沒有任何國際標準或法規規定護照封面顏色的選擇。國際民航組織ICAO在9303號文件中對護照的尺寸、格式、字體、字號給出了建議，但是並不涉及封面顏色。
護照封面的顏色由發行國家自主確定，但是各國普遍都在四種顏色中進行選擇：藍色，紅色，綠色與黑色，選擇的原因大致有如下幾種：
有一些地區性的組織、聯盟建議在內部保持護照顏色的統一。
比如，目前歐盟成員國（除克羅埃西亞外）都使用酒紅色（歐盟官方稱之為勃艮第紅Burgundy Red）作為護照封面的顏色。
早在1981年，歐盟的前身「歐洲共同體」就做出了在內部統一護照顏色為酒紅色的建議，但各國護照顏色的統一經歷了漫長的時間。德國在1988年放棄了綠色護照，義大利在1998年也從綠色改為酒紅色，愛沙尼亞、波蘭、捷克則分別在2000年，2001年、2002年從藍色改為了酒紅色。
目前唯一的例外是克羅埃西亞，克羅埃西亞在2013年加入歐盟時決定不採用歐盟標準色，這主要是為了保持傳統：克羅埃西亞自1991年宣布獨立後，護照顏色一直是藍色。
克羅埃西亞護照依然採用藍色封面
曾經是歐盟一員的英國自1921年起就一直採用藍色作為護照封面，但是在加入歐盟後採用了歐盟統一的酒紅色。2020年決定脫歐之後，甚至在還沒有與歐盟籤訂正式脫歐協議的情況下，喜歡保持傳統的英國便迫不及待的恢復了傳統的藍色護照封面。
脫歐前後的英國護照封面對比
除了歐盟國家外，一些期望加入歐盟的國家，例如土耳其，北馬其頓和阿爾巴尼亞，護照顏色也「提前」改為了酒紅色。
安第斯國家共同體包括玻利維亞，哥倫比亞，厄瓜多和秘魯四個南美洲西北部的國家，他們的護照顏色統一是酒紅色。
南方共同市場是一個以南美洲東南部國家參與為主的自由貿易區，其成員巴西，阿根廷，巴拉圭，烏拉圭都採用藍色封面的護照。
如何按照地域來看，美洲國家對於藍色似乎較為偏愛。在加勒比海周邊有15個國家採用藍色作為護照封面。南美洲也有不少國家採用藍色，如之前提到的南方共同市場國家的巴西，阿根廷，巴拉圭，烏拉圭。北美洲的兩個國家加拿大和美國都是藍色護照。
雖然美國目前的護照封面是藍色，但是在歷史上，美國護照顏色曾經多次改變。1926年，美國護照採用了紅色封面，到1941年改為綠色，一直使用了35年。1976年，美國護照第一次改為藍色，這是為了紀念建國200周年，在封面上還有「Bicentennial（二百周年紀念） 1776-1976 」的字樣。但是在1993年，美國護照又變回綠色；在1年後的1994年，美國護照變回藍色並保持至今。
美國1926版護照 紅色封面
美國1941版護照 綠色封面
美國1976版護照 第一次使用藍色封面
美國1993版護照 綠色封面
自1994年至今，美國護照一直使用藍色封面
採用紅色作為護照顏色的國家是最多的，約為70個。其中，多數國家採用暗紅色，比如中國，日本，瑞典等國家；但也有少數國家採用了鮮豔的紅色，如新加坡，瑞士。
伊斯蘭國家的護照多傾向於使用綠色作為封面，比如沙特，埃及，巴基斯坦等，因為綠色是自然和生命的象徵。
當然，這不是絕對的，比如約旦、科威特等國就採用了藍色的護照封面。
採用黑色作為護照封面的國家較少，有幾個非洲國家，比如安哥拉，馬拉威等。大洋洲的紐西蘭也採用黑色，因為紐西蘭對黑色情有獨鍾，比如國家隊隊服常常選擇黑色作為隊服色，紐西蘭航空的飛機也以黑色作為主色調。
在以上四種顏色以外，也有極少數國家選用了其他顏色，比如挪威2020版最新護照就選用了橙色作為封面。
各國沒有選擇黃色、棕色的原因可能是和封面上的燙金文字顏色過於接近，難以分辨；而不採用白色或其他淺色的原因是因為淺色太容易弄髒。