64X反鋸齒

硬碟

IO讀寫帶寬100MB/S，IOPS 200次/秒

網絡埠

通過匯聚功能，實現2Gbps

硬體升級能力

　

　

CPU

支持Xeon5600全系列

顯卡

支持Quadro FX全系列，支持雙Quadro Plex

內存槽

12個，單根內存最大16GB，最大容量192GB

硬碟位

4個，單塊最大SAS：1TB、SATA：2TB

PCI擴展

1*PCIE x8,2*PCIE x4,3*PCI-X

作業系統

　

　

支持Windows Server 2003、2008

支持Windows XP、Vista、7

支持Redhat、Suse Linux全系列

應用軟體

　

　

基於windows、linux環境下軟體全系列

報價

￥49,500元

 

 

3．  超大規模計算分布式集群伺服器解決方案

定位: 原子數1000個以上求解規模

下面的方案主要是基於辦公環境的計算應用，Xeon架構的計算機單機性能越來越強大，最新Xeon5600和單核時代的Xeon相比，快15倍以上，所以基於辦公環境的小集群（40核以內），放在辦公環境，計算性能滿足大部分應用，同時也便於維護和使用。

22U高度(4U*5+1U+1U)

 

集群方案：

管理節點配置：8核Xeon E5605（2.13G）/8GB/600G SAS+ 4*1TBSATA

計算節點配置：8核Xeon E5640（2.66G）/24GB/500G SATA

計算節點數量：4個

 

硬體參考配置方案

 

1．  圖形管理伺服器（管理節點）

機器型號：XASUN R5 22724-T8ARC

主要配置

8核Xeon 2.4/24GB/Qadro4000/600G SAS+8TB陣列

硬體配置明細

　

配件

品牌和型號

數量

CPU

4核Xeon E5620 

2

2.66G/12MB/6.4GTs/超線程/Turbo

晶片組

intel S5500 Chips

1

內存

4G DDR3 1333 Reg ECC

6

顯卡

Nvidia Quadro 4000 2GB

1

系統盤

600G SAS 6Gbps

1

超級陣列

1TB SATA企業級

8

　

8port SAS2-RAID

1

光碟機

DVD刻錄機

1

網卡

千兆以太埠(可選萬兆或IB卡)

2

工作站平臺

XASUN SA6R416PAS （1000W EPS）

1　

 

2 計算節點

機器型號 XASUN X5600 U22748AD

主要配置

8核Xeon 3.06/48GB/Qadro Fx5800+Gsync/300G SAS

硬體配置明細

　

配件

品牌和型號

數量

CPU

4核Xeon X5667

2

3.06G/12MB/6.4GTs/超線程/Turbo

晶片組

intel S5520 Chips

　

內存

4G DDR3 1333 Reg ECC

6

顯卡

集成

1

系統盤

500G SATA 

1

光碟機

DVD

1

網卡

千兆以太埠

2

伺服器平臺

XASUN SA6U416PAS  （1000W EPS）

1

 

3.伺服器集群設備匯總表

 

NO

品牌和型號

數量

硬體配置明細

圖形伺服器集群　

1.1

管理圖形存儲伺服器

1

1.2

計算伺服器（計算節點）

4

1.3

8口千兆交換機

1

1.4

8口 KVM切換器

1

1.5

22U機櫃

1

可選設備

1.6

IB交換機

1

1.7

IB卡或萬兆乙太網卡

1

1.8

穩壓電源（20KV）

1

1.9

 

　

集群硬體性能指標

CPU指標

浮點運算速度每秒3917億次

海量存儲

IO讀寫帶寬700MB/S，IOPS 400次/秒

網絡埠

通過匯聚功能，實現2Gbps

噪音控制系統

靜音級(全速計算45分貝以內)

合計

￥1,800,000元

 

 

XASUN圖形工作站簡介

 XASUN是當今市場唯一能提供塔式、機架、便攜、特種伺服器、工作站、圖形伺服器等全方面解決方案的品牌。

 擁有完整、完美、可靠、靜音的高性能計算機全套產品系列，為行業用戶提供超級強勁性能的計算解決方案專業、高效的定製工作站配置方案。

 

