伊姆霍特普還曾用託夢和解夢的方法醫治遭受病痛折磨的人，被奉為人和神共同的醫生。他使用魔法治病時都十分謹慎，只在幫助人們增強信心與病魔抗爭時才使用。他認為學識只有實際運用才能體現其真正的價值，知識應該用來造福大眾。他這樣想，也是這樣做的，因此深得古埃及人的尊敬與愛戴。
據考證，現存最早的醫學文獻《埃德溫·史密斯外科紙草書》就出自伊姆霍特普之手。雖然文中記錄有一些符咒性的語言，但是其對頭部和脊椎損傷的治療與護理的描述，對於醫學史的研究是非常有價值的。
伊姆霍特普去世後葬於他的出生地孟菲斯，靠近國王的陵墓。他被奉為神聖，尊為「太陽和光明之神」，名字刻在約瑟法老雕像的基座上。他被塑成不同的形象，早期像一位普通人，後來變成了一位手持莎草紙的聖人，晚期成了一位帶有神像符號的蓄鬚神聖。他的陵寢成了人們獲取靈丹妙方的朝聖之地，孟菲斯更是成了人們祭拜他的中心地點。在供奉伊姆霍特普神像的寺院中，醫生們在行醫之前要來這裡接受職業培訓，對神像進行膜拜。
隨著時間的推移，伊姆霍特普的聲譽與日俱增，一代超過一代。人們修建了更多的寺院供奉他，越來越多的患者湧向他的神殿。於是，伊姆霍特普一躍成為埃及王國的醫神。後來，統治埃及的希臘人把伊姆霍特普視為自己的醫神，將其與古希臘醫神埃斯科拉庇俄斯（Aesculapius）融為一體，稱作伊姆特斯-阿斯克勒庇俄斯（Imuthes-Asklepios）。
伊姆霍特普的醫生生涯大致分為三階段：第一階段為作為約瑟法老的王宮御醫階段；第二階段為作為醫生的半神半人階段；第三階段為作為醫神的階段。在古埃及人的心中，伊姆霍特普可以包治百病，甚至能夠守護亡者的靈魂。
從目前對古埃及醫學的研究來看，古埃及的醫學既非純粹的迷信，也非所謂的科學，他們將巫術與醫術視為兩種完全不同的學科，但又希望通過結合來達到更高的效果。