羅漢魚是由多種美洲慈鯛雜交、改良、固化基因而來的，是多種血緣的「混血兒」，所以羅漢魚與「純正血統」這樣的字眼是根本無緣的。業界上將羅漢魚品種分為各種品系與種類，主要是根據羅漢魚一些相對穩定的特點。畢竟羅漢魚經過20多年的人工改良，個體之間有些差異還是相對明顯並且還算穩定的。
越來越多的魚友都選擇從羅漢魚苗開始養，是魚苗有什麼特殊的吸引力嗎？其實一般羅漢魚成魚價格都相對較高，魚苗的話不僅價格便宜，而且可以在飼養過程中發現很多驚喜，在遇到的困難中學到解決方法和知識。
能選購一尾優秀的羅漢魚苗是魚友們所期待的，決定苗子未來發展的最大因素是自身的基因，飼養環境只是誘發基因顯性化的輔助條件。最好的挑苗時機是2個月以內，最好1個多月左右，魚苗在2-3cm大小。這個階段是最好的灌苗時期，起不起頭很大程度上就看這個期間的飼養環境了，過了5，6cm再從魚商手裡混養缸撈出來，尤其是珍珠類的，很少有好表現的了。因為競爭太激烈，魚商成本因素，餵養頻率，每個魚苗能夠得到的營養、活動空間、休息環境都相對較差，在這種環境下，很難儲存蛋白質，起頭的。
羅漢魚苗的品種一般也是按品系劃分為珍珠苗、金花苗、德薩苗等，比較難辨別的有彩虹苗，幻彩苗，紅馬苗、黃金太歲苗、泰金苗、滿銀苗等。羅漢魚苗的品種辨別是有一定難度的，該有的品相魚友應該首先有所了解。大多數魚友對羅漢魚起頭率要求極高，雖然起頭並不是羅漢魚審美的唯一標準，但沒有起頭的羅漢魚往往對於魚友來說吸引力不大，所以如何挑選起頭率高的羅漢魚苗是重中之重，選苗建議選寬頭位的，而且身體建議厚度寬的，因為夠厚夠寬頭位的魚起的頭只要有一定的養功就能起一個大頭（前提：要保證魚是水頭，和不能是母魚，不過水頭母魚很罕見 ）。
1、從外部形態特徵挑選：
體型，要挑選體型短而寬的，魚只弧度要圓滿，體高與體長的比例最好為1:1-1:1.5；背鰭、尾鰭、臀鰭張開時，平整而有力，無明顯殘缺；尾柄要寬，背鰭要高，這樣的羅漢魚才有氣勢，而且長成優秀羅漢魚的概率也大。
體色，要選購底色淺，顏色鮮豔的，因為進口羅漢魚往往底色較淺，顏色鮮豔，但價格一般較貴，可根據實際情況選購。珍珠品系要選購體型好，珠點、亮片清晰的，墨斑最好從鰓部一直貫穿到尾部而無間斷。金花品系以單色系的品種比較多，身上幾乎沒有珠點、亮片，墨斑隨著成長也會漸漸褪掉，所以選購金花羅漢時，要選購顏色鮮豔的。如果是進口羅漢魚，往往出現體色發黑的現象，這是由於國內水質與國外水質方面差別較大，進口羅漢魚幼魚受水質影響，體色容易變黑。遇到這種情況也不必擔心，因為經過一段時間適應，體色會逐漸恢復正常。
頭型，要儘量選購最短、頭圓且飽滿的，並仔細觀察幼魚兩眼之間是否有一條清晰的頭線，在眼睛和鼻子往上一點的距離就可以看到明顯的凹陷處，其實這就是成魚起頭後，頭的下部凹進去的基部。每條魚苗都有不同之處，凹陷越明顯越好，這個需要多仔細觀察為好。因為羅漢魚起頭是從頭線以上部分開始隆起的，頭線越清晰的幼魚，起頭的概率就越大。如發現頭部顏色明顯深於整體顏色，且有明顯呈魚鱗狀褶皺，頭頂的魚鱗顏色更深的，證明此魚曾經起過明顯的水頭，因環境變化造成了縮頭。此類幼魚應為選購的重點，只要在飼養過程中精心調理，就會在很短的時間內長出明顯的水頭。
狀態，要選購個頭稍大、眼睛明亮、不怕人的。因為個頭稍大證明它很健康。體質強壯，在與其他魚爭搶食物的時候處於上風。同時要選擇眼睛如寶石般清澈的幼魚，如果選購時發現羅漢魚的眼睛沒有神色，無論其他方面如何出眾也不建議選購。有魚友選購非常注重「緣分」，如果羅漢魚有一雙會說話的眼睛，能和你交流，你會認為和這尾魚投緣。
2、不同規格幼魚的選購
5釐米，幼魚各部特徵不十分明顯，在選購時具有一定難度，應注意，身上閃耀的珠點較多的為佳；身體兩側墨斑鱗線要清晰、明顯；身體較高、較圓、身材比例適當的；身體無畸形，各鰭無缺損。