相關焦點

  • 量子化學計算(Gausssian)工作站硬體配置
    量子化學計算如何選擇工作站硬體配置量子化學計算由於分子的類型、體系和模擬算法，以及各種應用和精度要求，都有不同的計算特點，對計算機硬體（CPU、內存、硬碟、GPU）配置要求有很大的差異 ，那麼如何選擇好伺服器/工作站的硬體配置，提高計算速度，縮短求解時間
  • 大型Solidworks裝配設計與仿真工作站配置推薦
    大型Solidworks裝配設計與仿真工作站配置推薦 主要內容（一）三維設計與仿真計算卡頓、計算慢問題分析（二） UltraLAB圖形工作站件硬體配置2.1 大型三維建模工作站配置推薦2.2 大型裝配設計、仿真模擬工作站配置推薦（一）三維設計與仿真計算的卡頓、計算慢問題分析 Solidworks
  • 結構、流體、多物理場、電磁仿真計算完美硬體配置推薦
    UltraLAB 工程仿真計算工作站配置推薦3.1 UltraLAB工作站機型介紹3.2建模與求解專業硬體配置參考3.3 UltraLAB工作站建模、求解計算硬體配置推薦（一）有限元分析介紹有限元分析（FEA）藉助高性能計算機工具，用「數值近似」和「離散化」方法對真實物理系統（幾何和載荷工況）進行模擬，如求解結構、熱傳導、電磁場、
  • 直接材料成本差異(direct material variance)
    直接材料成本差異（direct material variance）     為完成實際產量或作為量所消耗的直接材料按實際成本計算與按標準成本計算之間的差額。　　直接材料成本差異按其形成原因可分為價格差異和數量差異兩種。
  • 寶德塔式工作站,解決設計煩惱!
    當其閃亮登場之時，首先進入人們認知層的，不僅是其雙路至強所賦予的超強的計算能力和高端Quadro專業顯卡所帶來的強大圖形性能，更不是其高速總線架構和ECC大容量內存所構成的高效能系統，而是其人性化、高密度可擴展的機箱結構設計。憑藉這種設計，用戶可以靈活的、快速的拆卸（或者升級更換）配件，可以熱插拔部分非關鍵的配件。這種設計確實夠酷炫，極大地方便了工作站用戶。
  • Material是「材料」,那「他是個讀書的料」英語怎麼說?
    Material是「材料」，這是它最基本的含義，引申一下，「料」的英語也可以直接說material。如果抓不準讀音的同學，記得右上角點擊一下小喇叭，聽一下它的發音喲。比如說一些做衣服的材料clothing material；或者是建築材料building material；再者只是簡單說原材料raw material；教學資料teaching material；
  • 惠普工作站和西門子打造工程設計IT利器
    對於專業設計人員來說，除了使用專業的設計軟體，硬體平臺的選取也至關重要，軟硬體產品的結合應用，決定了整個設計平臺的計算能力、穩定性以及運行效率。所以，只有將硬體軟體綜合考慮，才是建立製造業企業CAD設計平臺的正確思路。在當前國內製造業自主創新與產業升級的急切呼聲下，這種以信息化帶動製造業的發展的思路更具有現實的意義和可操作性。
  • 戴爾推出全新Precision工作站 專業人士好選擇
    小型輕薄移動工作站——Precision 5550及全新Precision 5750　　這兩款分別為15英寸和17英寸工作站，屏幕方面配置了縱橫比16：10的四面微邊框顯示屏，能夠實現最大的屏幕實際使用面積，並帶來更好的視頻會議體驗。兩款移動工作站的起始重量分別為1.8kg和2.1kg，屏佔比分別為93%和94%，輕量的鋁質機殼提高了便攜性。
  • 戴爾推出全新Precision工作站 為用戶帶來出色的沉浸式工作體驗
    同時，戴爾工作站提供包括VR虛擬實境創作領域以及AI智能應用場景在內的出色解決方案，為用戶帶來出色的沉浸式工作體驗，為每一個創意的誕生提供軟硬體和技術支持。與此同時，戴爾工作站在細節上持續創新，如塔式工作站免工具拆卸設計等，為用戶在移動和更換部件時提供更好的實際使用體驗，帶來更多隨心隨遇的配置選擇，靈活性不言而喻。
  • 超強悍配置i7工作站 戴爾M6500全國首評
    ，而且都定位於高端的遊戲、影音娛樂市場，而這次我們收到的這款來自戴爾的Precision M6500則是一款針對專業圖形處理工作領域推出的產品，這款目前性能最強的移動圖形工作站擁有了酷睿i7-820QM處理器、ATI FirePro M7740顯卡、4GB DDR3 133MHz內存等硬體組合而成的強勁配置，而承載這些硬體的則是一款17英寸的龐大機身。
