《我的英雄學院》主要劇情為講述了在超人背景下的少年經過不斷的磨礪最終成長為出色英雄的故事。劇情背景方面，漫畫中所有超能力的始發地在中國四川肇慶市，以一則會發光的嬰兒為第一例案件，由此慢慢揭開了世界各地不斷有人覺醒超能力的案件發生，以致於在當時的漫畫時代中全球有百分之八十的人都有超能力，漫畫稱為——「個性」。由於覺醒「個性」的人類日益增多，其中不乏有心術不正的人也覺醒了「個性」並成為罪犯。為了保護社會的平穩，「英雄」開始成為一種職業登上了現實的舞臺。
綠谷出久
主人公——綠谷出久是一位希望成為英雄的普通人，對於「英雄」有著無比執念的他，幻想著自己能夠成為世界第一的英雄「歐爾麥特」一般的存在。因為在周圍的人都覺醒「個性」的時候自己仍未覺醒超能力這一事實，以及從小要好的夥伴——爆豪勝己所擁有的爆炸個性深深地打擊著他，導致綠谷在性格方面有些自卑，經常愛哭鼻子。
爆豪勝己
在一次在返家途中，綠谷不幸遭遇「敵人」——淤泥怪，被路過的「英雄」——歐爾麥特所解救，然而逃跑的淤泥怪又劫持了自己的好友——爆豪勝己。由於「敵人」的個性非常難纏，導致現場的不少「英雄」暫時都無計可施。在朋友危難之際，綠谷忘記自己沒有「個性」的事實獨自衝上去解救好友，也因此感動了歐爾麥特。歐爾麥特看到綠谷身上所擁有的英雄潛質，決定將自己的個性「One For All」傳給綠谷。由於「One For All」對身體承受能力要求過高，因此綠谷也開始了嚴酷的身體訓練，終於在「雄英」高中入學考試當天完成了訓練並完成了「個性」的繼承。
歐爾麥特
由於獲取時間過短，還沒等綠谷掌握「One For ALL」的用法就開始了考試，考試的內容是在模擬演習場對戰由機械所組成的假想「敵人」，戰勝不同的假想敵可以獲取考試分數。在別人都在不斷打倒敵人獲取分數的時候，綠谷卻因為不知道如何戰鬥一直是零分。此時出現了巨大的「零分」假想敵，並困住了考試入場前幫助過綠谷的麗日御茶子，在他人的生命遭受威脅的時候，綠谷再一次選擇了挺身而出，擊敗了「零分」假想敵，由於無法掌握「One For All」個性的原因，導致全身骨折，最終還是以零分結束了考試。由於存在特殊評價的「救助他人」而獲得六十分，最終使得綠谷順利進入「雄英」高中。
通過在「雄英」高中裡不斷地學習，由此來訓練學生們對於自己「個性」的控制。在災害實驗室（USJ）的訓練中，「敵聯盟」透過學校漏洞打算打敗有著「和平的象徵」的歐爾麥特，然而歐爾麥特因為路見不平幫助他人用光了自己的個性時間，導致不在現場，失意的「敵聯盟」撲了一個空，開始轉變目標對學生們下手，將學生與「敵人」分散在場館的各個角落進行戰鬥。千鈞一髮趕到現場的歐爾麥特使出全力將敵人「腦無」打飛後耗光了全部精力，在被其他「敵人」盯上的時候被綠谷成功拖延時間，其他教師也趕到現場擊退了「敵聯盟」並救出了學生們。由此第一季的內容結束。
歐爾麥特與他的學生們
在災害實驗室（USJ）事件過後沒有多久，經歷過與「敵聯盟」生死較量的雄英學生們又迎來了一年一度的「雄英體育祭」。在體育祭當天第一個項目為「障礙賽跑」，規則為只要在賽道內可以使用任何手段進行比賽，而在最後的地雷障礙賽跑中，綠谷巧妙的運用了機器人的裝甲，利用地雷爆炸的動力完成了反超爆豪勝己以及同班的轟焦凍獲得了第一名。
「雄英」高中一年A班的女學生們
在第二場「騎馬戰」中，在第一場獲得超高積分的綠谷成為了眾矢之的，最後在與常暗、麗日等人的幫助下勉強晉級；第三場「個人戰」中，綠谷在與同班同學轟焦凍對戰中，為了說服對方的戰鬥方式不惜過度傷害自己的身體從而解放所有的力量，最終雖然成功說服轟焦凍，但綠谷自身受到了嚴重的傷害並留下了傷疤。最終爆豪與轟焦凍的對戰中，由於轟焦凍沒有使用全力，最後體育祭以爆豪的勝利結束，但爆豪卻因為轟焦凍未使出全力而耿耿於懷。
綠谷對戰轟焦凍
經歷過體育祭之後的戰鬥，大家開始進入事務所開始進行實習生活，綠谷方面由於無法熟練掌握個性「One For All」而接受歐爾麥特班主任「格蘭特力諾」的特訓。因為班長——飯田天哉的哥哥被「英雄殺手」所傷害，為了代替哥哥報仇，飯田來到了「英雄殺手」所在的保須市進行實習。在一次「敵人」進行襲擊事件的時候，飯田遇到了「英雄殺手」並遭遇危機，在千鈞一髮之際，綠谷與轟焦凍成功解救班長飯田，最終幾人合力戰勝了「英雄殺手」並平安返回學院。
御茶子 綠谷出久 爆豪勝己 飯田天哉
在返回學院之後的救援訓練中，歐爾麥特發現綠谷的個性掌握十分突出，便告訴了綠谷「One For All」背後的秘密以及與另一種個性「All For One」的關係,表明了自己的能力就是為了打敗對方的存在，最後歐爾麥特仿佛還在隱瞞自身的秘密。在期末考試中，綠谷與爆豪兩人分到一組對戰歐爾麥特，最終兩人解開了長久以來的隔閡，兩人攜手合作通過了考試。最後劇情為即將到來的合宿篇埋下伏筆，第二季也在此落下帷幕。
「雄英」高中一年A班全員