一般來說，板式換熱器的清洗可分為兩種類型，目前比較普遍的清洗方法是現場清洗，一種是分段清洗。現場清洗，顧名思義，是指在線清洗，換句話說，不需要拆卸設備，可以延長使用壽命，而對於板式換熱器，主要採用化學清洗，主要方法是反衝洗。
板式換熱器清洗在清洗時，需要注意的是，清洗液體的流速要比正常的介質流速快一些，基本上要達到1.5倍左右才能有效果。另外，在清洗完畢之後，為了避免清洗液體停留在設備內部，注意要用清水再置換一下，只有這樣等待清洗液完全排放出來才可以。另外，就是有很對板片是不鏽鋼的，因此在清洗的時候注意不要使用鹽酸清洗劑。末尾，在製作清洗溶液劑的時候，裡面的氯的含量不能超過0.0003。
板式換熱器清洗此外就是拆分清洗，顧名思義，指的就是將板式換熱器拆開進行清洗工作。因此在清洗時要注意的是，一定要等待設備完全冷卻之後進行拆卸，在處於熱狀況時不能拆開，還有就是板片的清洗需要輕輕地擦拭，不可以太用力，或者鋼絲的刷子來刷洗，不然容易損壞板片和膠條。
而且和化學清洗一樣，在線清洗完板材和膠條後，要注意用清水再次衝洗，因為它們的下部容易產生灰塵，即使反覆清洗也是必須的。假如膠片結垢較厚，則需單獨衝洗，然後再進行重複清洗，在此過程中需要注意的是膠條在裝配時要保持乾淨，否則密封會出問題，也就是要按裝配順序進行。