6-10釐米，標準和5釐米的基本相同，只不過這時期的魚只墨斑鱗線、珠點、身形及頭型特點明顯。尤其是珍珠品系的羅漢魚，生長速度較快，額珠特別明顯。而花角品系和金花品系羅漢魚，在此階段生長較慢，額珠相對於珍珠品系的來說也小一些，但長大後，花角品系和金花品系羅漢魚的頭型和身形則生長較快，額珠隆起也較大。
11-15釐米，此階段羅漢魚特徵更為突出，魚兒開始出現繽紛的色彩；墨斑能明顯看出是單排還是雙排；墨斑周圍的銀線也能明顯看出。此時可通過頭型、身形和珠點發布來大體分辨品質的好壞。這個階段雌魚背部前端的墨斑已經很明顯，而雄魚則沒有墨斑，通過這點可以分辨羅漢魚的雌雄。
3、羅漢魚苗選購簡介
珍珠羅漢魚苗：珍珠系羅漢的典型特點是地包和凸眼，珍珠苗可以明顯地觀察到這一特點，只因程度不同會有所差別。額斑明顯，墨跡連貫（也有不連貫的）。珍珠魚苗的眼睛一般很少會是典型的紅色，基本為黃色或橙色，長大了會變為紅色。
金花羅漢魚苗：金花苗的分辨相對珍珠苗更具難度，一般都以眼睛的顏色來區分，金花系的魚苗一般為白眼，或者黃眼。這是最典型最容易區分的一個特點。此外，金花苗也可以看出金花系羅漢魚的典型特徵，即平眼、平嘴。幼苗期的金花體色較淺，墨斑較少。
德薩斯苗：德薩苗最直觀最典型的特徵是豐富絢麗的珠點分布，德薩苗一般體色很重，墨跡多連貫，分辨起來具有一定難度。德薩斯羅漢魚苗，大部分在退紗之前都是墨斑一條龍，墨跡多連貫，但是也有少數沒有墨斑的情況，甚至亮片也不均勻，我們可以看到嘴巴至頭頂的部分亮片寥寥無幾。德州豹，它的墨斑一般都會位於身子的中央位置，並且墨斑不是連貫著的，常是斷點，同時亮片非常整齊，在很小的時候頭頂處就有亮片。
紅馬羅漢魚苗：金花系基本就是金花和紅馬兩種很常見，紅馬魚苗最典型直觀的特徵就是無亮片、無額斑、墨跡一條龍，作為金花品系的一種，紅馬魚苗眼睛的顏色多為黃色；一般通過眼睛的顏色與墨跡即可辨認。紅馬羅漢魚苗有些會發紅，不過很少，一般都是灰色的，顏色很普通。
彩虹羅漢魚苗：墨斑不明顯，這個是重點，這也是與幻彩羅漢魚苗的最大區別。在苗期時可以看到顏色很鮮豔，尤其是上半身的紅色，出狀態紅的更突出。選彩虹羅漢魚苗不難，其實還是一樣的，先確認是否是金花，然後在苗期選顏色鮮豔（主要是前半身紅色），墨跡不明顯或沒墨斑的，這一點基本可以選出彩虹來的！
幻彩羅漢魚苗：這個和彩虹羅漢魚苗有點像，就墨斑明顯。首先確認是否是金花，同一個道理，前半身紅色，有明顯墨斑的就是幻彩羅漢魚苗。
泰金羅漢魚苗：泰金羅漢魚由雌性金花羅漢魚和雄性珍珠羅漢魚雜交培育出來，泰金金花羅漢魚遺傳了雌性金花羅漢魚的體型，雄性珍珠羅漢魚的體色。都有著金花系和珍珠系的特徵，但是更多的偏向於金花系，最明顯的特點就是豐富的亮片，一般為紅眼，也有白眼。
滿銀羅漢魚苗：滿銀最大的特點就是亮片豐富，全身亮片發白色或者發藍色，典型的滿銀眼睛必須為紅色，但是現在也多有白眼滿銀的出現，有人稱之為滿銀金花。
鴻運的區分方法：前半身發紅色，後半身發白色過淺色，最正宗的鴻運身上是沒有任何珠點的，但由於羅漢本身是雜交魚，並不可能每條都如此完美，所以，身上帶有少許的珠點，而且前半身紅後半身白，都歸類於鴻運級別，但是如果全身有珠點的，或者有拉線的，都應該歸類於珍珠猴子、馬騮。
鴻運是珍珠裡面的個體，是一個級別。是不存在魚苗的，因而沒法在魚苗時區分。鴻運屬於珍珠，但不是每個珍珠苗都可以長成鴻運，至少要4釐米才能區分。全世界（特別是中國）對泰國的珍珠亞成的需求量，是非常巨大的，所以泰國人並不出售珍珠苗，他們自己都供不應求。所以在國內，除了滿銀苗和部分重金屬苗，其餘的珍珠系的魚苗，幾乎不可能是進口的。因此鴻運沒有苗，更沒有所謂的泰國進口鴻運苗。