綜合臺媒報導，臺灣地區領導人蔡英文上任後力主潛艇自造，一位陳水扁時代的「國安」人士透露，2001年，時任美國總統小布希宣布軍售臺8艘潛艇，其間過程曲折，而蔡英文當年也是赴美爭取美國售臺潛艇的小組成員。
這位前「國安」人士首度透露，在陳水扁時期，蔡英文是陸委會主委，屬於「國安」團隊一員，曾參與爭取軍售潛艇秘辛。他指出，陳水扁要臺當局防務部門提出軍購需求，由於當時「國安會秘書長」莊銘耀是臺海軍出身，所以軍方將潛艇列為第一優先採購項目。
陳水扁派出的赴美成員，包括扁辦主任馬永成、國安會」副秘書長張榮豐、陸委會主委蔡英文，此外，現任臺灣「駐美代表」蕭美琴，「國安會」諮詢委員郭臨伍，也是成員，由此見蕭美琴很早就涉入軍售事務。
據了解，臺方最初提出18艘潛艇的採購需求，平時6艘維修整補，6艘在基地，另6艘在海上執行戰備任務，一旦遇臺海防衛作戰則增加到10艘作戰，但美方已不做傳統潛艇，而且美國國務院與國會都有阻力，因此談判過程反覆曲折，最終小布希總統同意，為表示慎重，美國在宣布的前一周，秘密派遣東亞事務主管派特森秘密來臺，到官邸向陳水扁簡報，但簡報那次，蔡英文沒參加。
不過，美方最後未並售臺8艘潛艇。
據了解，小布希之所以會同意，是因中美軍機在南海發生擦撞，大陸扣押迫降的美國軍機，小布希一氣之下，同意售臺潛艇。但待小布希氣消，他就反悔了，雖未收回，但並未履約賣潛艇給臺灣，而陳水扁當局編列特別預算採購潛艇，在「立法院」也未獲通過，這是臺美軍售罕見的案例。