  • 從入門到入土:個人深度學習工作站配置指南(保姆級教程)
    本章分為硬體、系統、DL開發環境配置以及工作站的維護幾個章節，希望能幫到大家，給大家做個參考。　　本文是我在組裝工作站過程中記錄的詳細操作流程，供有類似需求的同學參考~　　首先我們來看一下配置完後最終效果的視頻：　　　　2　　硬體篇　　2.1 工作站配置選型
  • 完善基礎硬體方案 惠普Z230工作站6700元
    （中關村在線廣州辦事處）HP Z230 Tower是一款入門級的塔式工作站，這款工作站配備完善的基礎硬體方案，能夠有效幫助用戶提高專業工作效率，緊湊的外觀設計則帶來了更為靈活的部署方案。最近這款工作站在商家「廣州宇飛信息技術有限公司」處僅售6700元促銷，感興趣的朋友可直接聯繫商家詳詢。
  • 擁有一臺6萬元的攀升遊戲工作站是什麼體驗?
    攀升遊戲工作站創新的解決方案，完美地將桌子和主機整合在一起。「桌」而不凡，重新定義奢華性能電腦。高端奢華配置攀升遊戲工作站機箱與桌子融為一體的方案如此炫酷，配置固然也十分出眾。我們提供高度定製化服務，可以根據具體需求制定專屬配置方案。最高選配可以提供10980XE+雙路RTX 2080Ti的全分體水冷方案，所有用料均選用國際一線品牌的頂尖型號，只為提供頂級的用機體驗。
  • 曙光高性能計算解決方案:物理化學領域
    計算化學的主流計算軟體有Gaussian、GAMESS、QChem、ADF、NWChem等。計算材料主要研究周期性結構的物理體系，計算方法較多，比如基於電子密度泛函數理論（DFT）的第一性原理計算方法。主流的計算軟體有VASP、Materials Studio、PWScf、Abinit、CPMD、ATK、Wien2K、Siesta、Octopus等。
  • Materials Studio教程(十三):磁性計算
    能對磁場作出某種方式反應的材料稱為磁性材料。
  • 5月Materialsstudio在材料吸附研究中應用
    ​​​點擊下載【PDF蓋章通知】 　　培訓時間：2018年月5月29-31日(周二至周四) 　　培訓地點：蘇州創騰科技培訓中心(江蘇省蘇州市工業園區東長路88號2.5產業園A2棟301室) 　　►培訓主旨： 　　本次培訓班課程以Sorption模塊應用講解為主，DMol3、Forcite Plus模塊應用講解為輔，旨在幫助用戶完成材料吸附的全面
  • 全模塊戰神 惠普旗艦級Z840工作站評測
    這是惠普針對工作站提出的全新SSD解決方案，通過將存儲從SATA升級到PCIe，可以獲得超過1GB/s的讀取速度，達到SATA SSD兩倍的性能。　　從技術來說，HP Z Turbo硬碟卡採用了MLC NAND快閃記憶體技術，支持TRIM命令，採用了PCIe Gen2 x4接口，本次測試的產品容量為256GB，用戶更可以選擇512GB的大容量產品。
  • 地表最強移動圖形工作站 ThinkPad P53評測
    在移動工作站中，ThinkPad自然不會缺席，今天我們就來聊一款ThinkPad P53移動圖形工作站。，ThinkPad P53提供了三種屏幕方案，分別是FHD/300尼特/100% sRGB IPS面板、4K UHD/500尼特/100% AdobeRGB IPS面板和4K UHD/400尼特/100% DCI-P3 OLED面板，三種屏幕都是15.6英寸。
  • 電磁仿真(HFSS、CST、FEKO)時域頻域精準配置推薦2019
    一．電磁仿真計算特點與硬體配置分析1.2 對並行計算求解過程分析如何配置CPU要根據求解過程和算法特點，尤其要了解時域、頻域兩大算法特點緊密結合，這樣才能更高效更合理，從並行求解流程圖看，循環計算過程是單核和多核交叉過程。
  • 工作站和臺式機的區別有哪些?Precision 3630給你解答
    工作站又能夠實現哪些臺式機無法實現的功能？其實簡單來說，工作站是一種高端的通用微型計算機，其配置性能都為高效運作而服務。隨著科技的發展，企業運行所需的配置越來越高，工作站也逐漸成為大多數中小企業的標配，對工作站感到好奇的你，不妨來了解一下專業的戴爾塔式工作站——Precision 3630。