ImageJ數值化色譜圖

2021-02-08 Paper繪圖

導言

圖像具有一定的灰度數值,利用這個屬性我們可以將實驗圖片進行數值化,進而進行可視化,達到定性和定量的相結合,將其應用在論文中是一個不錯的選擇。

下圖是一張色譜條帶

我們需要將其做成下面的圖形放在論文中,該怎麼弄呢,趕緊來學學的吧!

軟體

FIJI 或ImageJ軟體,Origin2019b軟體

圖文教程

數據提取

1. 使用FIJI打開圖片(直接拖拽進去即可),這裡我使用的是原始圖


2.我們選擇第一條條帶進行演示,使用矩形工具進行框選擇第一條條帶,點擊菜單欄-Image-Crop,進行裁剪


3. 點擊左上角File-Save as另存為圖片備用


4. 使用直線工具畫一條直線在條帶上,然後雙擊直線工具,可以將線條調整的粗一點


5. 點擊直線分析,Analyze-Plot Profile


6. 在這裡就會出現一張類似的色譜曲線圖,其中左下角會有一些參數。點擊List,就會出現圖形的對應的數據,點擊Data你可以將數據保存在csv格式的文件中,點擊more你可以對橫縱坐標進行設置。這裡,我們將數據保存在csv文件中,以方便日後使用。



軟體作圖

1. 使用Origin進行作圖,將上述數據複製進來,寫好縱坐標,橫坐標是像素值,我們就不顯示了


2. 通過一系列基礎設置就如下所示


3. 進行導出圖即可


一鍵組圖

1. 使用AI/PS/Origin/PPT軟體,進行組圖,然後導出圖片即可

怎麼樣,今天的教程學會了嗎

心之所向,必能達成!

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    (軟體下載連結:https://en.softonic.com/download/imagej/windows/post-download)軟體下載解壓後可直接使用,還是先看一下ImageJ的界面,非常簡潔明了,有多種圖形和文字處理工具,可謂麻雀雖小五臟俱全。下面還是舉例說明軟體的常用功能。
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