Graphpad prism9介紹,如何繪製發表級別的圖

2021-02-20 生物空間站

全世界科學家選擇的工具
來自 110 個國家/地區的超過 75 萬名科學家在Prism的幫助下與世界分享他們的研究結果。「 Prism 是市場上易於使用的非線性回歸分析軟體,繪圖選項一流!」加入Graphpad繪圖交流群,一起學習繪圖!Graphpad prism9是一款非常好用的且功能清大的科研醫學生物數據處理繪圖軟體,Prism也是一種多功能的統計工具。官網:https://www.graphpad.com/scientific-software/prism/可以從官網獲取Free Trial試用,也可以購買,也可以.(不用我說了吧)其實,Graphpad也是有中文官網的(https://www.graphpad-prism.cn/),那接下來,我們來了解了解Graphpad Prism9,以及它能幹些什麼呢?節省統計分析的時間:專為科學家(而非統計學家)設計的多功能統計工具。直接將數據輸入專為科學研究而設計的表格,並指導您進行統計分析,進而簡化您的研究工作流程,無需編碼。做出更準確、更明智的分析選擇:在每個步驟中獲取見解和指導,以便您在此過程中做出正確的分析選擇、理解基本假設並準確地解讀數據。更直觀地展示您的數據:Prism可讓您輕鬆地與同事協作、從同行那裡獲得反饋,並與全世界分享您的研究成果。Prism可以輕鬆地將數據轉換為簡潔優美的、達到出版質量的圖表;並提供多種自定義圖形(從色調搭配到如何組織數據)的方法;Prism支持導出幾乎任何格式的文件,也可直接從Prism發送郵件。繪製氣泡圖、火山圖、森林圖、小提琴圖、柱狀圖、散點圖、條形圖、生存曲線、熱圖等,常見的圖形幾乎均可繪製。而且還一鍵導出出版質量的圖形(300dpi)眾多的自定義圖形方法更直觀地展示您的數據,而不是操作軟體。Prism讓創建所需的圖形變得容易。選擇圖形類型,然後自定義任何部分 - 數據的排列方式、數據點的樣式、標籤、字體、顏色等等。自定義選項不盡其數。協作也有一定程度的加強,不僅限於分享您的圖表。Prism全面記錄您的數據,使您能夠與其他科學家有效進行協作。Prism項目的所有部分(原始數據、分析、結果、圖形和布局)都包含在一個單一的文件中,一次單擊即可完成共享。這樣,其他人就可以輕鬆同步您的工作,從而提高了結果的清晰度並簡化了協作過程。統計比較

配對或非配對 t 檢驗。報告 P 值和置信區間。

通過多重t檢驗分析自動生成火山圖(注意與P值的不同)。

非參數 Mann-Whitney 檢驗,包括中位數差值的置信區間。

用於比較兩組的 Kolmogorov-Smirnov 檢驗。

含中位數置信區間的 Wilcoxon 檢驗。

一次執行多個 t 檢驗,使用錯誤發現率(或 Bonferroni 多重比較)選擇哪些比較是需要進一步研究的新發現。

進行普通或重複測量方差分析,然後進行 Tukey、Newman-Keuls、Dunnett、Bonferroni 或 Holm-Sidak 多重比較檢驗,趨勢後驗或 Fisher 最小顯著性檢驗。

在不假設群體具有相同標準偏差的情況下,使用 Brown-Forsythe 和 Welch 方差分析進行單因素方差分析,然後進行適當的比較檢驗(Games-Howell、Tamhane T2、Dunnett T3)

許多多重比較測試都伴隨著置信區間和多重性調整的P值。

進行 Greenhouse-Geisser 校正,因此重複測量的單向、雙向和三向方差分析不必假設結果呈球形分布。選擇此項時,多個比較檢驗也不必假設呈球形分布。

含 Dunn 後驗的 Kruskal-Wallis 或 Friedman 非參數單向方差分析。

Fisher 精確檢驗或卡方檢驗。計算含置信區間的相對風險和優勢比。

對即使在某些後驗中仍缺少數值的數據進行雙向方差分析。

對一個或兩個因素進行重複測量的數據進行雙向方差分析。Tukey、Newman-Keuls、Dunnett、Bonferroni、Holm-Sidak 或 Fisher LSD 多重比較檢驗主要和簡單效應。

三向方差分析(限制在其中兩個因素中的兩個級別,和在第三個因素中的任意數量的級別)。

使用混合效應模型(類似於重複測量方差分析,但能夠處理丟失的數據),分析重複測量數據(單向、雙向和三向)。

Kaplan-Meier 生存分析。應用對數秩檢驗(包括趨勢檢驗)比較曲線。

使用嵌套 t 檢驗或嵌套單向方差分析比較嵌套數據表中的數據(使用混合效應模型)。

非線性回歸

擬合我們的 105 個內置方程式之一,或輸入您自己的方程式。現在包括生長方程族:指數生長、指數平臺、Gompertz、Logistic 和 beta(先增長後衰減)。

輸入微分或隱式方程。

輸入用於不同數據集的方程。

全局非線性回歸 – 在數據集之間共享參數。

強大的非線性回歸功能。

自動識別或消除離群值。

使用額外的平方和 F 檢驗或 AICc 比較模型。

比較數據集之間的參數。

應用約束。

通過幾種方法差分權重,並評估加權方法的效果。

接受自動初始估計值或輸入您自己的值。

在指定的X值範圍內自動繪製曲線圖。

使用參數 SE 或 CI 量化擬合精度。置信區間可為對稱性(傳統上)或不對稱性(更準確)。

應用 Hougaard 偏度量化不精確的對稱性。

繪製置信度或預測帶。

檢驗殘差的正態性。

運行或複製模型充分性檢驗。

報告協方差矩陣或依賴集。

從最佳擬合曲線中輕鬆插入數據點。

將直線擬合到兩個數據集,並確定交點和雙方斜率。

主成分分析Principal Component Analysis (PCA)多變量繪圖Multiple Variable Graphing列統計

計算描述性統計:最小值、最大值、四分位數、均值、標準差(SD)、標準誤(SEM)、置信區間(CI)、變異係數(CV)、偏度、峰度。

含置信區間的均值或幾何均值。

頻率分布(從 bin 到直方圖),包括累積直方圖。

通過四種方法進行正態性檢驗(新功能:Anderson-Darling)。

對數正態性檢驗,以及從正態(高斯)與對數正態分布中取樣的可能性。

創建 QQ 圖作為正態性檢驗的一部分。

單樣本 t 檢驗或 Wilcoxon 檢驗,用於對柱均值(或中位數)和理論值進行比較。

使用 Grubbs 或 ROUT 方法鑑別異常值。

分析批量 P 值,應用 Bonferroni 多重比較或 FDR 方法識別「重大」研究結果或發現。

簡易的線性回歸和相關性廣義線性模型(GLM)臨床(診斷)實驗室統計

Bland-Altman 圖。

受試者工作特徵(ROC)曲線。

Deming 回歸(II 型線性回歸)。

模擬其他計算

曲線下面積,含置信區間。

轉換數據。

標準化。

鑑別異常值。

正態性檢驗。

轉置表格。

減去基線(以及合併列)。

將每個值計算為其行、列或總計的分數。

3.那怎麼繪製想要的圖及進行統計分析呢?
①可以參考網絡
③我們公眾號也會持續更新一些繪圖教程,或許更適合各位科研人員,基於科研/Paper去繪製符合文章發表的圖。
1.https://go.graphpad.com/video/whats-new-in-prism-92.https://www.graphpad-prism.cn/prism.html

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